| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 缩略词表 | 第10-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-27页 |
| 1.1 畜禽舍内氨气概述 | 第11-15页 |
| 1.1.1 舍内氨气的性质和来源 | 第11-13页 |
| 1.1.2 舍内氨气浓度现状 | 第13-14页 |
| 1.1.3 氨气对畜禽生产的危害 | 第14-15页 |
| 1.2 转录组与转录组学 | 第15-17页 |
| 1.3 转录组研究方法 | 第17-21页 |
| 1.3.1 表达序列标签技术 | 第17-18页 |
| 1.3.2 基因表达序列分析 | 第18-19页 |
| 1.3.3 基因芯片技术 | 第19-20页 |
| 1.3.4 RNA-Seq | 第20-21页 |
| 1.4 RNA-Seq技术测序平台 | 第21-26页 |
| 1.4.1 Roche/454技术 | 第22-23页 |
| 1.4.2 lllumina/Solexa技术 | 第23-25页 |
| 1.4.3 ABI/SOLiD技术 | 第25-26页 |
| 1.5 本研究的意义 | 第26-27页 |
| 第二章 实验材料和方法 | 第27-33页 |
| 2.1 实验材料 | 第27-28页 |
| 2.1.1 实验动物和日粮 | 第27页 |
| 2.1.2 呼吸代谢舱 | 第27-28页 |
| 2.1.3 试剂盒 | 第28页 |
| 2.1.4 引物和Marker | 第28页 |
| 2.1.5 主要试剂和耗材 | 第28页 |
| 2.2 实验仪器设备 | 第28-29页 |
| 2.3 主要试剂的配制 | 第29-30页 |
| 2.3.1 总RNA提取所需试剂的配制 | 第29页 |
| 2.3.2 琼脂糖凝胶电泳所需试剂的配制 | 第29-30页 |
| 2.4 实验方法 | 第30-33页 |
| 2.4.1 实验肉鸡的饲养和管理 | 第30页 |
| 2.4.2 肉鸡生产性能测定 | 第30页 |
| 2.4.3 肉鸡体脂分布测定 | 第30页 |
| 2.4.4 肉鸡胸肌总RNA提取 | 第30-31页 |
| 2.4.5 cDNA文库构建和高通量测序 | 第31页 |
| 2.4.6 反转录合成cDNA | 第31-32页 |
| 2.4.7 荧光定量PCR | 第32-33页 |
| 第三章 结果与分析 | 第33-49页 |
| 3.1 试验一结果 | 第33-39页 |
| 3.1.1 高浓度氨气(75 ppm)对肉鸡生产性能的影响 | 第33页 |
| 3.1.2 胸肌高通量测序数据的统计结果 | 第33-35页 |
| 3.1.3 基因差异表达分析 | 第35-37页 |
| 3.1.4 RNA测序结果的qPCR验证 | 第37页 |
| 3.1.5 差异表达基因的通路分析 | 第37-39页 |
| 3.2 试验二结果 | 第39-45页 |
| 3.2.1 氨气(25 ppm)对肉鸡生产性能的影响 | 第39-40页 |
| 3.2.2 胸肌组织转录谱分析 | 第40-41页 |
| 3.2.3 基因差异表达分析 | 第41-42页 |
| 3.2.4 GO注释和通路分析 | 第42-44页 |
| 3.2.5 差异表达基因的qPCR验证 | 第44-45页 |
| 3.3 讨论 | 第45-49页 |
| 第四章 结论 | 第49-51页 |
| 参考文献 | 第51-63页 |
| 致谢 | 第63-65页 |
| 附录 | 第65-69页 |
| 博士后期间发表的文章和主持项目 | 第69-71页 |
| 个人简历 | 第71页 |