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巴西橡胶树棒孢霉落叶病病菌MAPK基因(CCK1)和毒素基因(ct)克隆与功能鉴定

摘要第1-7页
Abstract第7-21页
第一部分 前言第21-42页
 1 巴西橡胶树棒孢霉落叶病研究综述第21-25页
   ·我国巴西橡胶树产业的经济、社会和生态重要性第21页
   ·巴西橡胶树棒孢霉落叶病研究概况第21-25页
     ·分布与为害第21-22页
     ·症状特征第22页
     ·病菌学第22-24页
       ·分类第22-23页
       ·形态第23页
       ·生物学特性第23-24页
     ·发生流行规律第24页
       ·品种抗病性第24页
       ·气象条件第24页
       ·海拔第24页
       ·土壤肥力第24页
     ·防治第24-25页
       ·选用抗病品种第25页
       ·药剂防治第25页
       ·其他防治措施第25页
 2 植物病原真菌MAPK胞外信号转导途径研究进展第25-35页
   ·参与调控环境胁迫反应第29-30页
   ·参与调控有性交配第30-31页
   ·参与调控菌丝和孢子生长发育第31页
   ·参与调控病菌的致病性第31-35页
     ·PMK1类基因第32-33页
     ·MPS1类基因第33-35页
 3 植物病原真菌毒素研究进展第35-38页
   ·植物病原真菌毒素种类第35页
   ·植物病原真菌毒素作用位点第35页
   ·植物病原真菌毒素提纯与活性测定第35-36页
   ·植物病原真菌毒素分子遗传研究第36-38页
     ·毒素的遗传研究第36-37页
       ·HST毒素遗传研究第36-37页
       ·NHST毒素遗传研究第37页
     ·毒素产生的调控研究第37-38页
 4. 多主棒孢菌分子生物学研究概况第38-39页
   ·分子检测第38页
   ·分子遗传多样性第38页
   ·cassiicolin毒素分子特征第38-39页
 5 本研究的目的意义和主要研究内容第39-42页
   ·目的意义第39-40页
   ·主要研究内容第40页
   ·主要技术路线第40-42页
第二部分 巴西橡胶树棒孢霉落叶病菌蛋白激酶基因(CCK1)的克隆、敲除及表型测定第42-89页
 1.材料与方法第42-63页
   ·材料与仪器第42-43页
     ·供试药剂及试剂第42页
     ·供试培养基第42页
     ·供试病原菌第42页
     ·主要仪器第42-43页
   ·病原菌的纯化第43页
   ·蛋白激酶基因CCK1片段的扩增第43-45页
     ·病原菌基因组DNA的提取第43-44页
     ·蛋白激酶CCK1基因片段扩增第44-45页
       ·引物设计第44页
       ·PCR体系与程序第44页
       ·CCK1片段的回收、克隆、测序与分析第44-45页
   ·SEFA-PCR扩增获得蛋白激酶基因CCK1的DNA全长第45-47页
     ·引物设计第45-46页
     ·SEFA-PCR第一步扩增第46页
     ·SEFA-PCR第二步扩增第46-47页
     ·扩增产物电泳检测第47页
     ·5′端和3′端第二轮扩增产物的回收、连接、转化和克隆检测第47页
     ·5′端和3′端序列的测定与拼接第47页
     ·CCK1全长DNA序列验证第47页
     ·CCK1全长DNA序列分析第47页
   ·蛋白激酶基因CCK1基因全长cDNA序列的获得第47-49页
     ·菌丝总RNA的提取第47-48页
     ·CCK1基因的cDNA的获得第48-49页
     ·cDNA的回收、克隆和测序第49页
     ·CCK1序列分析第49页
   ·蛋白激酶基因CCK1基因的敲除第49-60页
     ·CCK1基因敲除载体的构建第50-54页
       ·CCK1基因5′端DVF片段和3′端DVB片段的扩增与克隆第50页
       ·pDVF质粒提取第50-51页
       ·酶切pDVF载体第51页
       ·构建起始敲除载体pDVFB第51页
       ·去磷酸化线形载体pDVFB制备第51-52页
       ·潮霉素B抗性基因(hygB)的扩增与回收第52-53页
       ·敲除载体pFHB的构建第53-54页
     ·CCK1基因敲除第54-56页
       ·CC004菌株对潮霉素B(Hm B)的敏感性测定第54页
       ·病原菌原生质体制备第54-55页
       ·原生质体转化与再生第55-56页
     ·CCK1敲除突变体的筛选与PCR验证第56-57页
       ·转化子纯化第56页
       ·用鉴定多主棒孢菌的特异性引物扩增鉴定突变体第56页
       ·用特异性引物和扩增潮霉素的引物扩增验证突变体第56-57页
     ·CCK1突变体FHB4的Southern杂交分析第57-60页
   ·蛋白激酶基因CCK1突变体FHB4表型测定第60-63页
     ·突变体FHB4对潮霉素抗性的遗传稳定性检测第60页
     ·突变体FHB4菌落、菌丝形态情况观察第60页
     ·突变体FHB4产孢情况观察第60页
     ·CCK1突变体FHB4对温度、酸碱度、渗透胁迫和农药敏感性测定第60-61页
       ·生长温度范围的测定第60页
       ·致死温度的测定第60-61页
       ·对pH敏感性测定第61页
       ·对高渗胁迫条件的敏感性测定第61页
       ·对农药敏感性测定第61页
     ·CCK1突变体FHB4致病性测定第61-62页
       ·CFK1突变体FHB4菌株菌饼致病性测定第61-62页
       ·CCK1突变体FHB4粗毒素致病性测定第62页
     ·CCK1突变体FHB4产酶活性的测定第62-63页
       ·漆酶相对产量的测定第62页
       ·细胞壁降解酶活性测定第62-63页
     ·CCK1途径与其他信号转导途径的关系初探第63页
       ·CCK1途径与钙信号途径间的关系第63页
       ·CCK1途径与cAMP途径间的关系第63页
 2 结果与分析第63-87页
   ·蛋白激酶基因CCK1片段的扩增第63-65页
     ·病原菌基因组DNA的提取第63-64页
     ·蛋白激酶CCK1基因片段扩增结果第64-65页
   ·SEFA-PCR扩增获得蛋白激酶基因CCK1的DNA全长第65-66页
   ·蛋白激酶基因CCK1基因全长cDNA序列的获得第66-67页
     ·CCK1基因全长cDNA的扩增和测序结果第66-67页
   ·蛋白激酶CCK1基因序列分析第67-70页
     ·CCK1基因全长DNA与cDNA序列分析第67-68页
     ·CCK1基因预测蛋白的可能性结构与功能性分析第68-70页
       ·CCK1推测蛋白的相似性分析第68-70页
       ·CCK1基因推测蛋白保守结构域分析第70页
   ·蛋白激酶基因CCK1基因的敲除第70-75页
     ·CCK1基因敲除载体的构建第70-72页
       ·CCK1基因5′端DVF和3′端DVB片段的扩增与克隆第70-71页
       ·潮霉素B抗性基因(hygB)的扩增第71-72页
       ·敲除载体pFHB的生成第72页
     ·CCK1基因敲除第72-73页
       ·巴西橡胶树棒孢霉落叶病菌菌株对潮霉素(Hm B)的敏感性第72页
       ·病原菌原生质体的制备第72-73页
       ·用于CCK1基因敲除的FHB基因片段的扩增第73页
       ·CCK1基因敲除第73页
     ·CCK1敲除突变体的筛选与PCR验证第73-74页
       ·用鉴定多主棒孢菌的特异性引物扩增鉴定转化子第73页
       ·用特异性引物和扩增潮霉素的引物扩增验证转化子第73-74页
     ·CCK1突变体FHB4的Southern杂交分析第74-75页
   ·蛋白激酶CCK1突变体FHB4表型测定第75-87页
     ·CCK1突变体FHB4对潮霉素抗性的遗传稳定性检测第75页
     ·CCK1突变体FHB4菌落、菌丝形态、产孢情况观察第75-77页
       ·突变体FHB4菌落形态观察和生长速率测定第75-76页
       ·突变体FHB4菌丝形态观察第76-77页
       ·突变体FHB4产孢情况观察第77页
     ·CCK1突变体FHB4对温度、酸碱度、渗透胁迫敏感性测定第77-81页
       ·生长温度范围的测定第77-78页
       ·菌丝致死温度的测定第78页
       ·对pH敏感性测定第78页
       ·对高渗胁迫条件的敏感性测定第78-80页
       ·对农药敏感性测定第80-81页
     ·CCK1突变体FHB4致病性测定第81-84页
       ·菌饼致病性测定第81-82页
       ·粗毒素致病性测定第82-84页
     ·CCK1突变体酶活性测定第84-86页
       ·漆酶相对产量的测定第84-85页
       ·细胞壁降解酶活性测定第85-86页
     ·CCK1途径与其他信号转导途径的关系初探第86-87页
       ·CCK1途径与钙信号途径间的关系第86页
       ·CCK1途径与cAMP途径间的关系第86-87页
 3 小结第87-89页
第三部分 巴西橡胶树棒孢霉落叶病菌毒素基因(ct)的克隆、敲除及表型测定第89-111页
 1.材料与方法第89-95页
   ·材料与仪器第89页
   ·病原菌基因组DNA的提取第89页
   ·毒素ct基因片段的扩增、克隆和分析第89页
     ·引物设计第89页
     ·ct基因片段的扩增第89页
     ·ct片段的凝胶回收、克隆、测序与分析第89页
   ·SEFA-PCR扩增获得毒素基因ct的DNA全长第89-90页
     ·引物设计第89-90页
     ·SEFA-PCR第一步、第二步扩增第90页
     ·第二轮扩增产物测序引物设计第90页
     ·5′端和3′端序列拼接第90页
     ·ct基因全长DNA序列验证第90页
     ·ct基因DNA序列分析第90页
   ·毒素基因ct基因全长cDNA序列的获得第90-91页
     ·菌丝总RNA的提取第90页
     ·ct基因的cDNA的获得第90-91页
     ·ct基因的cDNA的回收、克隆和测序第91页
     ·ct基因cDNA序列分析第91页
   ·毒素基因ct的敲除第91-94页
     ·ct基因敲除载体的构建第92页
       ·pCT质粒提取第92页
       ·酶切pCT载体第92页
       ·去磷酸化线形载体pCT制备第92页
       ·潮霉素B抗性基因(hygB)的扩增与回收第92页
       ·敲除载体pCTH的构建第92页
     ·ct基因敲除第92-93页
     ·ct敲除突变体的筛选与PCR验证第93页
       ·转化子纯化第93页
       ·转化子的PCR验证第93页
     ·毒素突变体CTH5的Southern杂交分析第93-94页
   ·毒素突变体CTH5表型测定第94-95页
     ·突变体CTH5对潮霉素抗性的遗传稳定性检测第94页
     ·毒素突变体CTH5菌落、菌丝形态、产孢和孢子萌发情况观察第94页
     ·毒素突变体CTH5第94页
       ·生长温度范围的测定第94页
       ·致死温度的测定第94页
       ·对pH敏感性测定第94页
     ·毒素突变体CTH5致病性测定第94-95页
       ·菌饼致病性测定第95页
       ·粗毒素致病性测定第95页
     ·毒素突变体CTH5酶活性的测定第95页
       ·漆酶相对产量的测定第95页
       ·纤维素酶相对产量的测定第95页
 2 结果与分析第95-109页
   ·ct基因片段扩增、克隆和测序结果第95页
   ·SEFA-PCR扩增获得毒素基因ct的DNA全长第95-97页
   ·ct基因全长cDNA获得及序列分析第97-98页
   ·毒素ct基因序列分析第98-99页
     ·ct基因全长DNA与cDNA序列分析第98页
     ·毒素ct基因推测蛋白的序列分析第98-99页
   ·毒素基因ct的敲除第99-102页
     ·潮霉素B抗性基因(hygB)的扩增第99-100页
     ·敲除载体pCTH的构建第100页
     ·ct基因敲除第100页
       ·用于ct基因敲除的CTH片段的扩增第100页
       ·ct基因敲除第100页
     ·ct敲除突变体的PCR验证第100-101页
     ·ct突变体CTH5的Southern杂交分析第101-102页
   ·毒素突变体CTH5表型测定第102-109页
     ·毒素突变体CTH5对潮霉素抗性的遗传稳定性检测第102页
     ·毒素突变体CTH5菌落和菌丝形态、产孢和孢子萌发情况观察第102-104页
     ·毒素突变体CTH5对温度、酸碱度敏感性测定第104-105页
       ·生长温度范围的测定第104-105页
       ·致死温度测定第105页
       ·对pH敏感性测定第105页
     ·毒素突变体CTH5致病性测定第105-108页
       ·菌饼致病性测定第105-106页
       ·粗毒素致病性测定第106-108页
     ·毒素突变体CTH5产酶活性的测定第108-109页
       ·漆酶相对产量的测定第108-109页
       ·纤维素酶相对产量的测定第109页
 3 小结第109-111页
第四部分 结论、讨论及展望第111-120页
 1 主要结论第111-113页
   ·获得巴西橡胶树棒孢霉落叶病菌蛋白激酶基因CCK1分析第111页
   ·获得巴西橡胶树棒孢霉落叶病菌蛋白激酶CCK1基因敲除突变体第111页
   ·测定了蛋白激酶CCK1基因突变体FHB4表型第111-112页
   ·获得巴西橡胶树棒孢霉落叶病菌毒素基因ct序列第112页
   ·获得巴西橡胶树棒孢霉落叶病菌毒素ct基因敲除突变体第112页
   ·测定了毒素基因突变体CTH5表型第112-113页
 2 讨论第113-117页
   ·蛋白激酶CCK1序列表型分析第113-114页
   ·蛋白激酶CCK1突变体和毒素突变体致病性比较分析第114-115页
   ·CCK1蛋白激酶调控途径与其他调控途径关系第115-116页
   ·毒素基因分析第116页
   ·SEFA-PCR法的改进第116-117页
   ·敲除载体构建方法的改进第117页
   ·突变体纯化方法的改进第117页
 3. 本研究创新点第117-118页
 4. 后续研究第118-120页
参考文献第120-134页
附录1 巴西橡胶树棒孢霉落叶病菌蛋白激酶CCK1基因DNA与cDNA序列比对第134-137页
附录2 巴西橡胶树棒孢霉落叶病菌CCK1基因全序列登录页面第137-140页
附录3 巴西橡胶树棒孢霉落叶病菌CCK1与其他菌物PMK1类MAPK同源基因的氨基酸序列相似性比对第140-142页
附录4 巴西橡胶树棒孢霉落叶病菌毒素ct基因DNA与cDNA序列比对第142-145页
附录5 巴西橡胶树棒孢霉落叶病菌毒素ct基因全序列登录页面第145-147页
附录6 巴西橡胶树棒孢霉落叶病菌毒素基因ct与cas的DNA序列(ATG-TAA)相似性比对第147-148页
附录7 巴西橡胶树棒孢霉落叶病菌毒素基因ct与cas的cDNA序列相似性比对第148-149页
攻读博士期间发表的研究论文、获奖及编写教材情况第149-151页
致谢第151页

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