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稻瘟病菌中Chm1假定调节蛋白的初步鉴定与功能分析

摘要第10-11页
Abstract第11页
1 前言第12-20页
    1.1 稻瘟病第12页
    1.2 稻瘟病菌第12-13页
        1.2.1 稻瘟病菌的特征第12页
        1.2.2 稻瘟病菌的侵染机制第12-13页
        1.2.3 稻瘟病菌基因研究第13页
    1.3 PAK家族蛋白第13-16页
        1.3.1 PAK家族种类第13-14页
        1.3.2 PAK蛋白结构第14页
        1.3.3 PAK活化机制第14-15页
        1.3.4 PAK生物学功能第15-16页
    1.4 GVP36蛋白相关研究第16页
    1.5 ZDS蛋白相关研究第16-17页
    1.6 BOI蛋白相关研究第17-18页
    1.7 本研究的意义第18-20页
2 材料与方法第20-36页
    2.1 实验材料第20-22页
        2.1.1 实验菌株及植物材料第20页
        2.1.2 实验质粒第20页
        2.1.3 实验培养基第20-22页
        2.1.4 实验试剂第22页
    2.2 实验方法第22-36页
        2.2.1 生物信息学方法第22-23页
            2.2.1.1 稻瘟病菌中Chm1相关蛋白的获得第22页
            2.2.1.2 目的蛋白氨基酸序列系统进化分析第22-23页
        2.2.2 稻瘟病菌基因敲除第23-25页
            2.2.2.1 稻瘟病菌基因敲除策略第23页
            2.2.2.2 稻瘟病菌基因组DNA的提取第23-24页
            2.2.2.3 稻瘟病菌原生质体的制备第24-25页
            2.2.2.4 转化稻瘟病菌原生质体及阳性克隆验证第25页
        2.2.3 敲除转化子的表型分析第25-26页
            2.2.3.1 菌落生长速度测定试验第25页
            2.2.3.2 产孢量统计试验第25-26页
            2.2.3.3 孢子萌发及附着胞形成试验第26页
            2.2.3.4 大麦离体接种试验(菌丝块)第26页
            2.2.3.5 水稻活体喷雾接种试验(孢子液)第26页
        2.2.4 酵母双杂第26-29页
            2.2.4.1 供试载体(BD载体)的构建第26-27页
            2.2.4.2 酵母感受态细胞的制备和转化第27-28页
            2.2.4.3 MoGvp36-BD,MoZds2-BD和MoBoi2-BD自激活试验第28-29页
            2.2.4.4 MoGvp36-BD,MoZds2-BD和MoBoi2-BD重组质粒对AH109细胞毒性检测第29页
        2.2.5 稻瘟病菌总RNA的提取(菌丝体)第29-30页
        2.2.6 PCR,逆转录RT-PCR及荧光定量PCR(qRT)第30-32页
        2.2.7 大肠杆菌DH5α感受态细胞的制备及转化第32-33页
        2.2.8 质粒DNA的提取第33页
        2.2.9 质粒酶切与连接第33-34页
        2.2.10 高通量iTRAQ技术第34-35页
        2.2.11 RNA-SEQ技术第35-36页
3 结果与分析第36-57页
    3.1 稻瘟病菌中Chm1相关蛋白的生物信息学预测第36-37页
    3.2 MoGvp36,MoZds2和MoBoi2生物信息学分析第37-43页
        3.2.1 MoGvp36生物信息学分析第37-39页
            3.2.1.1 MoGvp36同源蛋白系统进化分析第37-38页
            3.2.1.2 MoGvp36蛋白亚细胞定位分析第38-39页
        3.2.2 MoZds2生物信息学分析第39-41页
            3.2.2.1 MoZds2同源蛋白系统进化树分析第39页
            3.2.2.2 MoZds2蛋白亚细胞定位分析第39-41页
        3.2.3 MoBoi2生物信息学分析第41-43页
            3.2.3.1 MoBoi2同源蛋白系统进化树分析第41页
            3.2.3.2 MoBoi2蛋白亚细胞定位分析第41-43页
    3.3 Chml突变体中相关基因的相对表达量分析第43页
    3.4 MoGvp36,MoZds2,MoBoi2功能分析第43-51页
        3.4.1 目的基因突变体的获得第43-44页
        3.4.2 MoGvp36基因功能分析第44-47页
            3.4.2.1 MoGvp36突变体的菌落形态观察及生长速度测定第44-45页
            3.4.2.2 MoGvp36突变体的产孢量统计第45页
            3.4.2.3 MoGvp36突变体的孢子萌发率及附着胞形成第45-46页
            3.4.2.4 MoGvp36突变体的致病性分析第46-47页
        3.4.3 MoZds2基因功能分析第47-49页
            3.4.3.1 MoZds2突变体的菌落形态观察及生长速度测定第47页
            3.4.3.2 MoZds2突变体的产孢量统计第47-48页
            3.4.3.3 MoZds2突变体的孢子萌发率及附着胞形成第48-49页
            3.4.3.4 MoZds2突变体的致病性分析第49页
        3.4.4 MoBoi2基因功能分析第49-51页
            3.4.4.1 MoBoi2突变体的菌落形态观察及生长速度测定第49-50页
            3.4.4.2 MoBoi2突变体的产孢量统计第50页
            3.4.4.3 MoBoi2突变体的孢子萌发率及附着胞形成第50-51页
            3.4.4.4 MoBoi2突变体的致病性分析第51页
    3.5 酵母双杂验证目的蛋白与Chml的互作关系第51-54页
        3.5.1 目的蛋白BD载体的构建第51-52页
        3.5.2 目的蛋白BD载体自激活试验第52-53页
        3.5.3 酵母双杂验证互作实验第53-54页
    3.6 MoGvp36,MoZds2,MoBoi2突变体背景下Chml的表达水平第54页
    3.7 iTRAQ和RNA-SEQ关联分析筛选Chm1相关的产孢基因第54-57页
4 讨论第57-60页
    4.1 MoGvp36,MoZds2,MoBoi2与Chm1的关系第57页
    4.2 关于MoGvp36功能的探讨第57页
    4.3 关于MoZds2功能的探讨第57-58页
    4.4 关于MoBoi2功能的探讨第58页
    4.5 关于Chm1其他相关蛋白的探讨第58-60页
5 展望第60-61页
参考文献第61-67页
附录第67-69页
致谢第69页

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