| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-9页 |
| 主要符号表 | 第15-16页 |
| 第1章 绪论 | 第16-38页 |
| 1.1 草螺菌特性 | 第16-32页 |
| 1.1.1 草螺菌简述 | 第16页 |
| 1.1.2 草螺菌的分类 | 第16-20页 |
| 1.1.3 草螺菌多样性 | 第20-32页 |
| 1.1.3.1 Herbaspirillum seropedicae | 第20-21页 |
| 1.1.3.2 Herbaspirillum rubrisubalbican | 第21-23页 |
| 1.1.3.3 Herbaspirillum autotrophicum | 第23-26页 |
| 1.1.3.4 Herbaspirillum chlorophenolicum | 第26-28页 |
| 1.1.3.5 Herbaspirillum rhizosphaerae | 第28-30页 |
| 1.1.3.6 Herbaspirillum sp. WT00C | 第30-32页 |
| 1.2 草螺菌基因组 | 第32-33页 |
| 1.3 微生物基因组分析 | 第33-37页 |
| 1.3.1 微生物基因组测序 | 第33-36页 |
| 1.3.2 微生物基因组注释 | 第36-37页 |
| 1.4 实验背景、目的与意义 | 第37-38页 |
| 第2章 实验研究 | 第38-76页 |
| 2.1 实验仪器、材料与试剂 | 第38页 |
| 2.1.1 实验菌株 | 第38页 |
| 2.1.2 实验仪器 | 第38页 |
| 2.1.3 实验试剂 | 第38页 |
| 2.2 实验方法与步骤 | 第38-45页 |
| 2.2.1 草螺菌WT00C全基因组的提取与检测 | 第38-39页 |
| 2.2.2 草螺菌WT00C全基因组 500 BP、6000 BP文库构建及基因组测序 | 第39-40页 |
| 2.2.3 基因组组分和基因组功能注释 | 第40-41页 |
| 2.2.4 草螺菌WT00C的ACC脱氨酶基因检测以及其酶活性测定 | 第41-44页 |
| 2.2.4.1 草螺菌WT00C的ACC脱氨酶基因检测 | 第41-43页 |
| 2.2.4.2 草螺菌WT00C、织片草螺菌Z67和红苍白草螺菌Os34的ACC脱氨酶活性比较 | 第43-44页 |
| 2.2.5 草螺菌WT00C的嗜铁素鉴定以及嗜铁素合成过程中的NPRS结构分析 | 第44页 |
| 2.2.6 草螺菌WT00C促生作用试验 | 第44-45页 |
| 2.2.7 草螺菌WT00C硒代谢能力验证以及其生成的硒化合物的透射电镜检验 | 第45页 |
| 2.2.8 不同草螺菌基因组比较 | 第45页 |
| 2.3 实验结果与分析 | 第45-76页 |
| 2.3.1 草螺菌WT00C全基因组检测 | 第45-46页 |
| 2.3.2 草螺菌WT00C基因组测序与拼接 | 第46-49页 |
| 2.3.3 草螺菌WT00C基因组的组分分析及其基因组注释 | 第49-55页 |
| 2.3.4 草螺菌WT00C的生化代谢途径 | 第55-69页 |
| 2.3.4.1 草螺菌WT00C的糖代谢途径 | 第55-57页 |
| 2.3.4.2 草螺菌WT00C的脂类代谢途径 | 第57-58页 |
| 2.3.4.3 草螺菌WT00C的氨基酸代谢途径 | 第58-59页 |
| 2.3.4.4 草螺菌WT00C的含氮化合物的代谢 | 第59-61页 |
| 2.3.4.5 草螺菌WT00C内含苯环物质的代谢 | 第61页 |
| 2.3.4.6 草螺菌WT00C的物质转运系统 | 第61-63页 |
| 2.3.4.7 草螺菌WT00C与茶树生长发育相关的因子 | 第63-69页 |
| 2.3.5 草螺菌WT00C促生作用实证 | 第69-73页 |
| 2.3.6 草螺菌WT00C硒化合物代谢与硒还原 | 第73-74页 |
| 2.3.7 草螺菌WT00C和其它草螺菌基因组特性比较 | 第74-76页 |
| 第3章 讨论与展望 | 第76-78页 |
| 参考文献 | 第78-91页 |
| 研究生期间的成果 | 第91-92页 |
| 致谢 | 第92页 |
