基于DNA条形码的系统发生树构建
| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第1章 绪论 | 第10-18页 |
| 1.1 课题的研究背景和意义 | 第10-11页 |
| 1.2 国内外研究概况 | 第11-14页 |
| 1.2.1 距离依靠法 | 第11-13页 |
| 1.2.2 独立元素法 | 第13-14页 |
| 1.3 目前存在的问题及本文的主要研究内容 | 第14-16页 |
| 1.4 结构安排 | 第16-18页 |
| 第2章 相关理论与方法 | 第18-32页 |
| 2.1 DNA 条形码 | 第18-23页 |
| 2.1.1 DNA 条形码的研究背景和意义 | 第18-19页 |
| 2.1.2 DNA 条形码的制作方法 | 第19-20页 |
| 2.1.3 DNA 条形码及其特征 | 第20-23页 |
| 2.2 系统发生树的构建算法 | 第23-30页 |
| 2.3 《伯杰氏系统细菌学手册》简介 | 第30-31页 |
| 2.4 本章小结 | 第31-32页 |
| 第3章 基于 DNA 条形码的系统发生树构建方法 | 第32-48页 |
| 3.1 DNA 全序列基因组的获得 | 第32页 |
| 3.2 DNA 条形码制作及预处理 | 第32-33页 |
| 3.2.1 DNA 条形码制作 | 第32-33页 |
| 3.2.2 DNA 条形码的预处理 | 第33页 |
| 3.3 特征提取 | 第33-38页 |
| 3.4 系统发生树的构建及评估 | 第38-39页 |
| 3.4.1 系统发生树的构建 | 第38页 |
| 3.4.2 系统发生树的评估 | 第38-39页 |
| 3.5 实验结果及分析 | 第39-46页 |
| 3.5.1 自展(bootstrap)检测实验 | 第39-42页 |
| 3.5.2 系统发育分析的实验与结果分析 | 第42-46页 |
| 3.6 本章小结 | 第46-48页 |
| 第4章 邻接法的改进算法 | 第48-58页 |
| 4.1 邻接法分析 | 第48-49页 |
| 4.2 邻接法算法改进 | 第49-52页 |
| 4.3 实验及结果分析 | 第52-57页 |
| 4.3.1 实验材料 | 第52页 |
| 4.3.2 实验结果及分析 | 第52-57页 |
| 4.4 本章小结 | 第57-58页 |
| 第5章 系统发生树构建的实验平台设计 | 第58-64页 |
| 5.1 系统描述 | 第58页 |
| 5.2 数据形式 | 第58-59页 |
| 5.3 操作流程 | 第59-60页 |
| 5.4 技术方案 | 第60-62页 |
| 5.5 本章小结 | 第62-64页 |
| 第6章 全文总结 | 第64-66页 |
| 6.1 本文的主要工作和取得的研究成果 | 第64页 |
| 6.2 进一步拟进行的研究工作 | 第64-66页 |
| 参考文献 | 第66-72页 |
| 附录 | 第72-74页 |
| 作者简介 | 第74-75页 |
| 致谢 | 第75页 |
