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基于分子对接的牛布氏杆菌苏氨酰tRNA合成酶新型抑制剂的虚拟筛选及活性验证

摘要第4-6页
Abstract第6-7页
第一章 绪论第10-45页
    1 牛布氏杆菌的危害第10-11页
    2 苏氨酰tRNA合成酶的进展第11-17页
        2.1 苏氨酰tRNA合成酶的生物化学鉴定第11页
        2.2 ThrRS的生物化学鉴定第11-12页
        2.3 ThrRS的结构第12-17页
    3 分子对接的研究进展第17-32页
        3.1 对接理论第18-24页
        3.2 对接方法学第24-30页
        3.3 分子对接在药物研发中的应用实例第30-32页
        3.4 小结第32页
    4 同源建模的研究进展第32-43页
        4.1 同源或比较建模第34-35页
        4.2 同源建模的使用以鉴别蛋白结构性质,功能和机制第35-39页
        4.3 同源建模:先导化合物鉴定中的方法和应用第39-41页
        4.4 基于同源的先导化合物的优化和SAR合理化第41-43页
    5 研究目的及主要研究内容第43-45页
        5.1 研究目的第43页
        5.2 研究内容第43-45页
第二章 BaThrRS三维结构的建立第45-52页
    1 材料与方法第45页
        1.1 材料第45页
        1.2 方法第45页
    2 结果第45-51页
        2.1 BaThrRS氨基酸序列的获得第45-46页
        2.2 BaThrRS同源序列的搜索第46-47页
        2.3 BaThrRS三维结构模型的建立第47-48页
        2.4 BaThrRS三维结构模型的结构优化第48-49页
        2.5 BaThrRS初始三维结构模型与优化后模型的比较第49-51页
    3 讨论第51-52页
        3.1 模板的选取第51页
        3.2 分子动力学模拟的优化第51页
        3.3 小结第51-52页
第三章 BaThrRS新型抑制剂候选化合物的筛选第52-62页
    1 材料与方法第52-53页
        1.1 材料第52页
        1.2 方法第52-53页
    2 结果第53-61页
        2.1 BaThrRS活性位点的鉴定第53-54页
        2.2 勃利霉素与BaThrRS的分子对接第54-56页
        2.3 以BaThrRS为靶标的虚拟筛选第56-61页
    3 讨论第61-62页
        3.1 活性中心的确定第61页
        3.2 筛选库的确定第61页
        3.3 小结第61-62页
第四章 BaThrRS新型抑制剂的鉴定第62-74页
    1 材料与方法第62-65页
        1.1 材料和各种试剂第62-64页
        1.2 方法第64-65页
    2 结果第65-72页
        2.1 候选化合物的结构第65-70页
        2.2 候选化合物生物活性的初步验证第70-71页
        2.3 活性化合物MIC的测定第71-72页
    3 讨论第72-74页
        3.1 化合物的溶解性第72页
        3.2 pH对化合物稳定性的影响第72-73页
        3.3 小结第73-74页
第五章 总结第74-76页
    1 BaThrRS三维结构的同源建模结果第74页
    2 BaThrRS新型抑制剂虚拟筛选的结果第74页
    3 候选化合物活性验证实验的结果第74页
    4 研究创新点第74-75页
    5 展望第75-76页
参考文献第76-103页
个人简历第103-105页
致谢第105页

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