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副溶血性弧菌toxR-S PCR检测方法的建立和华东地区分子流行特征分析

摘要第7-9页
ABSTRACT第9-10页
上篇 文献综述第11-37页
    第一章 副溶血性弧菌的分离和检测第11-23页
        1 副溶血性弧菌的生物学特征第11-13页
            1.1 菌株分类地位第11页
            1.2 菌体形态第11页
            1.3 培养特性第11-12页
            1.4 生化特性与鉴定第12-13页
        2 副溶血性弧菌分离鉴定方法第13-18页
            2.1 传统方法第13-15页
            2.2 聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)第15-17页
            2.3 核酸杂交法(Nucleic Acid Hybridization)第17页
            2.4 环介导等温扩增技术(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP)第17-18页
        参考文献第18-23页
    第二章 副溶血性弧菌的分型方法和毒力相关基因研究第23-37页
        1 副溶血性弧菌分型方法第23-25页
            1.1 血清型分型第23页
            1.2 依赖PCR的分子分型技术第23-24页
            1.3 不依赖PCR的分子分型技术第24-25页
        2 副溶血性弧菌的主要毒力因子第25-30页
            2.1 溶血素第25-26页
            2.2 Ⅲ型分泌系统第26-27页
            2.3 Ⅵ型分泌系统第27页
            2.4 粘附素第27-28页
            2.5 尿素酶(Urease)第28页
            2.6 大流行株相关毒力基因第28-30页
        参考文献第30-37页
下篇 试验部分第37-79页
    第三章 toxR-S为靶基因的副溶血性弧菌分子检测方法的建立及评价第37-55页
        1 材料与方法第39-43页
            1.1 菌株及其来源第39-40页
            1.2 主要试剂和仪器第40-41页
            1.3 序列分析和引物设计第41页
            1.4 细菌基因组提取第41页
            1.5 PCR反应条件的优化第41页
            1.6 PCR产物测序比对第41-42页
            1.7 特异性试验第42页
            1.8 敏感性试验第42页
            1.9 重复性试验第42页
            1.10 PCR与国标方法对海产品的检测第42-43页
        2 结果与分析第43-47页
            2.1 序列分析和引物设计第43-44页
            2.2 PCR反应条件的优化第44-45页
            2.3 阳性产物测序第45页
            2.4 特异性试验第45-46页
            2.5 敏感性试验第46页
            2.6 重复性试验第46页
            2.7 toxR-S PCR与国标方法对海产品的检测结果第46-47页
        3 讨论第47-50页
        参考文献第50-55页
    第四章 华东地区副溶血性弧菌的分子流行特征分析第55-79页
        1 材料和方法第57-61页
            1.1 菌株及其来源第57页
            1.2 主要试剂和仪器第57页
            1.3 海鲜样品的采集第57页
            1.4 菌株的分离第57-59页
            1.5 细菌基因组提取第59页
            1.6 引物信息和PCR反应体系第59-61页
            1.7 数据分析第61页
        2 结果与分析第61-74页
            2.1 菌株分离第61-64页
            2.2 等位基因和ST型第64页
            2.3 聚类分析和克隆复合体第64-65页
            2.4 聚类关系与宿主来源第65-67页
            2.5 大流行株毒力相关基因分布第67-72页
            2.6 系统发育与大流行相关毒力、宿主来源关系分析第72-74页
        3 讨论第74-75页
        参考文献第75-79页
全文总结第79-81页
致谢第81页

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