| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 缩略词表 | 第8-9页 |
| 1 绪论 | 第9-15页 |
| ·地衣芽孢杆菌概述 | 第9-11页 |
| ·地衣芽孢杆菌总体概述 | 第9页 |
| ·地衣芽孢杆菌基因组研究进展 | 第9-10页 |
| ·γ-PGA生物合成及调控研究进展 | 第10-11页 |
| ·全基因组规模代谢网络的构建与应用 | 第11-14页 |
| ·代谢网络简介 | 第11页 |
| ·基因组规模代谢网络构建及研究现状 | 第11-12页 |
| ·全基因组规模代谢网络的应用 | 第12-14页 |
| ·本研究的目的及意义 | 第14页 |
| ·本研究的主要工作及内容安排 | 第14-15页 |
| 2 材料与方法 | 第15-21页 |
| ·代谢网络构建 | 第15-18页 |
| ·代谢网络构建所需数据库 | 第15-16页 |
| ·代谢网络构建方法 | 第16-18页 |
| ·获取生物量目标方程 | 第18-19页 |
| ·将模型转化为数学模型 | 第19页 |
| ·代谢网络模型的校正 | 第19-21页 |
| 3. 结果与分析 | 第21-35页 |
| ·地衣芽孢杆菌WX-02基因组规模代谢网络基本特性分析 | 第21-23页 |
| ·代谢网络模型可视化及拓扑结构分析 | 第23-24页 |
| ·底物利用能力分析 | 第24-28页 |
| ·引言 | 第24-25页 |
| ·基于表型芯片实验的底物利用能力分析 | 第25-26页 |
| ·地衣芽孢杆菌WX-02与其他物种的底物利用能力差异比较 | 第26-28页 |
| ·模型的模拟分析 | 第28-29页 |
| ·引言 | 第28页 |
| ·必需基因的模拟 | 第28-29页 |
| ·地衣芽孢杆菌WX-02产γ-PGA的代谢途径分析 | 第29-35页 |
| ·引言 | 第29-30页 |
| ·利用OptKnock对γ-PGA产量最大化的代谢途径优化 | 第30-31页 |
| ·代谢网络中重要节点及γ-PGA合成途径分析 | 第31-35页 |
| 4 结论与展望 | 第35-36页 |
| 参考文献 | 第36-43页 |
| 附录 | 第43-47页 |
| 致谢 | 第47页 |
