| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第1章 绪论 | 第13-23页 |
| 1.1 重金属污染的治理方法 | 第13页 |
| 1.2 抗生素的种类和使用现状 | 第13-15页 |
| 1.3 重金属和抗生素的复合污染 | 第15页 |
| 1.4 土壤抗生素抗性基因的研究现状 | 第15-20页 |
| 1.4.1 抗生素抗性基因与抗性基因水平转移机制 | 第15-17页 |
| 1.4.2 土壤重金属对抗生素抗性基因的影响 | 第17页 |
| 1.4.3 可移动遗传元件介导抗生素抗性基因的水平转移 | 第17-19页 |
| 1.4.4 抗生素抗性基因的研究手段 | 第19-20页 |
| 1.5 研究目的与内容 | 第20-23页 |
| 1.5.1 研究目的 | 第20-21页 |
| 1.5.2 研究内容 | 第21-23页 |
| 第2章 重金属锌对土壤微生物多样性的影响 | 第23-33页 |
| 2.1 土壤样品的前处理 | 第23页 |
| 2.2 Miseq测序实验流程 | 第23-24页 |
| 2.2.1 基因组DNA抽提 | 第23页 |
| 2.2.2 PCR扩增 | 第23-24页 |
| 2.2.3 荧光定量 | 第24页 |
| 2.2.4 文库的建立及Miseq上机测序 | 第24页 |
| 2.3 生物信息分析流程与内容 | 第24页 |
| 2.4 结果与讨论 | 第24-31页 |
| 2.4.1 原始数据 | 第24页 |
| 2.4.2 数据去杂 | 第24-25页 |
| 2.4.3 序列信息和多样性指数 | 第25-26页 |
| 2.4.4 稀释曲线 | 第26-27页 |
| 2.4.5 门水平上的分类情况 | 第27-28页 |
| 2.4.6 属水平上的分类情况（heatmap） | 第28-29页 |
| 2.4.7 聚类分析(Cluster analysis) | 第29-31页 |
| 2.5 本章小结 | 第31-33页 |
| 第3章 重金属锌对土壤微生物抗生素抗性水平的影响 | 第33-49页 |
| 3.1 试验材料 | 第33-35页 |
| 3.1.1 土样的来源 | 第33页 |
| 3.1.2 主要试剂 | 第33-34页 |
| 3.1.3 实验仪器 | 第34页 |
| 3.1.4 培养基 | 第34-35页 |
| 3.2 试验方法 | 第35-37页 |
| 3.2.1 土样的处理 | 第35页 |
| 3.2.2 土壤抗生素抗性菌的分离纯化与菌落计数 | 第35页 |
| 3.2.3 菌落形态观察 | 第35页 |
| 3.2.4 抗性菌株的鉴定 | 第35-36页 |
| 3.2.5 抗性菌株的交叉耐药性测试 | 第36-37页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第37-48页 |
| 3.3.1 土壤基础理化性质 | 第37页 |
| 3.3.2 重金属锌对土壤微生物抗生素抗性菌的影响 | 第37-39页 |
| 3.3.3 抗性菌的筛选与形态特征 | 第39-40页 |
| 3.3.4 生理生化鉴定结果 | 第40-41页 |
| 3.3.5 基于 16S rDNA基因序列的系统发育分析 | 第41-43页 |
| 3.3.6 药敏试验结果 | 第43-46页 |
| 3.3.7 抗生素与不同浓度Zn~(2+)交叉对抗性菌株C1和STZ2生长的影响 | 第46-48页 |
| 3.4 本章小结 | 第48-49页 |
| 第4章 重金属锌对土壤细菌抗性基因及可移动遗传元件丰度的影响 | 第49-61页 |
| 4.1 试验材料 | 第49-50页 |
| 4.1.1 实验试剂 | 第49页 |
| 4.1.2 实验仪器 | 第49-50页 |
| 4.2 试验方法 | 第50-51页 |
| 4.2.1 土壤微生物核酸的提取 | 第50页 |
| 4.2.2 抗生素抗性基因及可移动遗传元件丰度的检测 | 第50-51页 |
| 4.2.3 数据统计与分析 | 第51页 |
| 4.3 试验结果 | 第51-58页 |
| 4.3.1 氨基糖苷类抗性基因的丰度变化 | 第51-54页 |
| 4.3.2 可移动遗传元件的丰度变化 | 第54-58页 |
| 4.4 本章讨论与小结 | 第58-61页 |
| 结论 | 第61-63页 |
| 参考文献 | 第63-71页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第71-73页 |
| 致谢 | 第73-74页 |
| 详细摘要 | 第74-78页 |
