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全基因组范围APA分析的复方中药金复康抑癌机制的研究

中文摘要第3-4页
Abstract第4-5页
第一章 绪论第9-22页
    1.1 APA概述第9-12页
        1.1.1 mRNA选择性多聚腺苷酸化研究的发展历程第9-10页
        1.1.2 mRNA选择性多聚腺苷酸化的分子机制第10-11页
        1.1.3 APA的作用机制第11-12页
    1.2 APA的真核生物的基因表达调控对肿瘤的作用第12-14页
    1.3 肺癌特效复方中药金复康的抗肿瘤分子机制研究第14-17页
        1.3.1 肺癌的研究现状第14页
        1.3.2 中药抑癌的分子机制的研究第14-15页
            1.3.2.1 传统中药治疗第14页
            1.3.2.2 中医药治疗肿瘤的分子机制研究第14-15页
        1.3.3 金复康引起非小细胞肺癌系A549细胞凋亡第15-17页
    1.4 如何对复方中药金复康的抑癌机制进行基因表达调控水平的研究第17-22页
        1.4.1 研究的方法第17-18页
        1.4.2 3T-seq技术第18-22页
            1.4.2.1 技术简介第18页
            1.4.2.2 原理和流程示意图第18-21页
            1.4.2.3 技术的独特性第21-22页
第二章 材料与方法第22-42页
    2.1 引言第22页
    2.2 实验材料第22-27页
        2.2.1 细胞株第22页
        2.2.2 制备金复康醇提物第22-23页
        2.2.3 实验试剂和材料第23-24页
        2.2.4 仪器第24-25页
        2.2.5 引物与测序接头第25-27页
    2.3 实验方法第27-41页
        2.3.1 细胞培养第27-28页
            2.3.1.1 配制培养基第27页
            2.3.1.2 细胞旳培养第27-28页
        2.3.2 细胞总RNA的提取和质检第28-29页
            2.3.2.1 细胞总RNA的提取第28页
            2.3.2.2 细胞总RNA的质量检测第28-29页
        2.3.3 APA文库构建第29-41页
            2.3.3.1 特殊Oligo dT磁珠的构建第29-30页
            2.3.3.2 Oligo dT逆转录筛选Poly(A)+mRNA第30-32页
            2.3.3.3 双链cDNA的合成第32-33页
            2.3.3.4 APA标签的精确定位第33-34页
            2.3.3.5 移除Poly A序列释放APA标签文库第34-35页
            2.3.3.6 文库修饰第35-37页
            2.3.3.7 片段筛选第37-38页
            2.3.3.8 文库的克隆测序质检第38-40页
            2.3.3.9 文库扩增和片段精确筛选第40-41页
    2.4 本章小结第41-42页
第三章 实验结果第42-54页
    3.1 总RNA质检结果第42-43页
    3.2 文库质检结果第43-44页
    3.3 高通量文库的克隆质检结果第44-45页
    3.4 片段精确筛选第45-46页
    3.5 高通量测序结果比对第46-48页
        3.5.1 高通量测序质检结果第46-48页
        3.5.2 APA位点的鉴定和比对分析第48页
    3.6 数据初步分析第48-50页
    3.7 差异表达基因的功能分析第50页
    3.8 3T-seq高通量数据的验证第50-52页
        3.8.1 3'RACE验证3T-seq定位PAS的精准性第50-51页
        3.8.2 real-time RT PCR验证表达量差异第51-52页
    3.9 本章小结第52-54页
第四章 总结与展望第54-56页
参考文献第56-60页
攻读硕士学位期间取得的科研成果第60-61页
致谢第61页

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