| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-15页 |
| 第一章 绪论 | 第15-25页 |
| ·课题研究背景 | 第15-19页 |
| ·锥虫与锥虫病 | 第15-16页 |
| ·T. brucei 生命周期 | 第16页 |
| ·T. brucei 细胞亚微结构特征 | 第16-19页 |
| ·T. brucei 线粒体蛋白质组研究现状 | 第19-21页 |
| ·课题研究目的及意义 | 第21-23页 |
| ·本文研究内容 | 第23-24页 |
| ·本章小结 | 第24-25页 |
| 第二章 布氏锥虫线粒体及其生物学特征 | 第25-35页 |
| ·引言 | 第25页 |
| ·T. brucei 线粒体特征 | 第25-29页 |
| ·kDNA 及其复制系统 | 第25-26页 |
| ·RNA 编辑 | 第26-27页 |
| ·线粒体翻译系统 | 第27-28页 |
| ·线粒体生物发生的调控 | 第28-29页 |
| ·T. brucei 线粒体基因组特征分析 | 第29-33页 |
| ·基因组特征 | 第29-30页 |
| ·蛋白质编码基因 | 第30-32页 |
| ·碱基偏好性分析 | 第32-33页 |
| ·kDNA 与核基因组的关系 | 第33-34页 |
| ·本章小结 | 第34-35页 |
| 第三章 布氏锥虫线粒体蛋白质的定位研究 | 第35-52页 |
| ·引言 | 第35页 |
| ·T. brucei 线粒体蛋白质的合成与分选 | 第35-39页 |
| ·线粒体基因编码的蛋白质 | 第35页 |
| ·核基因编码的线粒体蛋白质及其转运 | 第35-39页 |
| ·线粒体蛋白质定位的研究方法 | 第39-43页 |
| ·基于生物实验的定位研究方法 | 第39-41页 |
| ·基于生物信息学的定位研究方法 | 第41-43页 |
| ·基于序列相似性的线粒体蛋白质识别 | 第43-47页 |
| ·数据来源 | 第44-45页 |
| ·结果和讨论 | 第45-47页 |
| ·基于不同算法的线粒体蛋白质预测 | 第47-51页 |
| ·数据集 | 第47页 |
| ·方法及性能评价 | 第47-49页 |
| ·结果和讨论 | 第49-51页 |
| ·本章小结 | 第51-52页 |
| 第四章 基于特征选择的线粒体蛋白质识别 | 第52-75页 |
| ·引言 | 第52页 |
| ·支持向量机 | 第52-56页 |
| ·SVM 基本原理 | 第52-54页 |
| ·SVM 的参数选择 | 第54-56页 |
| ·LIBSVM | 第56页 |
| ·基于 SVM 的特征选择 | 第56-69页 |
| ·数据来源 | 第56页 |
| ·特征获取与分析 | 第56-63页 |
| ·特征选择 | 第63-66页 |
| ·基于 SVM 的混合特征选择 | 第66-69页 |
| ·结果分析和讨论 | 第69-74页 |
| ·模型构建及性能评价 | 第69-70页 |
| ·TMPP 性能分析 | 第70-74页 |
| ·本章小结 | 第74-75页 |
| 第五章 TMPP 应用及生物实验验证 | 第75-85页 |
| ·引言 | 第75页 |
| ·TMPP 在 T. brucei 全蛋白质组水平上的应用 | 第75-78页 |
| ·数据来源 | 第75页 |
| ·结果与分析 | 第75-78页 |
| ·亚细胞定位实验 | 第78-82页 |
| ·实验材料与方法 | 第78-79页 |
| ·实验结果和讨论 | 第79-82页 |
| ·近缘物种的应用 | 第82-84页 |
| ·数据集 | 第83页 |
| ·结果分析和讨论 | 第83-84页 |
| ·本章小结 | 第84-85页 |
| 第六章 布氏锥虫线粒体蛋白编码基因的表达调控分析 | 第85-105页 |
| ·引言 | 第85页 |
| ·基因表达与 RNA 剪接 | 第85-88页 |
| ·真核基因的表达 | 第85-87页 |
| ·RNA 剪接 | 第87-88页 |
| ·T. brucei 中的剪接机制 | 第88-93页 |
| ·SL 反式剪接 | 第88-90页 |
| ·SL RNA 的结构和功能 | 第90-91页 |
| ·参与剪接的 snRNA 及蛋白因子 | 第91-92页 |
| ·可变反式剪接 | 第92-93页 |
| ·T. brucei MitoCarta 的差异表达与剪接调控 | 第93-104页 |
| ·材料与方法 | 第94-95页 |
| ·实验结果与讨论 | 第95-104页 |
| ·本章小结 | 第104-105页 |
| 第七章 总结与展望 | 第105-108页 |
| ·论文主要工作及成果 | 第105-107页 |
| ·进一步研究展望 | 第107页 |
| ·结束语 | 第107-108页 |
| 参考文献 | 第108-116页 |
| 致谢 | 第116-117页 |
| 在学期间的研究成果及发表的学术论文 | 第117-118页 |