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RNA聚合酶Ⅱ最大亚基RPB1的全长CTD通过控制细胞周期影响根尖干细胞池的命运

中文摘要第10-12页
Abstract第12-14页
1 前言第15-41页
    1.1 植物干细胞池的组织学特征第16-21页
        1.1.1 静止中心与组织中心的维持第17-18页
        1.1.2 根尖分生组织的细胞形态建成第18-21页
            1.1.2.1 PLT途径与根尖干细胞池维持第19-20页
            1.1.2.2 SCR-SHR途径维持基本组织的形成第20-21页
    1.2 生长素与根尖干细胞维持第21-24页
        1.2.1 SCFTIR1/AFBs生长素感知信号途径第21-22页
        1.2.2 非转录依赖性的生长素响应途径第22-23页
        1.2.3 生长素信号转导参与干细胞维持第23页
        1.2.4 生长素调节胚根的形成第23-24页
    1.3 其它因子参与干细胞的维持第24-29页
        1.3.1 细胞周期因子参与干细胞维持第24-25页
        1.3.2 表观调控与干细胞维持第25-26页
        1.3.3 干细胞维持的空间协调性第26-29页
    1.4 RNA聚合酶ⅡCTD协调转录以及RNA的加工处理第29-39页
        1.4.1 CTD的结构以及修饰作用第29-31页
            1.4.1.1 酵母和哺乳动物中的CTD激酶第29页
            1.4.1.2 拟南芥CDKF;1是植物CTD特异的Ser7激酶第29-30页
            1.4.1.3 CTD磷酸酶第30-31页
        1.4.2 重复序列以及CTD长度的重要性第31-33页
        1.4.3 转录循环的早期事件第33-35页
        1.4.4 CTD与转录的延伸以及染色质化第35页
        1.4.5 CTD与RNA的加工处理第35-36页
        1.4.6 RNA聚合酶Ⅱ的暂停现象第36-39页
            1.4.6.1 转录停靠的机制第36-37页
            1.4.6.2 转录停靠的关键因子第37-38页
            1.4.6.3 移动来产生延伸第38-39页
    1.5 CRISPR/Cas9基因组定向编辑技术的发展及其在植物中的应用第39-40页
    1.6 本研究的目的和意义第40-41页
2 材料与方法第41-59页
    2.1 实验材料第41-43页
        2.1.1 植物材料第41页
        2.1.2 菌株和质粒第41页
        2.1.3 生化试剂第41页
        2.1.4 实验引物第41-43页
    2.2 实验方法第43-59页
        2.2.1 植物基因组DNA的提取第43页
        2.2.2 表达载体的构建第43-46页
            2.2.2.1 PCR引物设计第43页
            2.2.2.2 PCR扩增目的片段第43-44页
            2.2.2.3 DNA片段的回收(试剂盒法)第44页
            2.2.2.4 载体与目的片段酶切第44页
            2.2.2.5 目的DNA片段与表达载体连接第44-45页
            2.2.2.6 大肠杆菌感受态细胞的制备第45页
            2.2.2.7 大肠杆菌感受态细胞的转化(热激法)第45页
            2.2.2.8 质粒DNA的提取第45-46页
            2.2.2.9 DNA序列测序第46页
        2.2.3 CRISPR技术实验步骤第46-47页
            2.2.3.1 引物设计第46页
            2.2.3.2 载体酶切、去磷酸化第46-47页
            2.2.3.3 片段磷酸化、复性成双链第47页
            2.2.3.4 连接与转化第47页
            2.2.3.5 测序第47页
        2.2.4 根癌农杆菌GV3101感受态细胞的制备与转化第47-48页
            2.2.4.1 根癌农杆菌GV3101感受态细胞的制备第47-48页
            2.2.4.2 液氮冷冻法转化农杆菌第48页
        2.2.5 拟南芥的栽培与转化第48-49页
            2.2.5.1 拟南芥的栽培第48页
            2.2.5.2 拟南芥的转化第48-49页
        2.2.6 转基因拟南芥阳性植株的筛选第49页
        2.2.7 植物总RNA的提取第49-50页
        2.2.8 反转录第50-51页
        2.2.9 荧光定量PCR第51页
        2.2.10 GUS活性检测第51-52页
            2.2.10.1 GUS染色第51-52页
            2.2.10.2 GUS报导基因的定量检测第52页
        2.2.11 激光共聚焦显微镜观察第52-53页
        2.2.12 WesternBlot实验第53-56页
            2.2.12.1 植物蛋白的提取第53页
            2.2.12.2 蛋白质浓度检测(Bradford法)第53-54页
            2.2.12.3 试剂配制第54-55页
            2.2.12.4 蛋白质凝胶电泳第55-56页
            2.2.12.5 转膜、抗体孵育及显色第56页
        2.2.13 染色质免疫共沉淀实验第56-59页
            2.2.13.1 配制缓冲液第56-57页
            2.2.13.2 CHIP实验第57-59页
3 结果与分析第59-93页
    3.1 CARD1蛋白是一个控制植物整个发育阶段的调节子第59-60页
    3.2 CARD1蛋白限制茎顶端分生组织的大小第60-62页
    3.3 CARD1蛋白是RNA聚合酶Ⅱ的最大亚基RPB第62-63页
    3.4 CRISPR技术产生一系列card1s突变体第63-65页
    3.5 表型互补实验第65-66页
    3.6 CARD1蛋白的表达模式分析第66-68页
    3.7 CARD1蛋白限制根尖分生组织大小以及QC的分裂第68-70页
    3.8 CTD功能域截短导致细胞周期加快第70-73页
        3.8.1 ProCYCD6;1:GUS显示突变体根尖细胞不对称分裂明显第72页
        3.8.2 card1-1突变体中细胞周期途径关键蛋白上调第72-73页
    3.9 CARD1蛋白通过PLT途径参与根尖干细胞的维持第73-77页
        3.9.1 card1-1突变体中PLT蛋白浓度减少第74页
        3.9.2 card1-1突变体中干细胞池区域扩大第74-75页
        3.9.3 突变体根尖皮层和内皮层细胞分裂明显第75-77页
    3.10 RPB1的全长CTD维持可诱导基因的转录活性第77-81页
    3.11 RNA聚合酶Ⅱ的CTD功能域截短导致磷酸化状态改变并且加速了细胞周期第81-83页
    3.12 RNA聚合酶ⅡCTD的Ser2P磷酸化水平的增加导致细胞周期加快第83-85页
    3.13 CTD磷酸酶cpl3-1和card1-1在根粗及下胚轴长度上有相似的表型第85页
    3.14 CARD1蛋白参与生长素途径但独立于SCF~(TIRI/AFBs)复合体第85-91页
        3.14.1 card1-1在蛋白水平上表现出对生长素不敏感第87-88页
        3.14.2 card1-1可以补偿axr1-3对生长素的不敏感性第88-89页
        3.14.3 card1-1突变体不直接参与生长素运输途径第89-91页
    3.15 card1-1突变体细胞分裂加快导致细胞死亡现象第91-92页
    3.16 CARD1蛋白CTD功能域参与转录暂停机制的工作模型第92-93页
4 讨论第93-96页
    4.1 RNA聚合酶Ⅱ的全长CTD对植物个体发育的影响第93页
    4.2 CTD功能域截短导致细胞周期加快第93页
    4.3 CARD1蛋白对细胞命运决定的影响第93-94页
    4.4 RNAPolⅡ的暂停现象对转录活性的影响第94-95页
    4.5 CTD长度在进化上的保守型第95页
    4.6 CTD功能域磷酸化水平的变化影响精确转录第95-96页
5 结论第96-97页
参考文献第97-107页
致谢第107-108页
攻读学位期间发表论文情况第108页

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