| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-18页 |
| 1.1 引言 | 第10-16页 |
| 1.1.1 微生物组学研究背景 | 第10-11页 |
| 1.1.2 微生物组成分数据分析 | 第11-13页 |
| 1.1.3 系统进化树与微生物组数据分析 | 第13-16页 |
| 1.2 本文主要研究工作和创新 | 第16页 |
| 1.3 本文的组织结构 | 第16-18页 |
| 第二章 微生物成分数据分析方法研究综述 | 第18-27页 |
| 2.1 引言 | 第18页 |
| 2.2 成分数据分析的经典转换方法 | 第18-20页 |
| 2.3 基于加性对数比变换的方法 | 第20-22页 |
| 2.4 基于中心对数比变换的方法 | 第22-23页 |
| 2.5 基于等距对数比变换的方法 | 第23-25页 |
| 2.6 本章小结 | 第25-27页 |
| 第三章 整合系统进化树拓扑结构的成分数据变换方法 | 第27-38页 |
| 3.1 引言 | 第27页 |
| 3.2 微生物成分数据的PhILR变换 | 第27-29页 |
| 3.3 基于系统进化树高度和叶子结点数进行加权 | 第29-33页 |
| 3.4 实验结果及分析 | 第33-37页 |
| 3.4.1 数据获取及筛选 | 第33页 |
| 3.4.2 标准分类对比 | 第33-36页 |
| 3.4.3 结果分析 | 第36-37页 |
| 3.5 本章小结 | 第37-38页 |
| 第四章 整合系统进化树拓扑结构的微生物网络构建 | 第38-50页 |
| 4.1 引言 | 第38页 |
| 4.2 几种对数比转换之间的关系 | 第38-40页 |
| 4.3 基于系统进化树利用中心对数比转换构建微生物网络 | 第40-41页 |
| 4.4 实验结果及分析 | 第41-49页 |
| 4.4.1 数据获取及筛选 | 第41页 |
| 4.4.2 相关性矩阵的计算及比较 | 第41-46页 |
| 4.4.3 构建微生物网络及分析 | 第46-49页 |
| 4.5 本章小结 | 第49-50页 |
| 第五章 总结与展望 | 第50-53页 |
| 5.1 论文总结 | 第50-51页 |
| 5.2 下一步研究工作 | 第51-53页 |
| 参考文献 | 第53-58页 |
| 攻读硕士期间发表的论文和参加的科研项目 | 第58-59页 |
| 致谢 | 第59页 |