| 摘要 | 第1-12页 |
| Abstract | 第12-18页 |
| 缩略词表 | 第18-20页 |
| 第一章 研究背景及立题依据 | 第20-42页 |
| ·研究背景 | 第20-39页 |
| ·海洋生态环境及其氮循环机制 | 第20-22页 |
| ·蛋白酶的定义及分类 | 第22-23页 |
| ·丝氨酸蛋白酶 | 第23-30页 |
| ·胶原蛋白与胶原蛋白酶 | 第30-39页 |
| ·立题依据与研究内容 | 第39-42页 |
| ·立题依据 | 第39-40页 |
| ·研究内容 | 第40-42页 |
| 第二章 丝氨酸蛋白酶deseasin MCP-01识别和降解胶原蛋白的分子机制研究 | 第42-70页 |
| ·引言 | 第42-43页 |
| ·材料和方法 | 第43-50页 |
| ·菌株及质粒 | 第43页 |
| ·主要药品和试剂盒 | 第43-44页 |
| ·主要仪器设备及耗材 | 第44-45页 |
| ·培养基的配制 | 第45页 |
| ·菌株的培养与保藏 | 第45-46页 |
| ·常用软件、数据库及在线网址 | 第46页 |
| ·突变体构建及蛋白酶的异源表达和纯化 | 第46-47页 |
| ·蛋白酶活性测定 | 第47-48页 |
| ·AFM观察MCP-01及突变体蛋白对牛I型不可溶胶原蛋白的降解过程 | 第48页 |
| ·MCP-01及突变体蛋白对胶原蛋白纤维中关键交联作用的破坏 | 第48-49页 |
| ·MCP-01催化结构域对可溶胶原蛋白分子的降解 | 第49页 |
| ·MCP-01催化结构域在牛I型不可溶胶原蛋白肽链上的酶切位点分析 | 第49页 |
| ·底物结合口袋中影响MCP-01降解胶原蛋白位点偏好性的关键氨基酸分析 | 第49-50页 |
| ·结果与分析 | 第50-67页 |
| ·MCP-01对牛I型不可溶胶原蛋白降解过程的AFM观察 | 第50-52页 |
| ·MCP-01催化结构域对胶原蛋白纤维中关键交联作用的破坏 | 第52-53页 |
| ·MCP-01催化结构域的晶体结构解析 | 第53-54页 |
| ·MCP-01催化结构域对可溶胶原蛋白分子的降解 | 第54-56页 |
| ·MCP-01与Subtilisin Carlsberg的分子结构比较 | 第56-57页 |
| ·MCP-01催化结构域识别和降解胶原蛋白底物的分子机制 | 第57-62页 |
| ·MCP-01催化结构域在牛I型不可溶胶原蛋白肽链上的酶切位点分析 | 第62-66页 |
| ·底物结合口袋中影响MCP-01降解胶原蛋白位点偏好性的关键氨基酸分析 | 第66-67页 |
| ·讨论 | 第67-70页 |
| 第三章 深海沉积物细菌Myroides profundi D25分泌的蛋白酶myroicolsin的分离纯化及酶学性质研究 | 第70-82页 |
| ·引言 | 第70页 |
| ·材料及方法 | 第70-74页 |
| ·菌株 | 第70页 |
| ·主要药品和试剂盒 | 第70-71页 |
| ·主要仪器设备及耗材 | 第71页 |
| ·培养基的配制 | 第71页 |
| ·菌株的培养及保藏 | 第71页 |
| ·蛋白酶myroicolsin的分离纯化 | 第71-72页 |
| ·蛋白酶myroicolsin的酶学性质测定 | 第72-74页 |
| ·结果与分析 | 第74-81页 |
| ·蛋白酶myroicolsin的分离纯化 | 第74-77页 |
| ·蛋白酶myroicolsin的底物特异性分析 | 第77-78页 |
| ·温度、pH和盐度对myroicolsin胶原酶活的影响 | 第78-79页 |
| ·金属离子和蛋白酶抑制剂对myroicolsin胶原酶活的影响 | 第79-81页 |
| ·讨论 | 第81-82页 |
| 第四章 蛋白酶myroicolsin的基因克隆、序列分析及结构域功能的研究 | 第82-102页 |
| ·引言 | 第82页 |
| ·材料与方法 | 第82-90页 |
| ·菌株及质粒 | 第82-83页 |
| ·主要药品和试剂盒 | 第83页 |
| ·主要仪器设备及耗材 | 第83页 |
| ·培养基的配制 | 第83页 |
| ·菌株的培养与保藏 | 第83页 |
| ·常用软件、数据库及在线网址 | 第83-84页 |
| ·蛋白酶myroicolsin的基因克隆及序列分析 | 第84-88页 |
| ·蛋白酶myroicolsin结构域功能的研究 | 第88-90页 |
| ·结果与分析 | 第90-100页 |
| ·蛋白酶myroicolsin的基因克隆及序列分析 | 第90-96页 |
| ·蛋白酶myroicolsin结构域功能的研究 | 第96-100页 |
| ·讨论 | 第100-102页 |
| 第五章 蛋白酶myroicolsin对胶原蛋白降解机制的研究 | 第102-120页 |
| ·引言 | 第102页 |
| ·材料和方法 | 第102-105页 |
| ·菌株 | 第102-103页 |
| ·主要药品和试剂 | 第103页 |
| ·主要仪器设备及耗材 | 第103页 |
| ·常用软件、数据库及在线网址 | 第103页 |
| ·蛋白酶myroicolsin对牛I型不可溶胶原蛋白降解过程的电镜观察 | 第103-104页 |
| ·生化实验分析myroicolsin对胶原纤维中关键交联的降解 | 第104-105页 |
| ·蛋白酶myroicolsin在牛I型不可溶胶原蛋白肽链上的酶切位点分析 | 第105页 |
| ·结果与分析 | 第105-118页 |
| ·蛋白酶myroicolsin对牛I型不可溶胶原蛋白降解过程的电镜观察 | 第105-108页 |
| ·生化实验分析myroicolsin对胶原纤维中关键交联的降解 | 第108-111页 |
| ·蛋白酶myroicolsin对胶原蛋白三螺旋结构的降解 | 第111-112页 |
| ·蛋白酶myroicolsin在牛I型不可溶胶原蛋白肽链上的酶切位点分析 | 第112-117页 |
| ·S8家族细菌胶原蛋白酶降解胶原蛋白的机制模型 | 第117-118页 |
| ·讨论 | 第118-120页 |
| 第六章 弹性蛋白酶myroilysin对蛋白酶myroicolsin降解胶原蛋白的协同作用及其发酵条件优化 | 第120-132页 |
| ·引言 | 第120页 |
| ·材料和方法 | 第120-122页 |
| ·菌株 | 第120页 |
| ·主要药品和试剂 | 第120-121页 |
| ·主要仪器设备及耗材 | 第121页 |
| ·培养基的配制及菌株培养和保藏 | 第121页 |
| ·蛋白酶myroilysin的分离纯化 | 第121页 |
| ·弹性蛋白酶myroilysin对蛋白酶myroicolsin降解胶原蛋白的协同作用 | 第121-122页 |
| ·蛋白酶myroilysin的发酵条件优化 | 第122页 |
| ·结果与分析 | 第122-129页 |
| ·蛋白酶myroilysin的分离纯化 | 第122-123页 |
| ·弹性蛋白酶myroilysin对蛋白酶myroicolsin降解胶原蛋白的协同作用 | 第123-124页 |
| ·蛋白酶myroilysin的发酵条件优化 | 第124-129页 |
| ·讨论 | 第129-132页 |
| 全文总结与展望 | 第132-136页 |
| 参考文献 | 第136-148页 |
| 在读期间论文发表、专利申请及获奖情况 | 第148-150页 |
| 致谢 | 第150-152页 |
| 附录 | 第152-179页 |
| 附表 | 第179页 |
