| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6页 |
| 第1章 绪论 | 第8-11页 |
| 1.1 肿瘤细胞纯度估计概述 | 第8-9页 |
| 1.2 肿瘤细胞纯度对差异甲基化分析的意义 | 第9-10页 |
| 1.3 本文结构安排 | 第10-11页 |
| 第2章 R语言InfiniumPurify包的基本结构和功能 | 第11-17页 |
| 2.1 getPurity：基于DNA甲基化 450k芯片数据估计肿瘤细胞纯度 | 第11-12页 |
| 2.2 InfiniumDMC：考虑肿瘤细胞纯度来进行差异甲基化分析 | 第12-15页 |
| 2.3 InfiniumPurify：纯化肿瘤样本的甲基化水平 | 第15-16页 |
| 2.4 本章小结 | 第16-17页 |
| 第3章 InfiniumPurify包在TCGA数据库中的应用分析 | 第17-34页 |
| 3.1 研究背景和数据材料 | 第17-19页 |
| 3.2 肿瘤细胞纯度估计的模型与结果 | 第19-25页 |
| 3.2.1 getPurity:肿瘤纯度估计的模型 | 第19-20页 |
| 3.2.2 纯度估计模型的结果 | 第20-25页 |
| 3.3 差异甲基化区域估计的模型与结果 | 第25-28页 |
| 3.3.1 InfiniumDMC:考虑肿瘤细胞纯度的差异甲基化估计模型 | 第25页 |
| 3.3.2 模型结果 | 第25-28页 |
| 3.4 推断纯化的肿瘤甲基化的模型与结果 | 第28-33页 |
| 3.4.1 InfiniumPurify:纯肿瘤样本甲基化水平的估计模型 | 第28-30页 |
| 3.4.2 矫正纯度效应模型结果 | 第30-33页 |
| 3.5 本章小结 | 第33-34页 |
| 第4章 结论与展望 | 第34-36页 |
| 4.1 结论 | 第34-35页 |
| 4.2 课题展望 | 第35-36页 |
| 参考文献 | 第36-39页 |
| 致谢 | 第39页 |
