| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 绪论 | 第12-22页 |
| 1.1 珠江水体污染现状 | 第12页 |
| 1.2 氮循环及其参与微生物研究进展 | 第12-19页 |
| 1.2.1 氮循环及其关键酶 | 第13-15页 |
| 1.2.2 氨氧化微生物和反硝化微生物的研究 | 第15-19页 |
| 1.3 克隆文库构建、PCR-DGGE 及 Q-PCR | 第19-20页 |
| 1.3.1 克隆文库构建及其应用 | 第19页 |
| 1.3.2 PCR-DGGE 技术 | 第19-20页 |
| 1.3.3 Q-PCR 技术 | 第20页 |
| 1.4 本文研究内容及目的、意义 | 第20-22页 |
| 1.4.1 研究内容 | 第20-21页 |
| 1.4.2 研究目的及意义 | 第21-22页 |
| 第二章 nirK 基因克隆文库群落结构及丰度分析 | 第22-42页 |
| 2.1 引言 | 第22页 |
| 2.2 材料与方法 | 第22-29页 |
| 2.2.1 试剂及仪器 | 第22-23页 |
| 2.2.2 水样的采集及预处理 | 第23页 |
| 2.2.3 CTAB 法提取水样总 DNA | 第23页 |
| 2.2.4 nirK 功能基因克隆文库的构建 | 第23-26页 |
| 2.2.5 阳性克隆子的筛选 | 第26页 |
| 2.2.6 克隆文库的 RFLP 分析 | 第26-27页 |
| 2.2.7 nirK 基因文库克隆子测序及系统发育树的构建 | 第27页 |
| 2.2.8 nirK 基因文库覆盖率及多样性指数的计算 | 第27页 |
| 2.2.9 nirK、Arch-amoA、amoA 基因实时定量 PCR | 第27-29页 |
| 2.3 结果及讨论 | 第29-39页 |
| 2.3.1 珠江水体四点样品基因组提取结果 | 第29页 |
| 2.3.2 nirK 基因扩增及其纯化结果 | 第29-30页 |
| 2.3.3 nirK 基因阳性克隆子的筛选 | 第30-31页 |
| 2.3.4 nirK 基因双酶切结果 | 第31-32页 |
| 2.3.5 nirK 基因阳性克隆子的分类 | 第32-34页 |
| 2.3.6 nirK 基因文库覆盖率及多样性指数分析 | 第34页 |
| 2.3.7 nirK 基因文库系统发育树分析 | 第34-36页 |
| 2.3.8 古菌 nirK 基因文库与细菌 nirK 基因文库比较 | 第36-38页 |
| 2.3.9 nirK 基因丰度分析 | 第38-39页 |
| 2.4 本章小结 | 第39-42页 |
| 第三章 Arch-amoA 基因克隆文库的构建及群落结构和丰度分析 | 第42-53页 |
| 3.1 引言 | 第42页 |
| 3.2 材料与方法 | 第42-44页 |
| 3.2.1 试剂及仪器 | 第42页 |
| 3.2.2 水样的采集及预处理 | 第42页 |
| 3.2.3 CTAB 法提取水样总 DNA | 第42页 |
| 3.2.4 Arch-amoA 基因克隆文库的构建 | 第42-43页 |
| 3.2.5 阳性克隆子的筛选 | 第43页 |
| 3.2.6 克隆文库的 RFLP 分析 | 第43-44页 |
| 3.2.7 Arch-amoA 基因文库克隆子测序及系统发育树的构建 | 第44页 |
| 3.2.8 Arch-amoA 基因文库覆盖率及多样性指数的计算 | 第44页 |
| 3.3 结果及讨论 | 第44-51页 |
| 3.3.1 珠江水体四点样品基因组提取结果 | 第44页 |
| 3.3.2 Arch-amoA 基因扩增及其纯化结果 | 第44-45页 |
| 3.3.3 Arch-amoA 基因阳性克隆子的筛选 | 第45页 |
| 3.3.4 Arch-amoA 基因菌落 PCR 产物双酶切结果 | 第45-46页 |
| 3.3.5 Arch-amoA 基因阳性克隆子的分类 | 第46-48页 |
| 3.3.6 Arch-amoA 基因文库覆盖率及多样性指数比较 | 第48页 |
| 3.3.7 Arch-amoA 基因文库与 amoA 基因文库比较 | 第48-51页 |
| 3.4 本章小结 | 第51-53页 |
| 第四章 穗石不同深度样品中氨氧化古菌群落结构及丰度分析 | 第53-67页 |
| 4.1 引言 | 第53页 |
| 4.2 材料与方法 | 第53-58页 |
| 4.2.1 样品采集及预处理 | 第53-54页 |
| 4.2.2 基因组的提取 | 第54页 |
| 4.2.3 nirK 基因的 PCR 产物扩增 | 第54页 |
| 4.2.4 穗石不同深度水样与泥样中 nirK 基因的 DGGE 群落结构分析 | 第54-58页 |
| 4.2.5 穗石不同深度水样与泥样中 nirK、Arch-amoA、amoA 基因丰度分析 | 第58页 |
| 4.3 结果及讨论 | 第58-66页 |
| 4.3.1 穗石不同深度水样与泥样基因组提取结果 | 第58-59页 |
| 4.3.2 穗石不同深度样品 nirK 基因扩增结果 | 第59页 |
| 4.3.3 穗石不同深度水样与泥样 nirK 基因 PCR 产物 DGGE 结果 | 第59-60页 |
| 4.3.4 DGGE 图谱分析 | 第60-63页 |
| 4.3.5 穗石不同深度水样与泥样中 nirK 基因的群落结构分析 | 第63-64页 |
| 4.3.6 穗石不同深度水样与泥样中 nirK 基因丰度 | 第64-66页 |
| 4.4 本章小结 | 第66-67页 |
| 结论与展望 | 第67-70页 |
| 创新点 | 第67页 |
| 结论 | 第67-69页 |
| 展望 | 第69-70页 |
| 参考文献 | 第70-79页 |
| 攻读硕士学位期间取得的研究成果 | 第79-80页 |
| 致谢 | 第80-81页 |
| 附件 | 第81页 |
