| 前言 | 第4-5页 |
| 中文摘要 | 第5-7页 |
| 英文摘要 | 第7-10页 |
| 第一章 绪论 | 第14-50页 |
| 1 大豆及其病毒病 | 第14-15页 |
| 2 植物病毒的检测方法 | 第15-17页 |
| 3 马铃薯Y病毒属病毒对大豆的危害 | 第17-19页 |
| 4 大豆花叶病毒(Soybean mosaic virus,SMV) | 第19-37页 |
| 4.1 SMV生物学特征 | 第19-25页 |
| 4.2 SMV株系的划分 | 第25-26页 |
| 4.3 抗SMV基因位点的研究 | 第26-32页 |
| 4.3.1 栽培大豆中抗SMV基因位点的研究 | 第26-29页 |
| 4.3.2 野生大豆中抗SMV基因资源的筛选 | 第29页 |
| 4.3.3 SMV与抗病基因的相互作用 | 第29-32页 |
| 4.4 SMV的防治 | 第32-37页 |
| 4.4.1 选育和运用抗性大豆品系进行防治 | 第32-33页 |
| 4.4.2 通过转基因进行防治 | 第33-37页 |
| 4.4.3 通过交叉保护进行防治 | 第37页 |
| 5 本研究目的和意义 | 第37-39页 |
| 6 参考文献 | 第39-50页 |
| 第二章 现阶段引起我国大豆花叶病的Potyvirus病毒种类研究 | 第50-70页 |
| 引言 | 第50-51页 |
| 1 材料与方法 | 第51-57页 |
| 1.1 主要试剂和仪器 | 第51页 |
| 1.2 样品的采集与保存 | 第51页 |
| 1.3 实验方法 | 第51-57页 |
| 1.3.1 植物总RNA的提取 | 第51-53页 |
| 1.3.2 转录组测序鉴定花叶症状大豆叶片中Potyvirus病毒的种类 | 第53页 |
| 1.3.3 兼并引物RT-PCR鉴定花叶症状大豆叶片中Potyvirus病毒种类 | 第53-57页 |
| 1.3.3.1 Potyvirus病毒兼并引物的设计 | 第53-54页 |
| 1.3.3.2 反转录聚合酶链式反应(Reverse Transcription-PCR,RT-PCR) | 第54-55页 |
| 1.3.3.3 PCR产物检测 | 第55页 |
| 1.3.3.4 PCR产物纯化 | 第55页 |
| 1.3.3.5 DNA片段连接pEASY-Blunt Zero克隆载体 | 第55-56页 |
| 1.3.3.6 将连接产物转入Trans1-T1化学感受态细胞 | 第56-57页 |
| 1.3.3.7 测序结果比对及病毒种类的鉴定 | 第57页 |
| 2 结果 | 第57-64页 |
| 2.1 转录组测序鉴定花叶症状大豆叶片中Potyvirus病毒的种类 | 第57-60页 |
| 2.1.1 两个混合转录组测序样品(North组和South组)的组成 | 第57-58页 |
| 2.1.2 测序原始数据预处理 | 第58页 |
| 2.1.3 转录组测序鉴定Potyvirus病毒种类 | 第58-59页 |
| 2.1.4 转录组测序鉴定Potyvirus病毒种类的RT-PCR验证 | 第59-60页 |
| 2.2 兼并引物鉴定花叶症状大豆叶片中Potyvirus病毒种类 | 第60-64页 |
| 3 讨论 | 第64-67页 |
| 4 参考文献 | 第67-70页 |
| 第三章 大豆花叶病毒(SMV)的演化与致病性研究 | 第70-102页 |
| 引言 | 第70-72页 |
| 1 材料和方法 | 第72-75页 |
| 1.1 样品的采集与保存 | 第72页 |
| 1.2 SMV的RT-PCR检测、鉴定及全基因组测序 | 第72页 |
| 1.3 SMV编码基因的多样性分析 | 第72-73页 |
| 1.4 SMV重组分析和系统演化树的构建 | 第73-74页 |
| 1.5 SMV种群结构及其编码基因所受选择压力分析 | 第74-75页 |
| 1.6 四个我国SMV株系在美国和我国大豆鉴别寄主上的致病性分析 | 第75页 |
| 2 结果 | 第75-91页 |
| 2.1 SMV检测、鉴定和全基因组测序 | 第75-76页 |
| 2.2 SMV基因组及各编码基因的变异性分析 | 第76-79页 |
| 2.3 SMV基因重组分析与系统演化树的构建 | 第79-85页 |
| 2.4 我国SMV种群与世界其他国家SMV种群分化分析 | 第85-87页 |
| 2.5 SMV编码基因所受选择压力分析 | 第87-89页 |
| 2.6 四个我国SMV株系的致病性及与美国SMV株系的致病性差异 | 第89-91页 |
| 3 讨论 | 第91-95页 |
| 4 结论 | 第95页 |
| 5 参考文献 | 第95-102页 |
| 第四章 菜豆普通花叶病毒(BCMV)的演化与致病性研究 | 第102-128页 |
| 引言 | 第102-103页 |
| 1 材料和方法 | 第103-106页 |
| 1.1 样品的采集与保存 | 第103-104页 |
| 1.2 BCMV的RT-PCR检测、鉴定及全基因组测序 | 第104页 |
| 1.3 BCMV编码基因的多样性及所受选择压力分析 | 第104-105页 |
| 1.4 BCMV系统演化树的构建和重组分析 | 第105页 |
| 1.5 四个系统演化关系较远BCMV株系/分离物的致病性分析 | 第105-106页 |
| 2 结果 | 第106-119页 |
| 2.1 BCMV的检测、鉴定和全基因组测序 | 第106页 |
| 2.2 BCMV基因组及各编码基因的变异性分析 | 第106-107页 |
| 2.3 全基因组水平BCMV系统发育树的构建与重组分析 | 第107-115页 |
| 2.4 BCMV编码基因所受选择压力分析 | 第115-116页 |
| 2.5 新采集四个BCMV株系/分离物的致病性分析 | 第116-119页 |
| 3 讨论 | 第119-122页 |
| 4 结论 | 第122页 |
| 5 参考文献 | 第122-128页 |
| 第五章 大豆品系Suweon97中抗BCMV基因的探索 | 第128-140页 |
| 引言 | 第128-129页 |
| 1 材料与方法 | 第129-133页 |
| 1.1 试验材料 | 第129-131页 |
| 1.1.1 杂交亲本 | 第129页 |
| 1.1.2 BCMV株系 | 第129-130页 |
| 1.1.3 Simple Sequence Repeat(SSR)引物 | 第130页 |
| 1.1.4 试剂与仪器 | 第130-131页 |
| 1.2 试验方法 | 第131-133页 |
| 1.2.1 田间杂交 | 第131页 |
| 1.2.2 BCMV接种 | 第131页 |
| 1.2.3 DNA提取及检测 | 第131-132页 |
| 1.2.4 PCR扩增筛选两亲本间多态性SSR Marker | 第132页 |
| 1.2.5 利用集团分离分析法(BSA)进行抗BCMV基因的初步定位 | 第132-133页 |
| 2 结果 | 第133-134页 |
| 2.1 PCR筛选两杂交亲本间的多态性SSR Marker | 第133页 |
| 2.2 大豆中抗BCMV基因的初步探索 | 第133-134页 |
| 3 讨论 | 第134-137页 |
| 4 参考文献 | 第137-140页 |
| 全文总结 | 第140-142页 |
| 致谢 | 第142-144页 |
| 攻读博士期间已发表和待发表的论文 | 第144-146页 |
| 附表 | 第146-154页 |
