猪肉质性状三个候选基因的SNPs检测
| 中文摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第9-21页 |
| 1 肉质性状的研究进展 | 第9-12页 |
| ·肉质的评定标准 | 第9-10页 |
| ·影响猪肉品质的因素 | 第10页 |
| ·肌内脂肪和肌苷酸 | 第10-12页 |
| 2 影响脂肪沉积的候选基因 | 第12-16页 |
| ·PPAR 基因 | 第12-13页 |
| ·HSL 基因 | 第13页 |
| ·LPL 基因 | 第13页 |
| ·UCP3 基因 | 第13页 |
| ·ADD1 基因 | 第13页 |
| ·FABP 基因 | 第13-16页 |
| 3 影响核苷酸含量的候选基因 | 第16-17页 |
| ·代谢酶 | 第16页 |
| ·AMPD1 基因 | 第16-17页 |
| 4 DNA 分子标记 | 第17-20页 |
| ·限制性片段长度多态性(RFLP) | 第17页 |
| ·随机扩增多态性(RAPD) | 第17-18页 |
| ·扩增片段长度多态性(AFLP) | 第18页 |
| ·微卫星标记(SSR) | 第18页 |
| ·单链构象多态性(SSCP) | 第18-20页 |
| 5 研究的目的和意义 | 第20-21页 |
| 第二章 实验部分 | 第21-38页 |
| 1 实验材料 | 第21-23页 |
| ·实验猪种来源 | 第21页 |
| ·主要仪器设备 | 第21页 |
| ·实验主要试剂与配制 | 第21-23页 |
| ·分子生物学软件 | 第23页 |
| 2 实验方法 | 第23-27页 |
| ·基因组DNA 的提取 | 第23-24页 |
| ·PCR 引物设计 | 第24-25页 |
| ·PCR 反应体系的建立及优化 | 第25-26页 |
| ·PCR 产物的琼脂糖凝胶电泳检测 | 第26页 |
| ·PCR-SSCP 检测 | 第26-27页 |
| ·PCR 产物回收纯化与测序 | 第27页 |
| ·DNA 序列比对 | 第27页 |
| 3 统计分析方法 | 第27-29页 |
| ·等位基因频率和基因型频率 | 第27-28页 |
| ·Hardy-weinberg 平衡体系检验 | 第28页 |
| ·群体纯合度与杂合度 | 第28页 |
| ·有效等位基因数 | 第28页 |
| ·多态信息含量 | 第28-29页 |
| ·等位基因的确定及序列同源性比对 | 第29页 |
| 4 结果与分析 | 第29-38页 |
| ·DNA 琼脂糖凝胶电泳的检测 | 第29页 |
| ·H-FABP 基因PCR 扩增产物琼脂糖检测 | 第29-30页 |
| ·H-FABP 基因PCR-SSCP 检测 | 第30-32页 |
| ·H-FABP 基因的遗传特性和序列比对 | 第32-35页 |
| ·H-FABP 基因外显子2 进化及亲缘关系 | 第35-38页 |
| 第三章 讨论 | 第38-44页 |
| 1 关于实验方法 | 第38-39页 |
| ·PCR 扩增的主要影响因素 | 第38页 |
| ·PCR-SSCP 技术的主要影响因素 | 第38-39页 |
| 2 H-FABP 基因三个位点的群体遗传学 | 第39-40页 |
| ·等位基因和基因型的分布 | 第39页 |
| ·群体遗传多样性 | 第39页 |
| ·不同猪种的群体遗传学差异 | 第39-40页 |
| 3 H-FABP 基因三个位点核苷酸变异情况 | 第40-42页 |
| ·5′端调控区的核苷酸变异 | 第40-41页 |
| ·外显子2 的核苷酸变异 | 第41页 |
| ·外显子4 的核苷酸变异 | 第41-42页 |
| 4 各种动物外显子2 的进化及亲缘关系 | 第42页 |
| 5 A-FABP 和AMPD1 基因的多态性 | 第42-44页 |
| 第四章 结论 | 第44-45页 |
| 参考文献 | 第45-51页 |
| 致谢 | 第51页 |