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斑节对虾卵巢发育过程中RBL和下游Chk1基因的生物学功能分析

摘要第4-7页
ABSTRACT第7-10页
第一章 引言第16-23页
    1.1 文献综述第16-22页
        1.1.1 斑节对虾简介第16页
        1.1.2 斑节对虾卵巢发育研究现状第16-17页
        1.1.3 斑节对虾卵巢发育相关基因的研究现状第17-18页
        1.1.4 成视网膜细胞瘤基因(Rb)基因的研究进展第18-20页
        1.1.5 检验点激酶 1(Chk1)基因的研究进展第20-22页
    1.2 本研究的目的和意义第22-23页
第二章 斑节对虾RBL基因的克隆及功能分析第23-58页
    2.1 引言第23页
    2.2 实验材料第23-26页
        2.2.1 实验动物第23页
        2.2.2 实验仪器第23-25页
        2.2.3 实验试剂与配制第25-26页
    2.3 实验方法第26-39页
        2.3.1 实验用品预处理第26页
        2.3.2 总RNA提取和cDNA的合成第26-28页
        2.3.3 PmRBL基因cDNA全长的克隆第28-34页
            2.3.3.1 开放阅读框的预测第28页
            2.3.3.2 引物的设计第28-29页
            2.3.3.3 PCR产物切胶回收第29-30页
            2.3.3.4 PCR产物连接和转化第30-31页
            2.3.3.5 挑取单克隆和菌液检测第31页
            2.3.3.6 RACE克隆基因 3'非编码区第31-34页
        2.3.4 PmRBL基因定量表达分析第34-35页
        2.3.5 PmRBL基因双链RNA干扰实验第35-38页
            2.3.5.1 构建pD7-RBL和pD7-GFP重组载体第35-36页
            2.3.5.2 制备体外转录模板第36-37页
            2.3.5.3 双链RNA的体外转录及纯化第37页
            2.3.5.4 双链RNA的精制第37-38页
            2.3.5.5 dsRNA-RBL注射实验第38页
        2.3.6 RBL原位杂交试验第38-39页
        2.3.7 性腺指数(GSI)试验第39页
        2.3.8 序列分析与系统进化树的构建第39页
    2.4 实验结果第39-55页
        2.4.1 PmRBL生物信息学分第39-46页
            2.4.1.1 PmRBL的cDNA序列特征第39-43页
            2.4.1.2 PmRBL多重序列比对和系统进化树分析第43-46页
        2.4.2 PmRBL基因在不同组织及卵巢发育各期的表达分析第46-48页
            2.4.2.1 PmRBL mRNA在不同组织中的表达分析第46-47页
            2.4.2.2 PmRBL mRNA在卵巢发育各期的表达分析第47-48页
        2.4.3 PmRBL基因在 5-HT刺激和眼柄切除后卵巢中的表达分析第48-49页
            2.4.3.1 PmRBL基因在 5-HT刺激后卵巢中的表达分析第48-49页
            2.4.3.2 PmRBL基因在眼柄切除后卵巢中的表达分析第49页
        2.4.4 靶向沉默RBL相关基因的表达分析、原位杂交及性腺指数检测第49-55页
            2.4.4.1 PmRBL mRNA在dsRNA-p53干扰之后的表达分析第49-50页
            2.4.4.2 PmRBL mRNA在dsRNA-RBL干扰之后的表达分析第50-51页
            2.4.4.3 PmCDC2和PmCyclin B在dsRNA-RBL后的表达分析第51-53页
            2.4.4.4 原位杂交检测PmRBL的表达分析第53-54页
            2.4.4.5 性腺指数检测卵巢发育第54-55页
    2.5 讨论第55-58页
第三章 斑节对虾CHK1基因的克隆及功能分析第58-97页
    3.1 引言第58页
    3.2 实验材料第58-60页
        3.2.1 实验动物第58页
        3.2.2 实验仪器第58页
        3.2.3 实验试剂与配制第58-60页
    3.3 实验方法第60-75页
        3.3.1 实验用品预处理第60页
        3.3.2 总RNA提取和cDNA的合成第60页
        3.3.3 Chk1基因cDNA全长的克隆第60-63页
            3.3.3.1 开放阅读框的预测第60页
            3.3.3.2 引物的设计第60-62页
            3.3.3.3 PCR产物切胶回收第62页
            3.3.3.4 PCR产物连接和转化第62页
            3.3.3.5 挑取单克隆和菌液检测第62页
            3.3.3.6 RACE克隆基因 3'非编码区第62-63页
        3.3.4 Chk1基因组DNA全长的克隆第63-67页
            3.3.4.1 DNA提取第63-64页
            3.3.4.2 Chk1基因内含子的扩增第64页
            3.3.4.3 扩增Chk1基因 5’上游基因第64-67页
        3.3.5 PmChk1基因定量表达分析第67-68页
        3.3.6 PmChk1基因双链RNA干扰实验第68页
            3.3.6.1 构建pD7-Chk1和pD7-GFP重组载体第68页
            3.3.6.2 制备体外转录模板第68页
            3.3.6.3 双链RNA的体外转录及纯化第68页
            3.3.6.4 双链RNA的精制第68页
            3.3.6.5 dsRNA-Chk1注射实验第68页
        3.3.7 Chk1原位杂交试验第68页
        3.3.8 性腺指数(GSI)试验第68-69页
        3.3.9 序列分析与系统进化树的构建第69页
        3.3.10 PmChk1基因的体外重组、蛋白纯化及抗体制备第69-72页
            3.3.10.1 PmChk1-pET-30a-c(+)重组载体的构建第69-70页
            3.3.10.2 PmChk1-pET-30a-c(+)重组质粒诱导表达第70页
            3.3.10.3SDS-PAGE检测第70-71页
            3.3.10.4 蛋白免疫印迹(Western Blotting)第71页
            3.3.10.5 蛋白的纯化和抗体制备第71-72页
        3.3.11 注射dsRNA-Chk1后斑节对虾卵巢蛋白蛋白免疫印迹和组织酶活检测第72-74页
            3.3.11.1 卵巢组织蛋白的提取第72页
            3.3.11.2 蛋白浓度的测定第72页
            3.3.11.3 蛋白免疫印迹(Western Blotting)第72-73页
            3.3.11.4 组织Chk1激酶活性检测第73-74页
        3.3.12 数据分析第74-75页
    3.4 实验结果第75-93页
        3.4.1 PmChk1生物信息学分析第75-81页
            3.4.1.1 PmChk1的cDNA序列特征第75-77页
            3.4.1.2 PmChk1基因组结构和上游调节元件第77-79页
            3.4.1.3 PmChk1多重序列比对和系统进化树分析第79-81页
        3.4.2 PmChk1在组织、卵巢发育各期及个体发育各期的表达分析第81-83页
            3.4.2.1 PmChk1 mRNA在不同组织中的表达分析第81页
            3.4.2.2 PmChk1 mRNA在卵巢发育各期的表达分析第81-82页
            3.4.2.3 PmChk1 mRNA在个体发育各期的表达分析第82-83页
        3.4.3 PmChk1在 5-HT和DA刺激和眼柄切除后卵巢中的表达分析第83-84页
            3.4.3.1 PmChk1基因在 5-HT和DA刺激后卵巢中的表达分析第83-84页
            3.4.3.2 PmChk1基因在眼柄切除后卵巢中的表达分析第84页
        3.4.4 靶向沉默Chk1相关基因的表达分析、原位杂交、性腺指数及酶活的检测第84-92页
            3.4.4.1 PmChk1 mRNA在dsRNA-p53干扰之后的表达分析第84-85页
            3.4.4.2 PmChk1 mRNA在dsRNA-RBL干扰之后的表达分析第85-86页
            3.4.4.3 PmChk1 mRNA在dsRNA-Chk1干扰之后的表达分析第86-87页
            3.4.4.4 PmCDC2和PmCyclin B在dsRNA-Chk1后的表达分析第87-89页
            3.4.4.5 原位杂交检测PmChk1的表达分析第89-90页
            3.4.4.6 性腺指数检测卵巢发育第90-91页
            3.4.4.7 Chk1酶活检测第91-92页
        3.4.5 PmChk1的体外重组、纯化、抗体制备及免疫印迹第92-93页
            3.4.5.1 PmChk1的体外重组、纯化及抗体制备第92页
            3.4.5.2 注射dsRNA-Chk1后卵巢组织蛋白免疫印迹第92-93页
    3.5 讨论第93-97页
结论第97-99页
参考文献第99-108页
附录第108-109页
致谢第109页

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