| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-16页 |
| ·研究背景 | 第10-11页 |
| ·蛋白质相互作用 | 第11-12页 |
| ·国内外研究现状与本文主要工作 | 第12-14页 |
| ·论文组织结构 | 第14-16页 |
| 第二章 相关理论和技术 | 第16-28页 |
| ·支持向量机 | 第16-22页 |
| ·最优分类面 | 第16-18页 |
| ·广义最优分类面 | 第18-19页 |
| ·核函数与特征空间 | 第19-21页 |
| ·支持向量机工具 libsvm | 第21-22页 |
| ·图论相关理论和技术 | 第22-27页 |
| ·蛋白质相互作用图和蛋白质平均重复度 | 第22页 |
| ·邻接矩阵 | 第22-24页 |
| ·简单图的最大匹配 | 第24-27页 |
| ·本章小结 | 第27-28页 |
| 第三章 蛋白质相互作用数据库与数据集构造 | 第28-42页 |
| ·蛋白质相互作用数据库 | 第28-29页 |
| ·DIP—蛋白质相互作用数据库 | 第29-30页 |
| ·常用的负数据集构造方法 | 第30-34页 |
| ·k-lets 方法构造负数据集 | 第31-32页 |
| ·随机方法构造负数据集 | 第32页 |
| ·亚细胞定位方法构造负数据集 | 第32-33页 |
| ·基于蛋白质相互作用图顶点距离构造负数据集 | 第33-34页 |
| ·基于蛋白质相互作用图顶点距离和最大匹配构造数据集 | 第34-40页 |
| ·第一类蛋白质数据集构造 | 第35-38页 |
| ·第二类蛋白质数据集构造 | 第38-40页 |
| ·本章小结 | 第40-42页 |
| 第四章 蛋白质序列编码 | 第42-57页 |
| ·序列编码算法 | 第42-49页 |
| ·三联体编码算法 | 第42-43页 |
| ·局部描述符编码算法 | 第43-45页 |
| ·自协方差编码算法 | 第45-47页 |
| ·伪氨基酸编码算法 | 第47-49页 |
| ·数据集编码 | 第49-56页 |
| ·本章小结 | 第56-57页 |
| 第五章 实验结果及分析 | 第57-63页 |
| ·实验说明 | 第57-58页 |
| ·实验结果及分析 | 第58-62页 |
| ·负数据集中的蛋白质平均重复度对预测精度的影响 | 第60页 |
| ·正数据集中的蛋白质平均重复度对预测精度的影响 | 第60-62页 |
| ·编码效率分析 | 第62页 |
| ·本章小结 | 第62-63页 |
| 总结与展望 | 第63-65页 |
| 参考文献 | 第65-68页 |
| 攻读硕士学位期间取得的研究成果 | 第68-69页 |
| 致谢 | 第69-70页 |
| 附录 | 第70页 |