| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 缩略词表 | 第10-11页 |
| 前言 | 第11-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-26页 |
| ·植物蜡质合成途径 | 第12-13页 |
| ·蜡质基因研究进展 | 第13-17页 |
| ·模式植物蜡质合成相关基因研究进展 | 第13-16页 |
| ·柑橘蜡质合成相关基因研究进展 | 第16-17页 |
| ·RNA-Seq技术研究进展 | 第17-19页 |
| ·转录组定义及研究目的 | 第17页 |
| ·传统转录组研究方法 | 第17-18页 |
| ·RNA-Seq及其优势 | 第18页 |
| ·RNA-Seq测序平台及流程 | 第18-19页 |
| ·RNA-Seq在植物中的应用 | 第19-22页 |
| ·在sRNA发现中的应用 | 第19-20页 |
| ·转录图谱中的应用 | 第20页 |
| ·测量基因表达水平方面的应用 | 第20-21页 |
| ·在转录组重新注释方面的应用 | 第21页 |
| ·在转录后调节方面的应用 | 第21-22页 |
| ·RNA-Seq在柑橘中的应用 | 第22页 |
| ·RT-qPCR与RNA-Seq在果树中的结合应用 | 第22-23页 |
| ·RT-qPCR | 第23-24页 |
| ·RT-qPCR原理 | 第23页 |
| ·RT-qPCR种类 | 第23-24页 |
| ·RT-qPCR优势 | 第24页 |
| ·RT-qPCR应用 | 第24页 |
| ·本项目研究内容、研究目标 | 第24-26页 |
| ·研究内容 | 第24-25页 |
| ·研究目标 | 第25-26页 |
| 第二章 纽荷尔脐橙果皮RNA的提取 | 第26-30页 |
| ·实验材料 | 第26页 |
| ·实验材料及其准备 | 第26页 |
| ·实验试剂及其配制 | 第26页 |
| ·实验主要仪器与设备 | 第26页 |
| ·试验方法 | 第26-28页 |
| ·经典抽提试剂盒(Trizol法)抽提果皮总RNA | 第27页 |
| ·改良Trizol法抽提果皮总RNA | 第27-28页 |
| ·结果与分析 | 第28-30页 |
| ·不同提取方法RNA质量检测 | 第28页 |
| ·不同提取方法提取总RNA完整性检测 | 第28-29页 |
| ·小结与讨论 | 第29-30页 |
| 第三章 母本纽荷尔脐橙及果皮光泽型突变体转录组测序分析 | 第30-46页 |
| ·材料与方法 | 第30-31页 |
| ·实验材料 | 第30页 |
| ·试验方法 | 第30页 |
| ·转录组测序步骤及信息分析流程 | 第30-31页 |
| ·结果与分析 | 第31-43页 |
| ·RNA质量检测 | 第31-32页 |
| ·转录组测序结果 | 第32-43页 |
| ·小结与讨论 | 第43-46页 |
| ·柑橘转录组研究分析 | 第43-44页 |
| ·蜡质合成相关基因分析 | 第44页 |
| ·其它差异表达途径分析 | 第44-45页 |
| ·RNA-Seq在转录后调节的分析 | 第45-46页 |
| 第四章 母本纽荷尔脐橙与突变体脐橙差异基因筛选及表达分析 | 第46-62页 |
| ·材料与方法 | 第46-49页 |
| ·实验材料 | 第46页 |
| ·主要试剂 | 第46页 |
| ·主要仪器设备 | 第46页 |
| ·引物设计与合成 | 第46-48页 |
| ·试验方法 | 第48-49页 |
| ·结果与分析 | 第49-62页 |
| ·变异与对照脐橙RNA纯度分析 | 第49-50页 |
| ·蜡质合成相关差异表达基因筛选结果 | 第50-51页 |
| ·蜡质合成相关差异基因表达分析 | 第51-58页 |
| ·结论与讨论 | 第58-62页 |
| 第五章 CER1-1,CER1-2,KCS-1基因克隆与序列分析 | 第62-79页 |
| ·材料与方法 | 第62-65页 |
| ·实验材料 | 第62页 |
| ·主要试剂 | 第62页 |
| ·第一链cDNA合成 | 第62页 |
| ·回收纯化的目的片段与克隆载体的连接 | 第62-63页 |
| ·T载体连接 | 第63-64页 |
| ·PCR扩增获得目的基因片段 | 第64-65页 |
| ·结果与分析 | 第65-77页 |
| ·基因克隆PCR结果 | 第65页 |
| ·CER1基因家族基因CER1-1(Cs4g02580)的克隆及序列分析 | 第65-69页 |
| ·CER1基因家族基因CER1-2(Cs1g02760)的克隆及序列分析 | 第69-73页 |
| ·KCS基因家族基因KCS-1(Cs4g06430)的克隆及序列分析 | 第73-77页 |
| ·结论与讨论 | 第77-79页 |
| 第六章 总结与展望 | 第79-81页 |
| 参考文献 | 第81-93页 |
| 致谢 | 第93-94页 |
| 附录 | 第94-97页 |
