| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 1 绪论 | 第9-13页 |
| 1.1 研究背景 | 第9页 |
| 1.2 研究现状 | 第9-12页 |
| 1.2.1 疾病实体识别的研究现状 | 第9-11页 |
| 1.2.2 疾病标准化的研究现状 | 第11-12页 |
| 1.2.3 疾病实体识别和疾病标准化之间的关系 | 第12页 |
| 1.3 本文工作及结构安排 | 第12-13页 |
| 2 相关资源、工具及算法 | 第13-22页 |
| 2.1 生物医学文献及资源 | 第13-17页 |
| 2.1.1 MEDLINE | 第13-14页 |
| 2.1.2 MeSH | 第14页 |
| 2.1.3 PharmGKB | 第14-15页 |
| 2.1.4 MEDIC | 第15-16页 |
| 2.1.5 NCBI Disease Corpus | 第16-17页 |
| 2.2 生物医学文献处理工具 | 第17-19页 |
| 2.2.1 BANNER | 第17-18页 |
| 2.2.2 MetaMap | 第18-19页 |
| 2.3 生物医学文献处理相关算法 | 第19-21页 |
| 2.3.1 CRF | 第19-20页 |
| 2.3.2 VSM | 第20-21页 |
| 2.4 本章小结 | 第21-22页 |
| 3 CRF和词典相结合的疾病命名实体识别 | 第22-35页 |
| 3.1 疾病词典构建 | 第22页 |
| 3.2 疾病实体识别 | 第22-24页 |
| 3.2.1 基于词典匹配的方法 | 第22页 |
| 3.2.2 CRF | 第22-23页 |
| 3.2.3 词典与CRF相结合的方法 | 第23页 |
| 3.2.4 全称-缩写词对后处理 | 第23-24页 |
| 3.3 实验设计与结果分析 | 第24-29页 |
| 3.3.1 实验数据 | 第24-25页 |
| 3.3.2 评价指标 | 第25-27页 |
| 3.3.3 实验结果与分析 | 第27-29页 |
| 3.4 错误分析 | 第29-31页 |
| 3.5 可视化 | 第31-33页 |
| 3.5.1 系统流程 | 第32-33页 |
| 3.5.2 关键技术 | 第33页 |
| 3.5.3 系统运行环境 | 第33页 |
| 3.5.4 系统运行实例 | 第33页 |
| 3.6 本章小结 | 第33-35页 |
| 4 基于语义资源的疾病标准化 | 第35-48页 |
| 4.1 疾病标准化 | 第35页 |
| 4.2 方法 | 第35-43页 |
| 4.2.1 疾病实体识别 | 第35-37页 |
| 4.2.2 映射关系建立 | 第37-39页 |
| 4.2.3 基于扩展语义相似度消歧 | 第39-43页 |
| 4.3 实验设计与结果分析 | 第43-45页 |
| 4.3.1 实验数据 | 第43页 |
| 4.3.2 评价指标 | 第43-44页 |
| 4.3.3 实验结果与分析 | 第44-45页 |
| 4.4 错误分析 | 第45-47页 |
| 4.5 本章小结 | 第47-48页 |
| 结论 | 第48-49页 |
| 参考文献 | 第49-53页 |
| 攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第53-54页 |
| 致谢 | 第54-55页 |