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猪链球菌2型不同毒力菌株的鉴别及Pan-genome分析

摘要第7-9页
ABSTRACT第9-10页
第一篇 文献综述第11-25页
    第一章 猪链球菌2型毒力因子及研究方法进展第11-25页
        1 猪链球菌2型主要毒力因子第11-14页
            1.1 荚膜多糖第12页
            1.2 溶菌酶释放蛋白和胞外因子第12-13页
            1.3 溶血素第13页
            1.4 纤连蛋白/血纤蛋白原结合蛋白第13页
            1.5 谷氨酸脱氢酶第13-14页
            1.6 3-磷酸甘油醛脱氢酶第14页
            1.7 其他毒力因子第14页
        2 组学方法在猪链球菌研究中的应用第14-16页
            2.1 基因组学第14-15页
            2.2 蛋白质组学第15-16页
            2.3 转录组学第16页
        3 猪链球菌感染动物模型第16-19页
            3.1 猪模型第16-17页
            3.2 小鼠模型第17页
            3.3 斑马鱼模型第17-18页
            3.4 其他动物模型第18-19页
        参考文献第19-25页
第二篇 试验研究第25-93页
    第二章 猪链球菌2型弱毒菌株的筛选第25-43页
        1 材料与方法第26-32页
            1.1 材料第26-29页
            1.2 细菌培养条件及DNA提取第29-30页
            1.3 SS2菌株基因型的确定第30-32页
            1.4 SS2菌株毒力检测第32页
        2 结果第32-37页
            2.1 SS2菌株的基因型第32-35页
            2.2 SS2菌株LD_(50)第35页
            2.3 SS2菌株毒力水平第35-37页
        3 讨论第37-39页
        参考文献第39-43页
    第三章 猪链球菌2型Pan-genome分析第43-61页
        1 材料与方法第44-46页
            1.1 材料第44页
            1.2 猪链球菌2型菌株基因组提取及测序第44页
            1.3 猪链球菌2型基因聚类分析第44-46页
            1.4 猪链球菌2型进化关系分析第46页
            1.5 猪链球菌2型pan-genome和core-genome分析第46页
            1.6 猪链球菌2型MLST分型第46页
            1.7 猪链球菌2型菌毛分型第46页
            1.8 (前)噬菌体预测第46页
            1.9 毒力相关基因在SS2基因组中的同源性分析第46页
        2 结果第46-54页
            2.0 猪链球菌2型菌株测序结果第47页
            2.1 猪链球菌2型进化关系第47-48页
            2.2 猪链球菌2型COG功能分析第48-49页
            2.3 猪链球菌2型pan-genome第49-50页
            2.4 猪链球菌2型core-genome第50-51页
            2.5 强、弱毒株核心基因组的比较第51页
            2.6 猪链球菌2型MLST分型第51页
            2.7 猪链球菌2型菌毛分型第51页
            2.8 (前)噬菌体序列第51-54页
            2.9 毒力相关基因mrp,epf,sly在不同SS2中的同源性第54页
        3 讨论第54-56页
        参考文献第56-61页
    第四章 mrp基因型与猪链球菌2型菌株毒力的关系第61-75页
        1 材料与方法第62-66页
            1.1 材料第62-63页
            1.2 不同SS2菌株中mrp基因同源性分析第63-64页
            1.3 PCR检测mrp基因在SS2菌株中的分布第64-65页
            1.4 不同mrp基因型菌株毒力水平的测定第65页
            1.5 细菌总RNA的提取及反转录第65-66页
            1.6 不同mrp基因型菌株中mrp转录水平的测定第66页
        2 结果第66-70页
            2.1 不同SS2菌株中mrp基因同源性第66-67页
            2.2 mrp基因在SS2菌株中的分布第67-68页
            2.3 不同mrp基因型菌株的毒力水平第68-69页
            2.4 统计分析SS2菌株毒力水平第69页
            2.5 不同mrp基因型菌株中mrp转录水平第69-70页
        3 讨论第70-71页
        参考文献第71-75页
    第五章 猪链球菌2型pnuC基因缺失株的构建及致病性分析第75-93页
        1 材料与方法第76-85页
            1.1 材料第76-79页
            1.2 pnuC基因生物信息学分析第79-80页
            1.3 pnuC基因在SS2菌株中的分布第80-81页
            1.4 pnuC基因缺失株的构建第81-85页
            1.5 斑马鱼毒力实验第85页
        2 结果第85-88页
            2.1 pnuC基因生物信息学分析第85页
            2.2 pnuC基因在SS2菌株中的分布第85-86页
            2.3 缺失重组质粒的构建第86-87页
            2.4 pnuC基因缺失株的筛选第87页
            2.5 缺失株与野生株毒力比较第87-88页
        3 讨论第88-89页
        参考文献第89-93页
全文总结第93-95页
致谢第95-97页
发表与待发表文章第97页

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