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BHD综合征因子FLCN调控氨基酸转运蛋白PAT1在细胞内定位的机制研究

摘要第7-9页
ABSTRACT第9-11页
第一章 文献综述第16-39页
    1.1 FLCN研究进展第16-23页
        1.1.1 FLCN的结构第16-18页
        1.1.2 FLCN的功能第18-19页
        1.1.3 FLCN在mTORC1信号通路中的作用第19-22页
        1.1.4 FLCN在囊泡运输中的潜在功能第22-23页
    1.2 氨基酸转运蛋白PAT1研究进展第23-29页
        1.2.1 PAT1的结构第24-25页
        1.2.2 PAT1在细胞内的定位第25-27页
        1.2.3 PAT1在mTORC1信号通路中的作用第27-29页
    1.3 Rab蛋白与囊泡运输第29-33页
        1.3.1 Rab蛋白家族第29-30页
        1.3.2 Rab蛋白活性的调控第30-31页
        1.3.3 Rab蛋白在囊泡运输中的功能第31-33页
    1.4 Rab11研究进展第33-37页
        1.4.1 Rab11蛋白家族第33-34页
        1.4.2 Rab11活性调节蛋白第34-35页
        1.4.3 Rab11的效应因子第35-36页
        1.4.4 Rab11在囊泡运输中的功能第36-37页
    1.5 前期研究发现及本研究设想第37-39页
        1.5.1 前期研究发现第37-38页
        1.5.2 本研究设想第38-39页
第二章 PAT1在HEK293细胞内的定位及运输途径第39-55页
    2.1 材料第39-41页
        2.1.1 细胞、载体和抗体第39-40页
        2.1.2 主要试剂第40页
        2.1.3 主要仪器第40-41页
    2.2 实验方法第41-48页
        2.2.1 构建真核表达载体第41-44页
        2.2.2 稳定表达PAT1-3×FLAG细胞株的构建第44-46页
        2.2.3 细胞免疫荧光染色检测myc-PAT1的表达定位第46-48页
    2.3 结果与分析第48-53页
        2.3.1 重组质粒的酶切鉴定第48-49页
        2.3.2 稳定表达PAT1-3×FLAG细胞株的Westernblot鉴定第49页
        2.3.3 myc-PAT1与mCherry融合的不同囊泡标记蛋白的共定位第49-51页
        2.3.4 myc-PAT1与内源囊泡标记蛋白的共定位第51-52页
        2.3.5 myc-PAT1与TGN38、M6PR、EEA1以及Chmp5蛋白的共定位第52-53页
        2.3.6 PAT1-3×FLAG的间接运输途径第53页
    2.4 讨论第53-54页
    2.5 小结第54-55页
第三章 FLCN对PAT1在细胞内分布的影响第55-69页
    3.1 材料第55-56页
        3.1.1 细胞、载体和抗体第55页
        3.1.2 siRNA序列第55-56页
        3.1.3 主要试剂第56页
    3.2 实验方法第56-61页
        3.2.1 FLCN对PAT1溶酶体定位的影响第56-57页
        3.2.2 FLCN对PAT1细胞膜定位的影响第57-58页
        3.2.3 细胞免疫荧光检测FLCN对PAT1胞内定位的影响第58页
        3.2.4 FLCN对PAT1调控mTORC1活性的影响第58-59页
        3.2.5 荧光定量PCR检测PAT1siRNA的干扰效率第59-61页
    3.3 结果与分析第61-67页
        3.3.1 抑制FLCN对PAT1-3×FLAG溶酶体定位的影响第61-62页
        3.3.2 抑制FLCN对PAT1-3×FLAG细胞膜定位的影响第62-63页
        3.3.3 细胞免疫荧光检测FLCN对PAT1细胞内定位的影响第63页
        3.3.4 敲除FLCN对PAT1-3×FLAG溶酶体定位的影响第63-64页
        3.3.5 敲除FLCN对PAT1-3×FLAG细胞膜定位的影响第64-65页
        3.3.6 FLCN在PAT1过表达条件下对mTORC1的影响第65-66页
        3.3.7 FLCN在抑制PAT1条件下对mTORC1的影响第66-67页
    3.4 讨论第67-68页
    3.5 小结第68-69页
第四章 FLCN与Rab11A存在蛋白与蛋白间相互作用第69-79页
    4.1 材料第69-70页
        4.1.1 细胞、载体和抗体第69页
        4.1.2 主要试剂第69-70页
    4.2 实验方法第70-72页
        4.2.1 FLCN(1-340 AA)和FLCN(341-579 AA)重组质粒的构建第70-71页
        4.2.2 FLCN与Rab5A,Rab7A以及Rab11A的共定位第71页
        4.2.3 蛋白免疫共沉淀(co-IP)第71-72页
    4.3 结果与分析第72-77页
        4.3.1 FLCN重组质粒的酶切鉴定结果第72-73页
        4.3.2 FLCN与GFP-Rab5A,GFP-Rab7A以及GFP-Rab11A的共定位分析以及GFP-Rab11A的共定位分析第73页
        4.3.3 FLCN与Rab5A, Rab7A以及Rab11A的co-IP结果第73-74页
        4.3.4 mFLCN与鼠源Rab5A,Rab7A以及Rab11A的co-IP结果第74-75页
        4.3.5 FLCN通过DENN结构域与GFP-Rab11A结合第75-76页
        4.3.6 FLCN可以结合GFP-Rab11B第76-77页
    4.4 讨论第77-78页
    4.5 小结第78-79页
第五章Rab11A调控PAT1在溶酶体和细胞膜上的定位第79-93页
    5.1 材料第79-80页
        5.1.1 细胞、载体和抗体第79页
        5.1.2 Rab11A干扰慢病毒第79-80页
        5.1.3 主要试剂第80页
    5.2 实验方法第80-84页
        5.2.1 Rab11A-CA和Rab11A-DN过表达载体的构建第80-82页
        5.2.2 抑制Rab11A表达对PAT1溶酶体和细胞膜定位的影响第82页
        5.2.3 过表达Rab11A-DN突变体对PAT1溶酶体和细胞膜定位的影响第82-83页
        5.2.4 细胞免疫荧光检测Rab11A对PAT1胞内定位的影响第83页
        5.2.5 抑制Rab11A对PAT1蛋白稳定性的影响第83页
        5.2.6 Rab11A对PAT1调控mTORC1活性的影响第83-84页
    5.3 结果与分析第84-91页
        5.3.1 Rab11A-CA和Rab11A-DN重组质粒的酶切鉴定结果第84-85页
        5.3.2 抑制Rab11A表达促进PAT1在溶酶体上定位第85-86页
        5.3.3 抑制Rab11A表达抑制PAT1在细胞膜定位第86页
        5.3.4 过表达Rab11A-DN(S25N)突变体对PAT1溶酶体定位的影响第86-87页
        5.3.5 过表达Rab11A-DN(S25N)突变体对PAT1细胞膜定位的影响第87-88页
        5.3.6 细胞免疫荧光检测Rab11A对PAT1细胞内定位的影响第88-89页
        5.3.7 抑制Rab11A促进PAT1被溶酶体降解第89-90页
        5.3.8 Rab11A拮抗PAT1抑制mTORC1的作用第90-91页
    5.4 讨论第91-92页
    5.5 小结第92-93页
第六章FLCN在Rab11A介导的囊泡运输中的功能研究第93-100页
    6.1 材料第93页
        6.1.1 细胞、载体和纯化蛋白第93页
        6.1.2 抗体和试剂第93页
    6.2 实验方法第93-95页
        6.2.1 GEF活性检测实验第93-94页
        6.2.2 Co-IP实验检测FLCN与不同形式Rab11A的结合特异性第94页
        6.2.3 Co-IP实验检测PAT1与Rab5A,Rab7A,Rab11A的结合情况第94页
        6.2.4 Co-IP实验检测FLCN敲除对PAT1-Rab11A相互作用的影响第94页
        6.2.5 Co-IP实验检测FLCN敲除对Tf R-Rab11A相互作用的影响第94-95页
    6.3 结果与分析第95-98页
        6.3.1 FLCN与Rab11A的活性形式结合较为紧密第95-96页
        6.3.2 PAT1-3×FLAG可以结合Rab5A、Rab7A和Rab11A第96页
        6.3.3 FLCN特异地影响PAT1与Rab11A的结合第96-97页
        6.3.4 FLCN促进Rab11A与TfR结合第97-98页
    6.4 讨论第98-99页
    6.5 小结第99-100页
第七章 结论第100-101页
创新点第101-102页
下一步研究计划第102-103页
附录第103-105页
缩略词第105-106页
参考文献第106-120页
致谢第120-122页
个人简历第122-123页

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