| 符号及缩略词 | 第5-9页 |
| 中文摘要 | 第9-10页 |
| Abstract | 第10页 |
| 1 前言 | 第12-24页 |
| 1.1 猪流感的流行概况 | 第12-15页 |
| 1.1.1 类禽型SIV | 第12-13页 |
| 1.1.2 经典型SIV | 第13页 |
| 1.1.3 类人型SIV | 第13-14页 |
| 1.1.4 其他亚型SIV | 第14-15页 |
| 1.2 猪流感病原、致病性以及分子基础研究 | 第15-17页 |
| 1.2.1 猪流感病毒 | 第15页 |
| 1.2.2 SIV的致病性 | 第15-16页 |
| 1.2.3 SIV的分子基础研究 | 第16-17页 |
| 1.3 SIV基因组及主要结构 | 第17-18页 |
| 1.4 SIV基因所编码蛋白的结构与功能 | 第18-21页 |
| 1.4.1 血凝素(hemagg lutinin,HA) | 第18-19页 |
| 1.4.2 神经氨酸酶(Neuraminidase,NA) | 第19页 |
| 1.4.3 核蛋白(Nucleoprotein,NP) | 第19页 |
| 1.4.4 基质蛋白(Matrix Protein,M) | 第19-20页 |
| 1.4.5 非结构蛋白(Nonstructural protein,NS) | 第20页 |
| 1.4.6 聚合酶蛋白(Polymerase) | 第20-21页 |
| 1.5 SIV的复制 | 第21页 |
| 1.6 SIV种间传播机制 | 第21-22页 |
| 1.7 SIV的抗原变异 | 第22-23页 |
| 1.8 本研究的目的和意义 | 第23-24页 |
| 2 材料与方法 | 第24-26页 |
| 2.1 材料 | 第24页 |
| 2.2 主要试剂及引物 | 第24-25页 |
| 2.3 方法 | 第25-26页 |
| 2.3.1 样品的采集及处理 | 第25页 |
| 2.3.2 病毒的分离与纯化 | 第25页 |
| 2.3.3 病毒RNA的提取及反转录 | 第25-26页 |
| 2.3.4 病毒亚型鉴定、基因片段的PCR扩增及产物回收 | 第26页 |
| 2.3.5 病毒全基因序列测定 | 第26页 |
| 2.3.6 序列的拼接与分析 | 第26页 |
| 3 结果 | 第26-46页 |
| 3.1 病毒的分离鉴定及全基因组扩增 | 第26-27页 |
| 3.2 HA基因的分析 | 第27-31页 |
| 3.2.1 核苷酸的遗传进化分析 | 第27页 |
| 3.2.2 同源性分析 | 第27-29页 |
| 3.2.3 氨基酸序列分析 | 第29-31页 |
| 3.3 NA基因的分析 | 第31-34页 |
| 3.3.1 核苷酸的遗传进化分析 | 第31页 |
| 3.3.2 同源性分析 | 第31-32页 |
| 3.3.3 氨基酸的序列分析 | 第32-34页 |
| 3.4 PB2基因的分析 | 第34-35页 |
| 3.4.1 核苷酸的遗传进化分析 | 第34页 |
| 3.4.2 同源性分析 | 第34-35页 |
| 3.5 PB1基因的分析 | 第35-37页 |
| 3.5.1 核苷酸的遗传进化分析 | 第35-36页 |
| 3.5.2 同源性分析 | 第36-37页 |
| 3.6 PA基因的分析 | 第37-39页 |
| 3.6.1 核苷酸的遗传演化分析 | 第37-38页 |
| 3.6.2 同源性分析 | 第38-39页 |
| 3.7 NP基因的分析 | 第39-41页 |
| 3.7.1 核苷酸的遗传进化分析 | 第39-40页 |
| 3.7.2 同源性分析 | 第40-41页 |
| 3.8 M基因的分析 | 第41-43页 |
| 3.8.1 核苷酸的遗传进化分析 | 第41-42页 |
| 3.8.2 同源性分析 | 第42-43页 |
| 3.9 NS基因的分析 | 第43-46页 |
| 3.9.1 核苷酸的遗传进化分析 | 第43-44页 |
| 3.9.2 同源性分析 | 第44-46页 |
| 3.10 病毒8个基因节段的基因组成分析 | 第46页 |
| 4 讨论 | 第46-48页 |
| 5 结论 | 第48-49页 |
| 参考文献 | 第49-57页 |
| 致谢 | 第57页 |
