| 摘要 | 第8-10页 |
| ABSTRACT | 第10-11页 |
| 第一章 绪论 | 第12-18页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第12-13页 |
| 1.2 生物序列的图形表示 | 第13-14页 |
| 1.3 生物序列的相似性分析 | 第14-15页 |
| 1.4 功能性蛋白预测 | 第15-16页 |
| 1.5 论文的主要工作和结构 | 第16-18页 |
| 1.5.1 论文的主要工作 | 第16-17页 |
| 1.5.2 论文的结构 | 第17-18页 |
| 第二章 蛋白质序列的数值转换模型 | 第18-26页 |
| 2.1 引言 | 第18-19页 |
| 2.2 氨基酸的理化性质特征 | 第19-21页 |
| 2.2.1 氨基酸常见的理化性质 | 第19页 |
| 2.2.2 两种理化性质的权重 | 第19-21页 |
| 2.3 蛋白质序列的相对位置特征 | 第21-23页 |
| 2.3.1 图的能量 | 第21页 |
| 2.3.2 构造稀疏矩阵 | 第21-23页 |
| 2.4 对称的相对熵距离 | 第23-25页 |
| 2.4.1 多维向量距离的计算方法 | 第23-25页 |
| 2.4.2 对称的相对熵距离 | 第25页 |
| 2.5 本章小结 | 第25-26页 |
| 第三章 蛋白质序列的相似性分析 | 第26-36页 |
| 3.1 引言 | 第26页 |
| 3.2 常用的序列比对工具Clustal W | 第26页 |
| 3.3 蛋白质序列的相似性分析 | 第26-33页 |
| 3.3.1 ND5蛋白序列的相似性分析 | 第27-28页 |
| 3.3.2 转铁蛋白序列的相似性分析 | 第28-31页 |
| 3.3.3 抗冻蛋白序列的相似性分析 | 第31-32页 |
| 3.3.4 β珠蛋白序列的相似性分析 | 第32-33页 |
| 3.4 本章小结 | 第33-36页 |
| 第四章 基于数值转换模型的功能性蛋白预测 | 第36-46页 |
| 4.1 引言 | 第36-37页 |
| 4.2 数据集 | 第37-38页 |
| 4.3 特征向量的提取 | 第38-39页 |
| 4.3.1 基于氨基酸理化性质和相对位置的特征提取 | 第38页 |
| 4.3.2 基于氨基酸组分动量向量的特征提取 | 第38-39页 |
| 4.3.3 基于氨基酸加权组分的特征提取 | 第39页 |
| 4.4 预测算法与评价 | 第39-42页 |
| 4.4.1 支持向量机预测模型 | 第39-41页 |
| 4.4.2 评价模型 | 第41-42页 |
| 4.5 功能性蛋白预测 | 第42-44页 |
| 4.5.1 抗癌多肽预测 | 第42-43页 |
| 4.5.2 过敏性肽预测 | 第43页 |
| 4.5.3 毒蛋白预测 | 第43-44页 |
| 4.5.4 HIV蛋白预测 | 第44页 |
| 4.6 本章小结 | 第44-46页 |
| 第五章 总结与展望 | 第46-48页 |
| 5.1 总结 | 第46-47页 |
| 5.2 展望 | 第47-48页 |
| 参考文献 | 第48-54页 |
| 致谢 | 第54-55页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第55-56页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第56页 |