| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-61页 |
| 1 牛亚科的演化史及中国牛亚科各物种的起源与遗传多样性 | 第11-36页 |
| ·牛亚科的演化史 | 第11-16页 |
| ·牛亚科动物的分类与分布 | 第16-29页 |
| ·中国牛亚科家畜物种的起源驯化与遗传多样性 | 第29-36页 |
| 2 牛亚科物种遗传分化研究实验技术与理论工具 | 第36-61页 |
| ·牛亚科物种遗传分化研究实验技术 | 第37-49页 |
| ·物种遗传分化研究理论分析工具 | 第49-61页 |
| 第二章 牛亚科6 个家畜群体4 个基因的序列分析 | 第61-87页 |
| 1 材料与方法 | 第61-70页 |
| ·动物群体与样本采集 | 第61页 |
| ·试剂配制 | 第61-63页 |
| ·基因组DNA 提取和检测 | 第63-64页 |
| ·引物设计与PCR 扩增 | 第64-69页 |
| ·PCR 产物检测 | 第69-70页 |
| ·PCR 产物测序 | 第70页 |
| ·序列统计分析 | 第70页 |
| 2 结果与分析 | 第70-81页 |
| ·牛基因组DNA 提取结果检测 | 第70-71页 |
| ·PCR 扩增结果 | 第71-73页 |
| ·4 个结构基因核苷酸组成及分析 | 第73-78页 |
| ·基因编码区序列的核苷酸变异 | 第78-81页 |
| 3 讨论 | 第81-87页 |
| 第三章 4个结构基因多样性及基因流分析 | 第87-97页 |
| 1 材料与方法 | 第87-88页 |
| ·试验材料 | 第87-88页 |
| ·序列比对与多样性分析 | 第88页 |
| 2 结果 | 第88-94页 |
| ·6个牛种群体MSTN 基因的多样性水平 | 第88-90页 |
| ·6个牛种群体GH 基因的多样性水平 | 第90-91页 |
| ·6个牛种群体ADH 基因的多样性水平 | 第91-93页 |
| ·6个牛种群体Cyt b 基因的多样性水平 | 第93-94页 |
| 3 讨论与小结 | 第94-97页 |
| 第四章 基于4 个基因探讨6 个牛种群体的起源分化 | 第97-120页 |
| 1 材料与方法 | 第99-100页 |
| ·基因序列 | 第99-100页 |
| ·系统树构建 | 第100页 |
| 2 结果 | 第100-115页 |
| ·基于Cyt b 基因的系统树 | 第100-106页 |
| ·基于核基因的分子系统树 | 第106-113页 |
| ·合并3 个核基因数据构建系统树 | 第113-115页 |
| ·基于Cyt b 和核基因系统树间的比较 | 第115页 |
| 3 讨论 | 第115-120页 |
| 第五章 基于分化位点的牛亚科物种间遗传学鉴定技术 | 第120-125页 |
| 1 材料与方法 | 第121-122页 |
| ·序列分析与统计 | 第121页 |
| ·种属特异性引物设计 | 第121-122页 |
| ·PCR 扩增与条带检测 | 第122页 |
| 2 结果 | 第122-123页 |
| ·序列分析 | 第122页 |
| ·水牛属和牛属特异性鉴定 | 第122-123页 |
| 3 讨论 | 第123-125页 |
| ·群体多样性水平的影响 | 第123页 |
| ·牛亚科物种产（制）品的鉴定 | 第123-125页 |
| 结论 | 第125-126页 |
| 参考文献 | 第126-136页 |
| 致谢 | 第136-137页 |
| 攻读博士学位期间发表的学术论文目录 | 第137-139页 |