| 摘要 | 第1-8页 |
| ABSTRACT | 第8-14页 |
| 第1章 绪论 | 第14-38页 |
| ·抗艾滋病药物的研究意义 | 第14-23页 |
| ·艾滋病的流行现状及治疗方法简介 | 第14-15页 |
| ·HIV 病毒结构及其生活周期 | 第15-19页 |
| ·抗艾滋病药物的研究进展 | 第19-23页 |
| ·计算机辅助药物设计的方法与基本原理 | 第23-28页 |
| ·基于配体的药物设计方法简介 | 第24-26页 |
| ·基于受体的药物设计方法简介 | 第26-28页 |
| ·分子对接方法简介 | 第28-31页 |
| ·药效团模型构建方法简介 | 第31-34页 |
| ·三维定量构效关系研究方法简介 | 第34-36页 |
| ·分子动力学模拟方法简介 | 第36-37页 |
| ·论文内容概述 | 第37-38页 |
| 第2章 基于配体和受体的三维药效团模型构建 | 第38-76页 |
| ·基于二酮酸类HIV-1 整合酶抑制剂的三维药效团模型构建 | 第38-61页 |
| ·整合酶的结构与功能及整合酶抑制剂的研究进展 | 第38-50页 |
| ·计算方法 | 第50-52页 |
| ·结果与讨论 | 第52-61页 |
| ·基于整合酶蛋白的三维药效团模型构建 | 第61-73页 |
| ·基于受体的药效团模型方法及基于整合酶的药效团研究进展 | 第61-65页 |
| ·计算方法 | 第65-67页 |
| ·结果与讨论 | 第67-73页 |
| ·基于配体的药效团模型与基于受体的药效团模型比较 | 第73-74页 |
| ·本章小结 | 第74-76页 |
| 第3章 二酮酸类HIV-1 整合酶抑制剂的QSAR 研究 | 第76-100页 |
| ·二酮酸类HIV-1 整合酶抑制剂的QSAR 研究进展 | 第76-77页 |
| ·计算方法 | 第77-85页 |
| ·研究体系 | 第77-81页 |
| ·二酮酸类抑制剂小分子的构建 | 第81-82页 |
| ·分子对接 | 第82页 |
| ·药效团模型构建、修正和评价方法 | 第82-83页 |
| ·分子叠合 | 第83-85页 |
| ·CoMFA 和CoMSIA 模型的产生 | 第85页 |
| ·结果与讨论 | 第85-97页 |
| ·药效团模型评价 | 第85-89页 |
| ·结合模式分析 | 第89-90页 |
| ·CoMFA 和CoMSIA 模型分析 | 第90-93页 |
| ·最佳模型的等势面图 | 第93-97页 |
| ·本章小结 | 第97-100页 |
| 第4章 用分子模拟方法研究HIV-1 整合酶突变体的耐药性机理 | 第100-116页 |
| ·HIV-1 整合酶耐药机理研究进展 | 第100-101页 |
| ·模拟方法 | 第101-102页 |
| ·耐药HIV-1 整合酶突变体的构建 | 第101-102页 |
| ·分子对接和分子动力学模拟步骤 | 第102页 |
| ·结果与讨论 | 第102-113页 |
| ·合理的耐药性整合酶单体结构 | 第102-105页 |
| ·耐药性整合酶与抑制剂的结合模式分析 | 第105-110页 |
| ·耐药性整合酶关键位点的构象变化分析 | 第110-113页 |
| ·本章小结 | 第113-116页 |
| 结论与展望 | 第116-120页 |
| 1. 论文的主要结论 | 第116-117页 |
| 2. 论文创新点 | 第117-118页 |
| 3. 对今后工作的展望 | 第118-120页 |
| 参考文献 | 第120-132页 |
| 读博士学位期间发表的学术论文 | 第132-134页 |
| 致谢 | 第134页 |
