| 提要 | 第1-6页 |
| 第一章 绪论 | 第6-10页 |
| §1.1 引言 | 第6-8页 |
| §1.2 生物信息学的国内外发展现状和展望 | 第8-9页 |
| §1.3 本文的主要工作 | 第9-10页 |
| 第二章 序列分析和多序列比对算法概述 | 第10-16页 |
| §2.1 序列分析 | 第10页 |
| §2.2 序列比对 | 第10-16页 |
| 第三章 隐马尔可夫模型理论基础及其在序列分析上应用 | 第16-28页 |
| §3.1 隐马尔可夫模型的发展概况 | 第16页 |
| §3.2 隐马尔可夫模型基本思想 | 第16-28页 |
| 第四章 基于HMM的多序列比对 | 第28-36页 |
| §4.1 由多序列比对建立Profile HMMS | 第28-30页 |
| §4.2 自学习得到多序列比对 | 第30-36页 |
| 第五章 基于遗传和模拟退火算法的HMM参数估计算法 | 第36-44页 |
| §5.1 遗传算法 | 第36-38页 |
| §5.2 模拟退火算法原理 | 第38-39页 |
| §5.3 基于遗传和模拟退火算法的HMM参数估计算法 | 第39-43页 |
| §5.4 与其他参数估计算法的比较 | 第43-44页 |
| 参考文献 | 第44-46页 |
| 摘要 | 第46-49页 |
| Abstract | 第49-52页 |
| 致谢 | 第52页 |