DNA序列模体识别问题的迭代算法
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 目录 | 第6-8页 |
| 1 绪论 | 第8-11页 |
| ·生物背景及意义 | 第8页 |
| ·研究现状 | 第8-10页 |
| ·本文工作 | 第10页 |
| ·本章小结 | 第10-11页 |
| 2 相关生物知识介绍 | 第11-17页 |
| ·基因表达 | 第11-13页 |
| ·转录阶段 | 第11-12页 |
| ·翻译阶段 | 第12-13页 |
| ·基因调控 | 第13-16页 |
| ·转录因子 | 第14-15页 |
| ·转录因子结合位点 | 第15-16页 |
| ·本章小结 | 第16-17页 |
| 3 模体识别问题 | 第17-23页 |
| ·问题描述 | 第17页 |
| ·模体的表示方法 | 第17-20页 |
| ·一致序列表示 | 第17-19页 |
| ·矩阵表示 | 第19页 |
| ·Logo表示 | 第19-20页 |
| ·模体的打分方式 | 第20-22页 |
| ·信息量 | 第20-21页 |
| ·一致性得分 | 第21页 |
| ·适应度得分 | 第21-22页 |
| ·本章小结 | 第22-23页 |
| 4 模体识别的计算方法介绍 | 第23-32页 |
| ·利用遗传算法识别模体 | 第24-26页 |
| ·遗传算法介绍 | 第24-25页 |
| ·遗传算法识别模体 | 第25-26页 |
| ·利用蚁群算法识别模体 | 第26-28页 |
| ·蚁群算法介绍 | 第26-27页 |
| ·蚁群算法识别模体 | 第27-28页 |
| ·利用Gibbs采样识别模体 | 第28-31页 |
| ·Gibbs采样介绍 | 第28页 |
| ·利用Gibbs采样识别模体 | 第28-31页 |
| ·本章小结 | 第31-32页 |
| 5 模体识别的迭代算法 | 第32-40页 |
| ·算法介绍 | 第32-36页 |
| ·个体编码 | 第32页 |
| ·初始种群 | 第32页 |
| ·个体适应度 | 第32-34页 |
| ·变异操作 | 第34页 |
| ·加一操作 | 第34-35页 |
| ·混合操作 | 第35页 |
| ·算法描述 | 第35-36页 |
| ·实验结果 | 第36-39页 |
| ·模拟数据 | 第36页 |
| ·真实生物数据 | 第36-39页 |
| ·本章小结 | 第39-40页 |
| 结论 | 第40-41页 |
| 参考文献 | 第41-43页 |
| 攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第43-44页 |
| 致谢 | 第44-45页 |
