摘要 | 第3-5页 |
Abstract | 第5-7页 |
引言 | 第11-21页 |
1 研究背景 | 第11-19页 |
1.1 阳春砂及挥发性萜类 | 第11-13页 |
1.2 挥发性萜类生物合成途径及其关键酶的研究进展 | 第13-17页 |
1.3 挥发性萜类合酶基因的研究进展 | 第17-18页 |
1.4 生物信息学在功能基因挖掘中的应用 | 第18-19页 |
2 本课题组的研究思路及前期研究进展 | 第19-20页 |
3 本研究工作的总体思路、主要研究方法和预期结果 | 第20-21页 |
3.1 阳春砂转录组及表达谱数据整理及深入挖掘 | 第20页 |
3.2 目的基因编码区全长的克隆及序列分析 | 第20页 |
3.3 阳春砂单萜合酶基因表达模式分析 | 第20-21页 |
第一章 阳春砂挥发性萜类合酶基因的转录组分析 | 第21-33页 |
1 数据与方法 | 第21-22页 |
1.1 转录组与表达谱数据 | 第21页 |
1.2 转录组分析方法 | 第21-22页 |
2 结果与分析 | 第22-30页 |
2.1 已注释萜类合酶基因的整理 | 第22-24页 |
2.2 本地blast再注释萜类合酶基因的整理 | 第24-27页 |
2.3 AvTPS的同源进化分析 | 第27-30页 |
2.4 转录组间序列比对分析 | 第30页 |
3 讨论 | 第30-32页 |
4 小结 | 第32-33页 |
第二章 AvTPS编码区全长序列的克隆及其编码蛋白功能分析 | 第33-54页 |
1 材料、主要试剂与仪器 | 第33-34页 |
1.1 植物材料 | 第33页 |
1.2 菌株 | 第33页 |
1.3 载体 | 第33页 |
1.4 主要试剂 | 第33-34页 |
1.5 主要仪器设备 | 第34页 |
2 方法 | 第34-37页 |
2.1 AvTPS编码区全长序列的克隆 | 第34-37页 |
2.2 AvTPS编码蛋白的生物信息学分析 | 第37页 |
3 结果与分析 | 第37-53页 |
3.1 AvTPS全长编码区序列的克隆 | 第37-44页 |
3.2 AvTPS编码蛋白性质预测 | 第44-47页 |
3.3 AvTPS编码蛋白结构分析及多序列对比 | 第47-52页 |
3.4 AvTPS编码蛋白遗传进化分析 | 第52-53页 |
4 讨论 | 第53页 |
5 小结 | 第53-54页 |
第三章 AvTPS基因的表达变化及相关性分析 | 第54-65页 |
1 材料、主要试剂与仪器 | 第54页 |
1.1 植物材料 | 第54页 |
1.2 实验前期数据 | 第54页 |
1.3 主要试剂 | 第54页 |
1.4 主要仪器设备 | 第54页 |
2 方法 | 第54-56页 |
2.1 部分AvTPS表达水平检测 | 第54-55页 |
2.2 相关性分析及图表绘制 | 第55-56页 |
3 结果与分析 | 第56-62页 |
3.1 部分AvTPS荧光定量表达水平检测 | 第56-59页 |
3.2 AvTPS表达水平与挥发性萜类总量相关分析 | 第59-62页 |
3.3 AvTPS表达水平与各挥发性萜类的相关性分析 | 第62页 |
4 讨论 | 第62-64页 |
5 小结 | 第64-65页 |
第四章 结论与展望 | 第65-67页 |
1 结论 | 第65-66页 |
1.1 阳春砂挥发性萜类合酶相关基因AvTPS的挖掘 | 第65页 |
1.2 AvTPS编码区全长序列的克隆及其编码蛋白功能分析 | 第65页 |
1.3 AvTPS基因的表达水平变化及相关性分析 | 第65-66页 |
2 展望 | 第66-67页 |
参考文献 | 第67-70页 |
附录 | 第70-76页 |
发表论文与参与课题情况 | 第76-77页 |
致谢 | 第77-79页 |
统计学审核证明 | 第79页 |