基于RNA测序技术的转录组从头拼接算法研究

摘要	第1-9页
ABSTRACT	第9-12页
第一章 背景知识	第12-24页
1 .1 分子生物学基础	第12-15页
·第二代测序技术	第15-19页
·测序片段的拼接	第19-20页
·转录组拼接问题	第20-24页
第二章 拼接算法的研究现状	第24-40页
·基因组拼接算法	第24-27页
·基于参考基因组的转录组拼接算法	第27-29页
·转录组从头拼接算法	第29-31页
·改进转录组从头拼接算法的必要性	第31-36页
·讨论和总结	第36-40页
第三章 Bridger：新的转录组从头拼接算法	第40-64页
·拼接前的考虑	第40-42页
·算法的创新点	第42-50页
·Bridger算法	第50-56页
·算法的细节补充	第56-64页
第四章 Bridger的测评	第64-78页
·测试数据和评价标准	第64-67页
·与其他拼接算法的比较	第67-72页
·Bridger的优缺点	第72-74页
·参数k的选择	第74-78页
第五章 应用和展望	第78-88页
·Bridger应用	第78-80页
·Bridger的下游分析	第80-82页
·今后的研究方向	第82-85页
·总结	第85-88页
参考文献	第88-96页
致谢	第96-98页
攻读博士学位期间完成论文情况	第98-99页
学位论文评阅及答辩情况表	第99页