| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 第1章 绪论 | 第11-23页 |
| 1.1 课题来源、背景及研究目的意义 | 第11-12页 |
| 1.2 秀丽隐杆线虫研究概述 | 第12-19页 |
| 1.2.1 秀丽隐杆线虫简介 | 第12-14页 |
| 1.2.2 秀丽隐杆线虫在空间微重力条件下的研究进展 | 第14-16页 |
| 1.2.3 秀丽隐杆线虫在空间生物学地基模拟条件下的研究进展 | 第16-18页 |
| 1.2.4 葡萄糖对秀丽隐杆线虫代谢途径的影响研究进展 | 第18-19页 |
| 1.3 有参考基因转录组测序概述 | 第19-21页 |
| 1.3.1 转录组测序简介 | 第19页 |
| 1.3.2 转录组测序技术发展历程 | 第19-21页 |
| 1.4 本文的主要研究内容和技术路线 | 第21-23页 |
| 1.4.1 主要研究内容 | 第21页 |
| 1.4.2 本文技术路线 | 第21-23页 |
| 第2章 材料与方法 | 第23-31页 |
| 2.1 实验材料与仪器 | 第23-24页 |
| 2.1.1 材料与试剂 | 第23页 |
| 2.1.2 实验器材 | 第23-24页 |
| 2.2 实验方法 | 第24-31页 |
| 2.2.1 培养基及试剂溶液的配置 | 第24-25页 |
| 2.2.2 大肠杆菌OP50的复苏、培养与冻存 | 第25-26页 |
| 2.2.3 秀丽隐杆线虫的培养扩繁与冻存 | 第26页 |
| 2.2.4 秀丽隐杆线虫的同步化 | 第26-27页 |
| 2.2.5 秀丽隐杆线虫模拟微重力方法 | 第27页 |
| 2.2.6 秀丽隐杆线虫的生存率的测定方法 | 第27-28页 |
| 2.2.7 秀丽隐杆线虫的繁殖能力的测定方法 | 第28页 |
| 2.2.8 秀丽隐杆线虫的有参考基因转录组测序方法 | 第28-31页 |
| 第3章 葡萄糖对模拟微重力下秀丽隐杆线虫寿命影响及转录组测序差异表达基因筛选 | 第31-41页 |
| 3.1 引言 | 第31页 |
| 3.2 不同浓度葡萄糖饲喂秀丽隐杆线虫对其生存率改变 | 第31-32页 |
| 3.3 秀丽隐杆线虫在模拟微重力和饲喂葡萄糖处理下的生存率 | 第32页 |
| 3.4 秀丽隐杆线虫在模拟微重力和饲喂葡萄糖处理下的产卵量 | 第32-33页 |
| 3.5 秀丽隐杆线虫总RNA的提取与质量检测分析 | 第33-34页 |
| 3.6 秀丽隐杆线虫转录组测序数据及其质量控制 | 第34-35页 |
| 3.7 秀丽隐杆线虫转录组数据与参考基因组序列比对 | 第35-37页 |
| 3.8 秀丽隐杆线虫转录组文库质量的评估 | 第37-39页 |
| 3.8.1 mRNA片段化随机性检验 | 第37-38页 |
| 3.8.2 插入片段长度检验 | 第38页 |
| 3.8.3 转录组测序数据饱和度检验 | 第38-39页 |
| 3.9 本章小结 | 第39-41页 |
| 第4章 有参考基因转录组测序生物学分析 | 第41-54页 |
| 4.1 引言 | 第41页 |
| 4.2 秀丽隐杆线虫转录组测序基因表达量分析 | 第41-42页 |
| 4.2.1 基因表达定量分析 | 第41-42页 |
| 4.2.2 不同组别基因表达量的总体分布 | 第42页 |
| 4.3 秀丽隐杆线虫转录组测序差异基因表达分析 | 第42-45页 |
| 4.4 秀丽隐杆线虫在不同处理条件下的差异表达基因分析 | 第45-53页 |
| 4.4.1 秀丽隐杆线虫在模拟微重力条件下差异表达基因GO分类 | 第45-46页 |
| 4.4.2 秀丽隐杆线虫在模拟微重力条件下的KEGG pathway分析 | 第46-49页 |
| 4.4.3 葡萄糖对模拟微重力下的秀丽隐杆线虫的差异基因GO分类 | 第49-50页 |
| 4.4.4 葡萄糖对模拟微重力下的秀丽隐杆线虫的差异基因的KEGG pathway分析 | 第50-53页 |
| 4.5 本章小结 | 第53-54页 |
| 结论 | 第54-56页 |
| 参考文献 | 第56-62页 |
| 附录1 模拟微重力组和添加葡萄糖组的ATGC分布图 | 第62页 |
| 附录2 模拟微重力组和添加葡萄糖基因组不同区域READS分布图 | 第62-63页 |
| 附录3 模拟微重力组和添加葡萄糖处理组的转录组数据饱和模拟图 | 第63页 |
| 附录4 模拟微重力组和添加葡萄糖处理组的MAPPED READS在MRNA上的位置分布图 | 第63-64页 |
| 附录5 模拟微重力组和添加葡萄糖处理组的插入片段长度模拟分布图 | 第64页 |
| 附录6 葡萄糖对模拟微重力下秀丽线虫的差异表达基因火山图 | 第64-65页 |
| 附录7 对照组和模拟微重力组的部分差异基因表达量 | 第65页 |
| 附录8 葡萄糖对模拟微重力下的秀丽隐杆线虫的部分差异基因表达量 | 第65-67页 |
| 攻读硕士学位期间发表的论文及其它成果 | 第67-69页 |
| 致谢 | 第69页 |
