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太谷核不育小麦Ms2基因的图位克隆和功能解析

中文摘要第11-13页
英文摘要第13-14页
1 前言第15-38页
    1.1 植物雄性不育第15-24页
        1.1.1 植物雄性不育的类型及来源第15-17页
        1.1.2 农作物雄性不育机理的研究进展第17-23页
            1.1.2.1 农作物CMS研究进展第17-19页
            1.1.2.2 农作物GMS研究进展第19-23页
        1.1.3 作物雄性不育在杂交育种上的应用第23-24页
    1.2 太谷核不育小麦与Ms2基因第24-32页
        1.2.1 太谷核不育小麦的发现及特点第24-25页
        1.2.2 太谷核不育基因Ms2的研究进展第25-29页
            1.2.2.1 Ms2基因相关的细胞学研究第26-27页
            1.2.2.2 Ms2基因相关生理生化研究第27-28页
            1.2.2.3 Ms2基因的分子标记研究第28-29页
        1.2.3 太谷核不育小麦的应用第29-32页
            1.2.3.1 矮败小麦在轮回选择中的应用第30-31页
            1.2.3.2 Ms2基因与kr、ph1b基因的配合应用第31页
            1.2.3.3 Ms2基因在小麦近缘属种中的应用第31-32页
    1.3 小麦基因的图位克隆技术第32-37页
        1.3.1 图位克隆技术在小麦中的应用第32-33页
        1.3.2 作图群体的构建第33-34页
        1.3.3 DNA分子标记类型第34-36页
        1.3.4 目标基因区域的物理图谱第36-37页
    1.4 本研究目的及意义第37-38页
2 材料与方法第38-55页
    2.1 实验材料第38-39页
        2.1.1 植物材料第38页
        2.1.2 公共菌株和载体第38-39页
    2.2 材料种植及表型调查第39-40页
        2.2.1 植物材料的种植第39页
        2.2.2 小麦雄性器官的育性鉴定第39-40页
    2.3 遗传图谱的构建第40-42页
        2.3.1 亲本多态性检测及作图群体的构建第40-41页
        2.3.2 分子标记的开发第41-42页
        2.3.3 遗传图谱的构建第42页
    2.4 物理图谱的构建第42-45页
        2.4.1 BAC文库的构建和质量检测第42-43页
        2.4.2 BAC文库的筛选第43页
        2.4.3 BAC质粒的提取第43-44页
        2.4.4 阳性BAC质粒的de novo测序和物理图谱的构建第44-45页
    2.5 候选基因的鉴定及表达模式检测第45页
    2.6 TILLING技术及功能缺失突变体筛选第45-47页
        2.6.1 突变群体的创制第46页
        2.6.2 突变体的筛选第46-47页
    2.7 载体构建及遗传转化第47-50页
        2.7.1 载体构建第47-48页
        2.7.2 小麦的遗传转化第48-49页
        2.7.3 大麦的遗传转化第49页
        2.7.4 短柄草的遗传转化第49-50页
    2.8 Ms2蛋白的亚细胞定位第50-51页
        2.8.1 瞬时表达第50-51页
        2.8.2 稳定转化第51页
    2.9 RNA-Seq分析第51-53页
        2.9.1 植物样本的采集及RNA提取第51页
        2.9.2 cDNA文库的制备及测序第51-52页
        2.9.3 转录组数据的过滤第52页
        2.9.4 转录组数据的差异表达分析第52页
        2.9.5 差异基因的GO分析第52-53页
        2.9.6 基因表达热图第53页
    2.10 酵母双杂交实验第53-54页
    2.11 RNA组织原位杂交第54-55页
3 结果与分析第55-107页
    3.1 太谷核不育小麦的育性观察第55-57页
    3.2 Ms2基因遗传图谱的构建第57-65页
        3.2.1 亲本材料的遗传多态性分析第57-58页
        3.2.2 Ms2基因的初步定位第58-60页
        3.2.3 Ms2基因的精细定位第60-65页
    3.3 Ms2基因区域的物理图谱第65-73页
        3.3.1 LM15_(RMs2)基因组BAC文库的构建第65页
        3.3.2 Ms2区域BAC文库的筛选及物理图谱的构建第65-69页
        3.3.3 候选基因的预测和鉴定第69-71页
        3.3.4 PG5对应两个等位基因第71-73页
    3.4 PG5_(P1593S)基因突变体的创制及该基因的转化互补研究第73-82页
        3.4.1 PG5_(P1593S)基因的突变体分析第73-77页
        3.4.2 小麦转化互补实验第77-80页
        3.4.3 大麦转化互补试验第80-81页
        3.4.4 短柄草转化互补实验第81-82页
    3.5 Ms2表达模式分析第82-86页
        3.5.1 Ms2基因的时空表达模式第82-83页
        3.5.2 Ms2基因的组织原位杂交第83-84页
        3.5.3 MS2蛋白的亚细胞定位第84-86页
    3.6 MS2基因的遗传多样性第86-95页
        3.6.1 MS2基因的单倍型分析第86-87页
        3.6.2 MS2基因的进化及其所在区段的遗传多态性分析第87-94页
        3.6.3 MS2基因的遗传多样性分析第94-95页
    3.7 Ms2引起雄性不育的机理研究第95-107页
        3.7.1 RNA-Seq分析第95-98页
        3.7.2 酵母双杂交分析第98-107页
4 讨论第107-112页
    4.1 Ms2基因的图位克隆策略第107-108页
    4.2 Taigu转座子激活了Ms2基因的表达第108-109页
    4.3 Ms2基因在小麦育种中的应用第109-112页
5 结论第112-113页
参考文献第113-131页
附录第131-135页
致谢第135-136页
博士期间发表论文及申请专利第136页

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