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基于转录组数据的阳春砂挥发性萜类合酶基因的挖掘

摘要第3-5页
Abstract第5-7页
引言第11-21页
    1 研究背景第11-19页
        1.1 阳春砂及挥发性萜类第11-13页
        1.2 挥发性萜类生物合成途径及其关键酶的研究进展第13-17页
        1.3 挥发性萜类合酶基因的研究进展第17-18页
        1.4 生物信息学在功能基因挖掘中的应用第18-19页
    2 本课题组的研究思路及前期研究进展第19-20页
    3 本研究工作的总体思路、主要研究方法和预期结果第20-21页
        3.1 阳春砂转录组及表达谱数据整理及深入挖掘第20页
        3.2 目的基因编码区全长的克隆及序列分析第20页
        3.3 阳春砂单萜合酶基因表达模式分析第20-21页
第一章 阳春砂挥发性萜类合酶基因的转录组分析第21-33页
    1 数据与方法第21-22页
        1.1 转录组与表达谱数据第21页
        1.2 转录组分析方法第21-22页
    2 结果与分析第22-30页
        2.1 已注释萜类合酶基因的整理第22-24页
        2.2 本地blast再注释萜类合酶基因的整理第24-27页
        2.3 AvTPS的同源进化分析第27-30页
        2.4 转录组间序列比对分析第30页
    3 讨论第30-32页
    4 小结第32-33页
第二章 AvTPS编码区全长序列的克隆及其编码蛋白功能分析第33-54页
    1 材料、主要试剂与仪器第33-34页
        1.1 植物材料第33页
        1.2 菌株第33页
        1.3 载体第33页
        1.4 主要试剂第33-34页
        1.5 主要仪器设备第34页
    2 方法第34-37页
        2.1 AvTPS编码区全长序列的克隆第34-37页
        2.2 AvTPS编码蛋白的生物信息学分析第37页
    3 结果与分析第37-53页
        3.1 AvTPS全长编码区序列的克隆第37-44页
        3.2 AvTPS编码蛋白性质预测第44-47页
        3.3 AvTPS编码蛋白结构分析及多序列对比第47-52页
        3.4 AvTPS编码蛋白遗传进化分析第52-53页
    4 讨论第53页
    5 小结第53-54页
第三章 AvTPS基因的表达变化及相关性分析第54-65页
    1 材料、主要试剂与仪器第54页
        1.1 植物材料第54页
        1.2 实验前期数据第54页
        1.3 主要试剂第54页
        1.4 主要仪器设备第54页
    2 方法第54-56页
        2.1 部分AvTPS表达水平检测第54-55页
        2.2 相关性分析及图表绘制第55-56页
    3 结果与分析第56-62页
        3.1 部分AvTPS荧光定量表达水平检测第56-59页
        3.2 AvTPS表达水平与挥发性萜类总量相关分析第59-62页
        3.3 AvTPS表达水平与各挥发性萜类的相关性分析第62页
    4 讨论第62-64页
    5 小结第64-65页
第四章 结论与展望第65-67页
    1 结论第65-66页
        1.1 阳春砂挥发性萜类合酶相关基因AvTPS的挖掘第65页
        1.2 AvTPS编码区全长序列的克隆及其编码蛋白功能分析第65页
        1.3 AvTPS基因的表达水平变化及相关性分析第65-66页
    2 展望第66-67页
参考文献第67-70页
附录第70-76页
发表论文与参与课题情况第76-77页
致谢第77-79页
统计学审核证明第79页

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