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生物信息学中的不平衡学习新方法研究

摘要第3-4页
Abstract第4页
1 绪论第7-12页
    1.1 研究意义第7-9页
    1.2 研究背景第9-11页
    1.3 论文研究主要内容第11页
    1.4 论文的组织与结构第11-12页
2 不平衡学习的相关技术和性能评估方法第12-25页
    2.1 数据不平衡第12页
    2.2 不平衡学习的主要方法第12-17页
        2.2.1 数据层面第13-14页
        2.2.2 算法层面第14-15页
        2.2.3 集成层面第15-17页
        2.2.4 其他重要方法第17页
    2.3 不平衡学习的性能评估方法第17-24页
        2.3.1 基于混淆矩阵的方法第17-20页
        2.3.2 ROC曲线第20-21页
        2.3.3 PR曲线第21-22页
        2.3.4 代价曲线第22-23页
        2.3.5 分类器的评估方法第23-24页
    2.4 本章小结第24-25页
3 基于高斯混合模型的上采样算法GOS第25-47页
    3.1 不平衡二分类问题第25页
    3.2 高斯混合模型第25-28页
        3.2.1 概述第25-26页
        3.2.2 GMM参数估计第26-28页
    3.3 其他相关技术第28-33页
        3.3.1 数据清洗技术Tomek links第28页
        3.3.2 主成分分析和核主成分分析第28-30页
        3.3.3 支持向量机第30-33页
    3.4 主要思想第33-37页
        3.4.1 采样策略的选择第33-34页
        3.4.2 GOS算法第34-37页
    3.5 实验与分析第37-46页
        3.5.1 采样前后数据分布特征对比第37-42页
        3.5.2 UCI数据集上的实验结果第42-46页
    3.6 本章小结第46-47页
4 GOS方法在蛋白质-ATP绑定位点预测问题上的应用第47-60页
    4.1 引言第47-50页
    4.2 特征向量提取第50-53页
        4.2.1 位置特异性得分矩阵第50-52页
        4.2.2 蛋白质二级结构第52页
        4.2.3 滑动窗口技术第52-53页
    4.3 预测模型建立第53-57页
        4.3.1 稀疏表示第53-55页
        4.3.2 预测模型的建立第55-57页
    4.4 实验及结果分析第57-59页
        4.4.1 数据集第57页
        4.4.2 实验结果与比较第57-59页
    4.5 本章小结第59-60页
5 总结与展望第60-62页
    5.1 主要研究工作与总结第60页
    5.2 工作展望第60-62页
致谢第62-63页
参考文献第63-70页
附录第70页

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