| 摘要 | 第9-11页 |
| ABSTRACT | 第11-12页 |
| 缩略词中英文对照表 | 第13-14页 |
| 绪论 | 第14-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-27页 |
| 1 国内外水产种业的现状 | 第15-17页 |
| 1.1 我国渔业种业的现状 | 第15-16页 |
| 1.2 国际种业管理的现状及启示 | 第16-17页 |
| 1.3 种业技术研发 | 第17页 |
| 2 我国水产种质资源保护和利用情况 | 第17-23页 |
| 2.1 原良种场概况 | 第18-20页 |
| 2.2 育种实用技术 | 第20-21页 |
| 2.3 发展现代种业 | 第21-23页 |
| 3 R语言在种质资源管理中的应用 | 第23-24页 |
| 4 本文研究的内容 | 第24-25页 |
| 参考文献 | 第25-27页 |
| 第二章 基于家系选育的BLUP选配计划制定的R实现 | 第27-43页 |
| 1 引言 | 第27-28页 |
| 2 材料与方法 | 第28-29页 |
| 2.1 BLUP选育配套脚本开发平台 | 第28页 |
| 2.2 BLUP选育配套脚本的编写思路 | 第28页 |
| 2.3 BLUP选育配套脚本的测试 | 第28-29页 |
| 2.3.1 测试鱼类概况 | 第28页 |
| 2.3.2 数据资料收集 | 第28-29页 |
| 2.3.3 收集数据的核对 | 第29页 |
| 2.3.4 数据集数据处理原则 | 第29页 |
| 2.3.5 数据分析模型的获得 | 第29页 |
| 2.3.6 选配计划的输出 | 第29页 |
| 3 结果分析 | 第29-39页 |
| 3.1 BLUP选育配套脚本编写 | 第29-31页 |
| 3.1.1 育种值计算前使用的i2016Tilapia.R数据整合和模型建立脚本 | 第30页 |
| 3.1.2 育种值计算后使用的Mating_breeding_2016Carp05.R配套脚本 | 第30-31页 |
| 3.2 BLUP选育配套脚本的测试结果 | 第31-39页 |
| 3.2.1 鲤鱼和罗非鱼育种数据整合 | 第31-35页 |
| 3.2.2 育种模型的获得 | 第35-36页 |
| 3.2.3 育种值与原始值的整合 | 第36页 |
| 3.2.4 选配计划的制定 | 第36-39页 |
| 4 讨论 | 第39-42页 |
| 4.1 育种中使用的混合线性模型 | 第39-40页 |
| 4.2 育种辅助配套脚本的实用性 | 第40页 |
| 4.3 与育种相关的R软件包的应用 | 第40-41页 |
| 4.4 几个重要的分析节点 | 第41-42页 |
| 参考文献 | 第42-43页 |
| 第三章 叠代保种和离散随机保种两种保种方式模拟的R实现及应用 | 第43-55页 |
| 1 引言 | 第43-44页 |
| 2 材料与方法 | 第44-45页 |
| 2.1 编程平台及使用软件 | 第44-45页 |
| 2.2 本文的假设 | 第45页 |
| 2.3 起始群体模拟的参数设置 | 第45页 |
| 2.4 瓶颈分析 | 第45页 |
| 3 结果分析 | 第45-51页 |
| 3.1 用于保种的配套脚本 | 第45-46页 |
| 3.2 基础种群的产生 | 第46页 |
| 3.3 新一代的产生 | 第46-49页 |
| 3.4 保种群体的瓶颈分析 | 第49-51页 |
| 4 讨论 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-55页 |
| 第四章 建立的育种配套技术在黄河鲤新品系选育中的应用 | 第55-71页 |
| 1 引言 | 第55页 |
| 2 材料与方法 | 第55-58页 |
| 2.1 实验动物 | 第55-56页 |
| 2.2 G3代黄河鲤的选育方法 | 第56页 |
| 2.3 G3代苗种培育和个体标记 | 第56页 |
| 2.4 G3代黄河鲤生长性能测定 | 第56-58页 |
| 2.5 数据分析 | 第58页 |
| 3 结果分析 | 第58-67页 |
| 3.1 G2代黄河鲤数据的整合 | 第58-62页 |
| 3.2 G3代黄河鲤新品系选育所用模型选择 | 第62页 |
| 3.3 G3代黄河鲤新品系选配计划 | 第62-65页 |
| 3.4 G3代黄河鲤新品系养殖实验数据采集 | 第65页 |
| 3.5 G3代黄河鲤新品系选育结果分析 | 第65-66页 |
| 3.6 G3代黄河鲤新品系对高碳水化物的适应性生长 | 第66-67页 |
| 3.7 使用R选育配套脚本所需时间 | 第67页 |
| 4 讨论 | 第67-68页 |
| 参考文献 | 第68-71页 |
| 全文结论 | 第71-73页 |
| 创新点 | 第73-75页 |
| 致谢 | 第75-77页 |
| 附录 | 第77-114页 |
