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杨树感染溃疡病后microRNA的鉴定与表达分析

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-6页
缩略语表第6-9页
1 引言第9-21页
   ·杨树溃疡病的研究进展第9-11页
     ·溃疡病是制约杨树生长发育的重要病害第9-10页
     ·杨树溃疡病发病外界因素第10页
     ·杨树溃疡病致病相关生理研究第10-11页
     ·杨树抗感溃疡病的品种第11页
   ·MicroRNA的研究进展第11-18页
     ·MicroRNA的发现、产生及其生物学特征第11-12页
     ·MicroRNA的作用机制第12-13页
     ·MicroRNA及其靶基因的鉴定方法第13-14页
     ·植物逆境胁迫相关的miRNA第14-18页
       ·与干旱胁迫相关的miRNA第14页
       ·营养胁迫有关的miRNA第14-15页
       ·高温胁迫相关的miRNA第15-16页
       ·UV-B辐射胁迫相关miRNA第16页
       ·植物机械胁迫相关miRNA第16页
       ·与冷胁迫相关的miRNA第16-17页
       ·植物氧化胁迫有关的miRNA第17页
       ·植物病害相关的miRNA第17-18页
     ·杨树miRNA的研究进展第18页
   ·本研究立项依据与技术路线第18-21页
2 材料方法第21-30页
   ·溃疡病病原菌的活化第21页
     ·溃疡病病原菌第21页
     ·活化培养基的配置第21页
     ·溃疡菌的活化培养第21页
   ·供试接种的杨树材料第21页
   ·接种第21页
   ·材料保存第21-22页
   ·总RNA的提取和检测第22-23页
     ·改良后的CTAB法第22页
     ·DNAase酶处理第22-23页
     ·RNA定量第23页
     ·电泳检测第23页
   ·小分子RNA文库的构建和Solexa测序第23-24页
   ·Small RNA生物信息学分析第24-25页
   ·新miRNA靶基因的预测第25页
   ·miRNA差异分析表达第25页
   ·miRNA的qRT-PCR验证及溃疡病不同接种时间段的表达分析第25-30页
     ·植物材料第25页
     ·Small RNA的提取第25-26页
     ·小分子RNA的Poly(A)加尾第26-27页
     ·第一链cDNA合成和检测第27-28页
     ·qRT-PCR验证及miRNA在北京杨不同感病时间段的表达分析第28-30页
3 结果和分析第30-51页
   ·北京杨溃疡病接种第30页
   ·总RNA的提取第30-31页
   ·Solexa测序生物信息学分析第31-32页
   ·小RNA测序的长度统计分析第32-33页
   ·两个小RNA文库的共同和特异性统计第33页
   ·北京杨中保守miRNA第33-42页
   ·北京杨新miRNA的发现第42-43页
   ·Pbe-miR477c,pbe-miR482b,pbe-miR2111和新miRNA靶基因的预测第43-46页
   ·北京杨溃疡病相关miRNA的表达分析第46-47页
   ·荧光定量PCR表达分析第47-51页
     ·小RNA的提取第47-48页
     ·普通PCR验证第48页
     ·qRT-PCR第48-51页
4 讨论第51-54页
   ·北京杨溃疡病接种第51页
   ·北京杨候选新的miRNA第51-52页
   ·北京杨中的miRNAs和miRNA~*s第52页
   ·与病原反应有关的miRNAs第52-54页
5 结论与研究展望第54-56页
   ·结论第54-55页
   ·展望第55-56页
参考文献第56-63页
附图第63-71页
个人简介第71-73页
导师简介第73-75页
硕士期间发表或者已接受论文第75-77页
致谢第77页

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