| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 目录 | 第8-10页 |
| 1 序言 | 第10-19页 |
| ·辣椒病毒病危害现状 | 第10-11页 |
| ·侵染黄灯笼辣椒的病毒研究进展 | 第11-12页 |
| ·辣椒环斑病毒研究进展 | 第11页 |
| ·黄瓜花叶病毒研究进展 | 第11页 |
| ·辣椒脉斑驳病毒研究进展 | 第11-12页 |
| ·马铃薯Y病毒属研究进展 | 第12-14页 |
| ·马铃薯Y病毒属基因组结构特征 | 第12-13页 |
| ·编码蛋白的主要功能 | 第13-14页 |
| ·病毒的复制与运动 | 第14页 |
| ·马铃薯Y病毒属定种标准 | 第14页 |
| ·辣椒环斑病毒全基因组克隆策略 | 第14-17页 |
| ·辣椒环斑病毒基因组3'端克隆策略 | 第14-15页 |
| ·辣椒环斑病毒基因组克隆策略 | 第15-16页 |
| ·辣椒环斑病毒基因组5'端克隆策略 | 第16-17页 |
| ·本研究的目的及意义 | 第17-18页 |
| ·本研究的技术路线 | 第18-19页 |
| 2 材料与方法 | 第19-31页 |
| ·材料 | 第19-21页 |
| ·植物材料 | 第19页 |
| ·质粒和菌株 | 第19-20页 |
| ·主要试剂 | 第20页 |
| ·主要仪器 | 第20-21页 |
| ·数据分析软件 | 第21页 |
| ·方法 | 第21-31页 |
| ·辣椒环斑病毒基因组3'端克隆 | 第21-25页 |
| ·辣椒环斑病毒基因组克隆 | 第25-27页 |
| ·辣椒环斑病毒基因组5'端克隆 | 第27-30页 |
| ·序列分析与系统进化树分析 | 第30-31页 |
| 3 结果与分析 | 第31-42页 |
| ·辣椒病叶总RNA的电泳检测 | 第31页 |
| ·3'端序列PCR扩增 | 第31-32页 |
| ·辣椒环斑病毒基因组3'端序列分析 | 第32页 |
| ·基因组步移法的多次PCR扩增 | 第32-33页 |
| ·基因组步移法获得各段克隆的测序 | 第33-34页 |
| ·Inner PCR反应 | 第34页 |
| ·5'端测序与全基因组序列拼接 | 第34-35页 |
| ·全基因组序列分析 | 第35-36页 |
| ·ChiRSV-HN/Yingzhou基因组的保守结构域 | 第36页 |
| ·与ChiVMV-WC基因组比较分析 | 第36-37页 |
| ·与属内其它病毒比较分析 | 第37-40页 |
| ·系统进化树分析 | 第40-42页 |
| 4 讨论 | 第42-46页 |
| ·OiiRSV-HN/Yingzhou的发现过程对发现新病毒的借鉴作用 | 第42页 |
| ·马铃薯Y病毒属全基因组克隆策略的比较 | 第42-43页 |
| ·不同ChiRSV分离物出现症状差异的可能原因 | 第43页 |
| ·ChiRSV与ChiVMV在黄灯笼辣椒中的关系 | 第43-44页 |
| ·ChiRSV-HN/Yingzhou的基因功能推测 | 第44-46页 |
| 5 结论 | 第46-47页 |
| 参考文献 | 第47-52页 |
| 附录 | 第52-64页 |
| 附录A 缩略词 | 第52-53页 |
| 附录B 常用试剂、培养基及缓冲液配制 | 第53-54页 |
| 附录C ChiRSV-HN/Yingzhou全基因组各克隆测序结果 | 第54-59页 |
| 附录D ChiRSV-HN/Yingzhou全基因组序列 | 第59-64页 |
| 项目资助 | 第64-65页 |
| 作者读研期间发表论文 | 第65-66页 |
| 致谢 | 第66页 |
