| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-11页 |
| 缩略词表 | 第12-13页 |
| 第一部分 文献综述 | 第13-41页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-41页 |
| 1 植物磷高效研究进展 | 第16-25页 |
| 1.1 植物在低磷胁迫的下的生理生化反应 | 第16-19页 |
| 1.2 低磷胁迫下植物代谢途径的变化 | 第19-20页 |
| 1.3 植物应对低磷胁迫分子机制研究 | 第20-23页 |
| 1.4 植物对磷信号的感应和传递 | 第23-25页 |
| 2 磷高效大豆传统育种 | 第25-28页 |
| 2.1 磷效率的定义 | 第25-26页 |
| 2.2 大豆磷效率相关的筛选指标 | 第26-27页 |
| 2.3 大豆磷高效基因型传统选育 | 第27-28页 |
| 3 大豆磷效率遗传统计学研究 | 第28-36页 |
| 3.1 连锁分析 | 第28-30页 |
| 3.2 关联分析 | 第30-32页 |
| 3.3 大豆的LD水平 | 第32-33页 |
| 3.4 关联分析的应用方法 | 第33-34页 |
| 3.5 关联分析在大豆低磷胁迫及其它研究的应用 | 第34-35页 |
| 3.6 关联分析在植物中应用展望 | 第35-36页 |
| 4 大豆磷效率分子遗传学研究 | 第36-38页 |
| 5 本研究目的与意义 | 第38-41页 |
| 第二部分 研究报告(一) | 第41-85页 |
| 第二章 大豆苗期磷效率相关性状的关联分析 | 第43-63页 |
| 1 材料与方法 | 第44-45页 |
| 1.1 试验材料 | 第44页 |
| 1.2 田间试验设计 | 第44页 |
| 1.3 性状调查及测量 | 第44页 |
| 1.4 数据分析 | 第44-45页 |
| 1.5 关联分析 | 第45页 |
| 2 结果与分析 | 第45-58页 |
| 2.1 表型数据统计分析 | 第45-48页 |
| 2.2 表型数据的相关性分析 | 第48页 |
| 2.3 关联分析 | 第48-53页 |
| 2.4 苗期磷效率相关优异变异效应检测及新型磷高效大豆杂交组合预测 | 第53-55页 |
| 2.5 根据苗期磷效率相关优异等位变异预测新的磷高效杂交组合 | 第55-56页 |
| 2.6 参与磷代谢相关的基因 | 第56-58页 |
| 3 讨论 | 第58-63页 |
| 3.1 苗期大豆磷效率相关性状表型分析 | 第58页 |
| 3.2 条件关联分析在耐低磷胁迫中的作用 | 第58-59页 |
| 3.3 SNPs簇的应用价值 | 第59页 |
| 3.4 苗期大豆耐低磷胁迫相关QTL结果与前人研究比较 | 第59-61页 |
| 3.5 优异等位变异分析及优异磷高效组合预测 | 第61-63页 |
| 第三章 缺磷胁迫对大豆大豆产量及相关性状的影响 | 第63-85页 |
| 1 材料与方法 | 第64页 |
| 1.1 试验材料 | 第64页 |
| 1.2 田间试验设计 | 第64页 |
| 1.3 性状调查及测量 | 第64页 |
| 1.4 数据分析 | 第64页 |
| 1.5 关联分析 | 第64页 |
| 2 结果 | 第64-79页 |
| 2.1 产量及产量相关性状表型分析 | 第64-66页 |
| 2.2 产量及产量相关性状的相关性分析 | 第66页 |
| 2.3 产量与产量相关性状的关联分析 | 第66-74页 |
| 2.4 等位基因的效应及预测新的磷高效杂交组合 | 第74-77页 |
| 2.5 预测候选基因 | 第77-79页 |
| 3 讨论 | 第79-85页 |
| 3.1 表型性状之间的相关性分析 | 第79页 |
| 3.2 相对单株产量(磷效率系数)与大豆磷高效相关 | 第79-80页 |
| 3.3 本研究结果与前人研究比较 | 第80-81页 |
| 3.4 两个不同生育期对SNPs的影响 | 第81-82页 |
| 3.5 苗期及成熟时期磷效率相关候选基因的预测 | 第82页 |
| 3.6 大豆磷效率研究中存在的问题 | 第82-85页 |
| 第三部分 研究报告(二) | 第85-119页 |
| 第四章 GmG3PT1基因的表达特征与功能分析 | 第87-109页 |
| 1 材料与方法 | 第88-92页 |
| 1.1 试验材料 | 第88页 |
| 1.2 序列分析网站与软件及系统发生树构建 | 第88页 |
| 1.3 主要试剂和仪器 | 第88-89页 |
| 1.4 引物合成及测序 | 第89-90页 |
| 1.5 植物基因组DNA与总RNA提取、纯化及cDNA第一链的合成 | 第90页 |
| 1.6 克隆基因的cDNA序列全长 | 第90页 |
| 1.7 转基因拟南芥的获得及阳性苗的鉴定 | 第90-91页 |
| 1.8 转基因拟南芥的表型分析 | 第91-92页 |
| 2 结果与分析 | 第92-105页 |
| 2.1 GmG3PT家族成员及生物信息学分析 | 第92-97页 |
| 2.2 G3PT1基因的表达模式 | 第97-99页 |
| 2.3 GmG3PT1基因在拟南芥过表达 | 第99-100页 |
| 2.4 转基因植株的功能分析 | 第100-104页 |
| 2.5 GmG3PT1基因过表达改变有机磷代谢途径中基因的表达 | 第104-105页 |
| 3 讨论 | 第105-109页 |
| 3.1 GmG3PT家族基因的特点 | 第105-106页 |
| 3.2 GmG3PT家族基因启动子区域存在缺磷响应和光响应作用元件 | 第106-107页 |
| 3.3 GmG3PT1基因过表达改变拟南芥的侧根生长发育 | 第107页 |
| 3.4 GmG3PT1基因过表达可能提高低磷胁迫下植株体内磷活化效率 | 第107-109页 |
| 第五章 GmG3PT1基因的eQTL分析 | 第109-119页 |
| 1 材料与方法 | 第109-111页 |
| 1.1 试验材料 | 第109页 |
| 1.2 试验设计 | 第109-110页 |
| 1.3 基因表达水平的测定 | 第110页 |
| 1.4 植株地上干重,有效磷含量的测定 | 第110页 |
| 1.5 统计分析与eQTL定位方法 | 第110-111页 |
| 2 结果与分析 | 第111-115页 |
| 2.1 表型数据的分析 | 第111-112页 |
| 2.2 GmG3PT1基因表达量与大豆植株有效磷和地上部干重的相关性 | 第112-113页 |
| 2.3 GmG3PT1基因的eQTL分析 | 第113-114页 |
| 2.4 水培大豆根系有效磷浓度及地上干重的关联分析 | 第114-115页 |
| 3 讨论 | 第115-119页 |
| 3.1 GmG3PT1基因的表达水平由顺式eQTL和反式eQTL共同调控 | 第115-116页 |
| 3.2 GmG3PT1基因的表达水平可能调节大豆植株的地上生物量 | 第116-119页 |
| 全文结论 | 第119-121页 |
| 本研究创新 | 第121-123页 |
| 参考文献 | 第123-139页 |
| 附录 | 第139-147页 |
| 攻读博士期间发表论文及待发表论文 | 第147-149页 |
| 致谢 | 第149页 |
