| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 缩略语 | 第11-14页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-34页 |
| 1.1. 泡吻棘头虫的种类和分布 | 第14-21页 |
| 1.2. 棘头虫和泡吻棘头虫的的生活史 | 第21-26页 |
| 1.3. 泡吻棘头虫对中间宿主行为及生理的影响 | 第26-28页 |
| 1.4. 棘头虫的系统发育 | 第28-30页 |
| 1.5. 线粒体基因组与进化速率 | 第30-33页 |
| 1.6. 本研究的目的与意义 | 第33-34页 |
| 第二章 泡吻属一新种：福海泡吻棘头虫(古棘头头纲：棘吻目) | 第34-50页 |
| 2.1. 前言 | 第34-35页 |
| 2.2. 材料与方法 | 第35-36页 |
| 2.2.1. 样本的收集 | 第35-36页 |
| 2.2.2. 形态观察 | 第36页 |
| 2.3. 结果 | 第36-48页 |
| 2.4. 讨论 | 第48-50页 |
| 第三章 鱼类寄生的泡吻棘头虫线粒体基因组克隆及系统发育研究 | 第50-120页 |
| 3.1. 前言 | 第50-51页 |
| 3.2. 材料与方法 | 第51-61页 |
| 3.2.1. 实验标本的采集、保存与鉴定 | 第51-52页 |
| 3.2.2. 完整线粒体基因组扩增 | 第52-53页 |
| 3.2.3. 线粒体基因组全序列生物信息学分析 | 第53-59页 |
| 3.2.4. 泡吻棘头虫线粒体基因组研究 | 第59页 |
| 3.2.5. 系统发育树的构建 | 第59-60页 |
| 3.2.6. 物种分化时间估算 | 第60-61页 |
| 3.3. 结果 | 第61-116页 |
| 3.3.1. 线粒体基因组序列及其特征 | 第61-95页 |
| 3.3.2. 转换及颠换饱和性分析 | 第95-101页 |
| 3.3.3. 中性检验 | 第101页 |
| 3.3.4. 滑动窗口多态性分析 | 第101页 |
| 3.3.5. 基于核苷酸和氨基酸序列的系统发育分析 | 第101-113页 |
| 3.3.6 物种起源与分化时间 | 第113-116页 |
| 3.4. 讨论 | 第116-120页 |
| 3.4.1 泡吻棘头虫线粒体基因组及滑动窗口分析 | 第116-118页 |
| 3.4.2 泡吻棘头虫系统发育树的构建 | 第118页 |
| 3.4.3 泡吻棘头虫生物地理学研究 | 第118-120页 |
| 第四章 隐藏新棘虫线粒体基因组克隆及其在系统发育研究中的应用 | 第120-139页 |
| 4.1. 前言 | 第120-121页 |
| 4.2. 材料与方法 | 第121-124页 |
| 4.2.1. 实验标本的采集、保存 | 第121页 |
| 4.2.2. 完整线粒体基因组序列的扩增 | 第121-122页 |
| 4.2.3. 线粒体基因组全序列生物信息学分析 | 第122页 |
| 4.2.4. 后生动物线粒体基因组系统发育研究 | 第122-124页 |
| 4.3. 结果 | 第124-136页 |
| 4.3.1. 线粒体基因组基本组成分析 | 第124页 |
| 4.3.2. 蛋白编码基因密码子的使用及序列特点 | 第124页 |
| 4.3.3. 转运RNA和核糖体RNA | 第124-125页 |
| 4.3.4. 非编码区 | 第125页 |
| 4.3.5. 系统发育分析 | 第125-136页 |
| 4.4. 讨论 | 第136-139页 |
| 参考文献 | 第139-159页 |
| 附录 | 第159-160页 |
| 致谢 | 第160页 |
