| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-11页 |
| 缩写词表 | 第12-13页 |
| 第一章 前言 | 第13-24页 |
| 1.1 启动子的结构和功能 | 第13-15页 |
| 1.1.1 原核生物启动子DNA元件的结构特性 | 第14页 |
| 1.1.2 真核生物启动子DNA元件的结构特性 | 第14-15页 |
| 1.2 增强子的结构和特点 | 第15-16页 |
| 1.3 启动子的分类 | 第16-17页 |
| 1.4 启动子的研究方法之探针质粒载体的应用 | 第17-18页 |
| 1.5 国内外启动子的研究状况 | 第18-21页 |
| 1.6 拟杆菌门微生物启动子的研究进展 | 第21-22页 |
| 1.7 论文选题来源和工作思路 | 第22-24页 |
| 第二章 C.hutchinsonii ATCC33406强启动子的筛选及保守区结构的确立 | 第24-52页 |
| 2.1 材料与方法 | 第24-27页 |
| 2.1.1 菌种 | 第24页 |
| 2.1.2 质粒与引物 | 第24-26页 |
| 2.1.3 培养基以及抗生素溶液的配制方法 | 第26-27页 |
| 2.1.4 实验试剂及实验器材 | 第27页 |
| 2.2 实验方法 | 第27-39页 |
| 2.2.1 哈氏噬纤维菌基因转录水平的分析 | 第27页 |
| 2.2.2 启动子DNA片段和lacZ报告基因的获取 | 第27-28页 |
| 2.2.3 启动子片段和lacZ的融合PCR | 第28-29页 |
| 2.2.4 pSKO8TG和表达片段的双酶切 | 第29-30页 |
| 2.2.5 表达片段和载体的连接反应 | 第30页 |
| 2.2.6 大肠杆菌DH5α感受态细胞的制备(MgCl_2-CaCl_2法) | 第30-31页 |
| 2.2.7 大肠杆菌DH5α的热击转化 | 第31页 |
| 2.2.8 大肠杆菌阳性转化子的验证 | 第31-32页 |
| 2.2.9 大肠杆菌阳性转化子的保藏 | 第32页 |
| 2.2.10 表达载体的酶切验证及测序验证 | 第32页 |
| 2.2.11 哈氏噬纤维菌感受态细胞的制备法(甘油MgCl_2法) | 第32-33页 |
| 2.2.12 哈氏噬纤维菌的电击转化 | 第33-34页 |
| 2.2.13 哈氏噬纤维菌阳性转化子的验证 | 第34页 |
| 2.2.14 哈氏噬纤维菌阳性转化子的保藏 | 第34页 |
| 2.2.15 哈氏噬纤维菌的LacZ酶活测定 | 第34-35页 |
| 2.2.16 哈氏噬纤维菌启动子核心区域的确定 | 第35-36页 |
| 2.2.17 哈氏噬纤维菌启动子的5'RACE技术 | 第36-39页 |
| 2.2.18 哈氏噬纤维菌启动子保守区结构的确立 | 第39页 |
| 2.3 实验结果 | 第39-49页 |
| 2.3.1 启动子片段和报告基因lacZ的PCR结果 | 第39-40页 |
| 2.3.2 启动子片段和报告基因lacZ的融合PCR结果 | 第40-41页 |
| 2.3.3 大肠杆菌阳性转化子验证结果 | 第41页 |
| 2.3.4 lacZ表达载体的酶切验证和测序结果 | 第41-42页 |
| 2.3.5 哈氏噬纤维菌阳性转化子验证结果 | 第42-43页 |
| 2.3.6 哈氏噬纤维菌强启动子P_(chu_fanA)的保守结构及截短研究结果 | 第43-44页 |
| 2.3.7 哈氏噬纤维菌强启动子P_(chu_fanB)的保守结构及截短研究结果 | 第44-45页 |
| 2.3.8 哈氏噬纤维菌强启动子P_(chu_fanC)的保守结构及截短研究结果 | 第45-46页 |
| 2.3.9 哈氏噬纤维菌强启动子P_(chu_fanD)保守结构及截短研究结果 | 第46-47页 |
| 2.3.10 哈氏噬纤维菌强启动子P_(chu_fanE)的保守结构及截短研究结果 | 第47-48页 |
| 2.3.11 哈氏噬纤维菌强启动子保守区结构的确立 | 第48-49页 |
| 2.4 分析讨论 | 第49-52页 |
| 第三章 C.hutchinsonii ATCC33406启动子的SLIM突变及生物信息学分析 | 第52-69页 |
| 3.1 材料与方法 | 第52-54页 |
| 3.1.1 菌种 | 第52页 |
| 3.1.2 质粒 | 第52-53页 |
| 3.1.3 引物 | 第53-54页 |
| 3.1.4 培养基、缓冲液以及抗生素溶液的配制方法 | 第54页 |
| 3.1.5 实验试剂及实验器材 | 第54页 |
| 3.2 实验方法 | 第54-59页 |
| 3.2.1 用SLIM技术对强启动子P_(chu_fanA)两保守区的突变 | 第54-56页 |
| 3.2.2 用SLIM技术对强启动子P_(chu_fanA)两保守区spacer length的突变 | 第56-58页 |
| 3.2.3 用SLIM技术对弱启动子P_(chu_fanF)和P_(chu_fanG)的改造 | 第58页 |
| 3.2.4 用SLIM技术对强启动子P_(chu_fanA)其它位点的突变 | 第58页 |
| 3.2.5 对哈氏噬纤维菌及其它菌株基因组启动子的生物信息学分析 | 第58-59页 |
| 3.3 实验结果 | 第59-65页 |
| 3.3.1 用SLIM技术对P_(chu_fanA)强启动子第一保守区的突变 | 第59-60页 |
| 3.3.2 用SLIM技术对P_(chu_fanA)强启动子第二保守区的突变 | 第60-61页 |
| 3.3.3 用SLIM技术对P_(chu_fanA)强启动子两保守区spacer length的突变 | 第61-62页 |
| 3.3.4 用SLIM技术对弱启动子P_(chu_fanF)和P_(chu_fanG)的改造 | 第62-63页 |
| 3.3.5 用SLIM技术对强启动子P_(chu_fanA)其它位点的突变 | 第63-64页 |
| 3.3.6 用生物信息学对不同菌株基因组启动子的检索结果 | 第64-65页 |
| 3.4 分析讨论 | 第65-69页 |
| 全文总结与展望 | 第69-72页 |
| 参考文献 | 第72-78页 |
| 致谢 | 第78-80页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第80页 |
