| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 第1章 绪论 | 第11-20页 |
| 1.1 研究背景和意义 | 第11-13页 |
| 1.2 国内外研究现状与发展趋势 | 第13-18页 |
| 1.2.1 蛋白质结构同源模建预测方法 | 第13-14页 |
| 1.2.2 蛋白质结构从头预测方法 | 第14-17页 |
| 1.2.3 多模全局优化 | 第17-18页 |
| 1.3 研究内容 | 第18-19页 |
| 1.4 结构安排 | 第19-20页 |
| 第2章 一种新的蛋白质结构预测多模态优化算法 | 第20-35页 |
| 2.1 能量模型 | 第20-24页 |
| 2.1.1 分子立场的发展 | 第20-22页 |
| 2.1.2 ECEPP/3力场模型及其转换 | 第22-24页 |
| 2.2 算法描述 | 第24-29页 |
| 2.2.1 排挤差分进化算法 | 第24-25页 |
| 2.2.2 局部性原理 | 第25-26页 |
| 2.2.3 集结过程(Build-Up Procedures) | 第26页 |
| 2.2.4 能量极小化过程(Energy-Minimization Procedures) | 第26页 |
| 2.2.5 BECDE-SL算法描述 | 第26-29页 |
| 2.3 案例研究 | 第29-30页 |
| 2.4 算法测试及其结果分析 | 第30-34页 |
| 2.5 本章小结 | 第34-35页 |
| 第3章 基于改进排挤差分进化的蛋白质结构多模态预测算法 | 第35-46页 |
| 3.1 邻域变异策略 | 第36页 |
| 3.2 数值测试研究 | 第36-38页 |
| 3.2.1 测试问题 | 第36-37页 |
| 3.2.2 实验结果 | 第37-38页 |
| 3.3 算法描述 | 第38-42页 |
| 3.3.1 排挤差分进化算法 | 第38-39页 |
| 3.3.2 集结过程 | 第39页 |
| 3.3.3 BNCDE算法描述 | 第39-42页 |
| 3.4 实验结果分析 | 第42-44页 |
| 3.5 本章小结 | 第44-46页 |
| 第4章 基于片段组装技术的蛋白质结构预测混合算法 | 第46-56页 |
| 4.1 Rosetta服务器的发展 | 第46-48页 |
| 4.2 Rosetta力场模型 | 第48-49页 |
| 4.3 片段组装技术 | 第49-50页 |
| 4.4 算法描述 | 第50-52页 |
| 4.4.1 差分进化算法 | 第50页 |
| 4.4.2 基于差分进化算法的片段组装技术 | 第50-52页 |
| 4.5 实验结果分析 | 第52-54页 |
| 4.6 本章小结 | 第54-56页 |
| 第5章 总结与展望 | 第56-58页 |
| 5.1 研究工作总结 | 第56-57页 |
| 5.2 展望 | 第57-58页 |
| 参考文献 | 第58-63页 |
| 致谢 | 第63-64页 |
| 攻读学位期间参加的科研项目和成果 | 第64页 |
