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向日葵EST-SSR标记的开发及应用

摘要第3-4页
ABSTRACT第4-5页
1 引言第8-21页
    1.1 向日葵生物学特性及发展概况第8-10页
        1.1.1 向日葵的生物学特性第8页
        1.1.2 向日葵的重要性和国内发展情况第8页
        1.1.3 向日葵的育种概况第8-10页
    1.2 分子标记的概述第10-11页
        1.2.1 遗传标记的类型及特点第10页
        1.2.2 分子标记的类型和发展第10-11页
    1.3 EST-SSR标记第11-17页
        1.3.1 SSR分子标记第11-12页
        1.3.2 EST第12页
        1.3.3 EST分子标记的类型及特点第12-13页
        1.3.4 EST-SSR标记第13页
        1.3.5 EST-SSR标记引物的设计第13-15页
        1.3.6 EST-SSR标记的特性第15-16页
            1.3.6.1 植物ESTs中SSR的分布特点第15-16页
            1.3.6.2 EST-SSR扩增率及多态性第16页
        1.3.7 植物EST-SSR标记的应用第16-17页
    1.4 遗传图谱加密第17-18页
        1.4.1 构建遗传图谱的原理第17页
        1.4.2 作图群体的构建第17-18页
    1.5 本试验的研究目的及意义第18-20页
    1.6 研究技术路线第20-21页
2 材料与方法第21-30页
    2.1 向日葵EST-SSR标记的开发第21-28页
        2.1.1 EST序列的获得第21-22页
        2.1.2 EST序列的优化处理第22-23页
        2.1.3 EST序列的拼接和聚类第23-24页
        2.1.4 EST序列SSR位点的搜索第24-25页
        2.1.5 EST-SSR引物的设计第25-26页
        2.1.6 EST-SSR引物的电泳检测第26-28页
            2.1.6.1 实验材料第26页
            2.1.6.2 向日葵DNA的提取方法第26页
            2.1.6.3 DNA的定性检测第26页
            2.1.6.4 引物筛选第26页
            2.1.6.5 PCR反应体系和反应程序第26-27页
            2.1.6.6 PCR产物的电泳检测第27-28页
    2.2 向日葵遗传图谱的构建和加密第28-30页
        2.2.1 数据记录和统计分析第28-29页
        2.2.2 连锁分析和作图第29-30页
3 结果与分析第30-42页
    3.1 总DNA的提取第30页
    3.2 向日葵EST-SSR标记的开发第30-33页
        3.2.1 向日葵EST的序列长度与含SSR序列数第30页
        3.2.2 向日葵EST中SSR的频率与特点第30-33页
    3.3 向日葵EST-SSR引物的筛选第33页
    3.4 EST-SSR标记遗传连锁图谱的加密第33-42页
        3.4.1 RILs群体的EST-SSR标记分析第33-35页
        3.4.2 EST-SSR标记遗传连锁图谱的加密第35-42页
4 讨论第42-45页
    4.1 向日葵基因组DNA的提取第42页
    4.2 在EST中SSR的特征及设置参数的影响第42-43页
    4.3 引物的验证第43页
    4.4 向日葵EST-SSR标记和遗传连锁图谱的加密第43-44页
    4.5 遗传图谱的加密第44-45页
5 结论第45-47页
致谢第47-48页
参考文献第48-56页
作者简介第56页

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