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蛋白质组学质谱数据分析的新方法研究开发

致谢第1-7页
中文摘要第7-9页
Abstract第9-11页
缩略术语表第11-13页
目次第13-16页
1 文献综述第16-31页
   ·蛋白质组学质谱分析原理及数据分析方法第16-26页
     ·质谱分析原理第16-19页
       ·离子源第17-18页
       ·质量分析器第18-19页
     ·质谱数据分析方法第19-26页
       ·质谱数据预处理第20-21页
       ·基于一级质谱图谱的蛋白质鉴定第21-22页
       ·基于串联质谱图谱的蛋白质鉴定第22-23页
       ·基于质谱分析的蛋白质序列从头预测第23-24页
       ·基于质谱分析的蛋白质翻译后修饰鉴定第24-25页
       ·基于质谱分析的变异或个体多态性及可变剪切鉴定第25-26页
   ·定量蛋白质组学实验方法及数据分析方法第26-29页
     ·蛋白水平定量的蛋白质组学实验分析第26-27页
     ·肽段水平定量的蛋白质组学实验分析第27-28页
     ·肽段水平无标记定量实验分析第28-29页
   ·研究展望第29-31页
2 利用蛋白质谱数据鉴定全新外显子-外显子组合形式的新方法第31-48页
   ·引言第31-32页
   ·材料和方法第32-40页
     ·数据库设计和构建实现第32-36页
       ·数据库设计第32-34页
       ·数据库构建实现第34-36页
     ·应用该数据库检索蛋白质谱数据第36-37页
     ·潜在全新外显子-外显子连接处肽段筛选第37页
     ·删除已知序列肽段第37-40页
   ·结果第40-45页
     ·外显子-外显子连接序列数据库构建结果第40页
     ·应用该数据库在蛋白质谱数据中鉴定外显子全新组合结果第40-45页
   ·讨论第45-47页
   ·应用第47-48页
3 基于小波滤噪算法的定量蛋白质组学数据分析的新方法第48-67页
   ·引言第48-50页
   ·材料和方法第50-59页
     ·算法设计第50-57页
       ·基于离散小波变换算法的信号分解及重构第50-54页
       ·阈值滤波函数第54-55页
       ·空域自适应算法的阈值计算第55-57页
     ·算法实现及软件开发第57-58页
     ·算法应用第58-59页
       ·应用于酵母抽提蛋白标准样品的质谱数据分析第58-59页
       ·应用于卵巢癌细胞系定量蛋白质组学的数据分析第59页
   ·结果第59-64页
     ·应用于酵母抽提蛋白标准样品的质谱数据分析结果第59-63页
     ·应用于卵巢癌细胞系定量蛋白质组学的数据分析结果第63-64页
   ·讨论第64-66页
   ·应用第66-67页
4 结论第67-70页
参考文献第70-86页
附录第86-131页
 附录A 构建理论推测全新外显子连接序列数据库的Perl脚本第86-100页
 附录B 鉴定所得全新外显子组合的连接处肽段列表第100-124页
 附录C 小波滤波算法核心函数C++代码第124-131页
个人简历第131-132页

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