致谢 | 第1-7页 |
中文摘要 | 第7-9页 |
Abstract | 第9-11页 |
缩略术语表 | 第11-13页 |
目次 | 第13-16页 |
1 文献综述 | 第16-31页 |
·蛋白质组学质谱分析原理及数据分析方法 | 第16-26页 |
·质谱分析原理 | 第16-19页 |
·离子源 | 第17-18页 |
·质量分析器 | 第18-19页 |
·质谱数据分析方法 | 第19-26页 |
·质谱数据预处理 | 第20-21页 |
·基于一级质谱图谱的蛋白质鉴定 | 第21-22页 |
·基于串联质谱图谱的蛋白质鉴定 | 第22-23页 |
·基于质谱分析的蛋白质序列从头预测 | 第23-24页 |
·基于质谱分析的蛋白质翻译后修饰鉴定 | 第24-25页 |
·基于质谱分析的变异或个体多态性及可变剪切鉴定 | 第25-26页 |
·定量蛋白质组学实验方法及数据分析方法 | 第26-29页 |
·蛋白水平定量的蛋白质组学实验分析 | 第26-27页 |
·肽段水平定量的蛋白质组学实验分析 | 第27-28页 |
·肽段水平无标记定量实验分析 | 第28-29页 |
·研究展望 | 第29-31页 |
2 利用蛋白质谱数据鉴定全新外显子-外显子组合形式的新方法 | 第31-48页 |
·引言 | 第31-32页 |
·材料和方法 | 第32-40页 |
·数据库设计和构建实现 | 第32-36页 |
·数据库设计 | 第32-34页 |
·数据库构建实现 | 第34-36页 |
·应用该数据库检索蛋白质谱数据 | 第36-37页 |
·潜在全新外显子-外显子连接处肽段筛选 | 第37页 |
·删除已知序列肽段 | 第37-40页 |
·结果 | 第40-45页 |
·外显子-外显子连接序列数据库构建结果 | 第40页 |
·应用该数据库在蛋白质谱数据中鉴定外显子全新组合结果 | 第40-45页 |
·讨论 | 第45-47页 |
·应用 | 第47-48页 |
3 基于小波滤噪算法的定量蛋白质组学数据分析的新方法 | 第48-67页 |
·引言 | 第48-50页 |
·材料和方法 | 第50-59页 |
·算法设计 | 第50-57页 |
·基于离散小波变换算法的信号分解及重构 | 第50-54页 |
·阈值滤波函数 | 第54-55页 |
·空域自适应算法的阈值计算 | 第55-57页 |
·算法实现及软件开发 | 第57-58页 |
·算法应用 | 第58-59页 |
·应用于酵母抽提蛋白标准样品的质谱数据分析 | 第58-59页 |
·应用于卵巢癌细胞系定量蛋白质组学的数据分析 | 第59页 |
·结果 | 第59-64页 |
·应用于酵母抽提蛋白标准样品的质谱数据分析结果 | 第59-63页 |
·应用于卵巢癌细胞系定量蛋白质组学的数据分析结果 | 第63-64页 |
·讨论 | 第64-66页 |
·应用 | 第66-67页 |
4 结论 | 第67-70页 |
参考文献 | 第70-86页 |
附录 | 第86-131页 |
附录A 构建理论推测全新外显子连接序列数据库的Perl脚本 | 第86-100页 |
附录B 鉴定所得全新外显子组合的连接处肽段列表 | 第100-124页 |
附录C 小波滤波算法核心函数C++代码 | 第124-131页 |
个人简历 | 第131-132页 |