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小麦与条锈菌亲和互作表达序列标签(EST)分析和条锈菌转录基因物理图谱构建

摘要第1-8页
 ABSTRACT第8-14页
第一章 文献综述第14-29页
   ·小麦与条锈病第14-17页
     ·什么是小麦条锈病第14页
     ·小麦条锈病的危害第14-15页
     ·小麦与条锈菌亲和性反应的发病过程第15页
     ·小麦条锈病的防治策略第15-16页
     ·小麦条锈病的流行学研究第16页
     ·小麦条锈病组织学与细胞学研究第16-17页
   ·锈菌与寄主植物亲和互作研究进展第17-21页
     ·在锈菌与寄主亲和互作过程中表达的锈菌基因第17-20页
     ·小麦与条锈菌亲和互作的分子生物学研究进展第20-21页
   ·功能基因组学研究进展第21-23页
     ·功能基因组学第21页
     ·功能基因组学研究方法第21-23页
   ·EST 技术第23-25页
     ·EST 技术的概念第23-24页
     ·EST 技术的应用第24-25页
     ·EST 尚存在的问题第25页
   ·比较基因组学研究进展第25-26页
     ·比较基因组学第25-26页
     ·表达序列标签(EST)在比较基因组学中的应用第26页
   ·病毒诱导的基因沉默(Virus Iduced Gene Silence,VIGS )第26-27页
     ·病毒诱导的基因沉默第26页
     ·病毒诱导的基因沉默在植物基因功能研究中的应用第26-27页
   ·本研究的目的意义第27-29页
第二章 表达序列标签(EST)大规模测序及生物信息学分析第29-40页
   ·实验材料、仪器与试剂第29页
     ·材料第29页
     ·主要仪器第29页
     ·试剂第29页
   ·实验方法第29-32页
     ·EST 测序测定及初步分析第29页
     ·目的菌体(质粒)培养第29-30页
     ·质粒提取第30-31页
     ·EST 序列测定第31页
     ·测序产物纯化第31-32页
     ·EST 序列分析第32页
     ·EST 序列与秆锈菌基因组进行相似性同源比对第32页
   ·结果与分析第32-37页
     ·克隆质粒菌落PCR 检测第32-33页
     ·表达序列标签(EST)测序第33页
     ·表达序列标签(EST)序列质量分析第33-34页
     ·原始序列拼接结果第34页
     ·基因注释和功能分类第34-35页
     ·Unigene 序列与秆锈菌基因组进行相似性同源比对结果第35-37页
   ·讨论第37-40页
     ·EST 测序第38-39页
     ·EST 聚类、拼接蛋白功能分类第39页
     ·Unigene 序列与秆锈菌基因组进行相似性同源比对第39-40页
第三章 候选基因转录表达分析和VIGS 功能分析第40-62页
   ·实验仪器、试剂与材料第40页
     ·大部分试剂和仪器同第一章第40页
     ·小麦与条锈菌材料第40页
   ·实验方法第40-52页
     ·表达分析接种与取样第40-41页
     ·VIGS 实验样品培养和处理第41页
     ·小麦叶片总 RNA 的提取、纯化及质量检测第41-42页
     ·反转录合成cDNA 第一链第42-43页
     ·半定量RT-PCR 分析条锈菌基因转录表达第43-45页
     ·候选基因的qRT-PCR 转录表达分析第45-48页
     ·病毒诱导的基因沉默分析候选基因的功能第48-52页
   ·结果与分析第52-60页
     ·用于转录表达分析的组织样品反应型第52-53页
     ·RNA 的提取与质量检测第53页
     ·反转录产物合成cDNA 第一链PCR 检测第53-54页
     ·8 个来自条锈菌菌基因的SqRT-PCR 分析结果第54页
     ·候选基因qRT-PCR 分析其转录表达结果第54-57页
     ·VIGS 介导的基因沉默验证基因功能第57-60页
   ·讨论第60-62页
第四章 小麦条锈菌Puccinia striiformis f. sp. Tritici 转录基因物理图谱的构建与分析第62-78页
   ·材料和仪器第62页
     ·试验材料第62页
     ·所用仪器第62页
   ·试验方法第62-63页
     ·小麦条锈菌转录基因物理图谱构建第62页
     ·选择基因特异性引物对图谱进行验证第62-63页
   ·结果与分析第63-76页
     ·小麦条锈菌EST 与小麦秆锈菌基因组序列的同源性分析第63页
     ·小麦条锈菌转录基因物理图谱构建第63-74页
     ·条锈菌EST 序列外显子信息第74页
     ·基于条锈菌BAC 文库的转录基因物理图谱验证第74-76页
   ·讨论第76-78页
参考文献第78-84页
附录第84-157页
致谢第157-158页
个人简介第158页

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