大豆疫霉效应子分子进化和贵阳腐霉基因组研究
| 摘要 | 第1-10页 |
| ABSTRACT | 第10-13页 |
| 上篇 文献综述 | 第13-37页 |
| 第一章 卵菌基因组的研究进展 | 第14-28页 |
| 1 卵菌基因组测序概况 | 第14页 |
| 2 疫霉基因组的研究 | 第14-18页 |
| 3 终极腐霉基因组的研究 | 第18-21页 |
| 4 寄生霜霉基因组分析 | 第21-23页 |
| 5 寄生水霉基因组分析 | 第23-28页 |
| 第二章 卵菌效应子的研究进展 | 第28-37页 |
| 1 卵菌效应子的基因组特征 | 第28-29页 |
| 2 质外体效应子的研究 | 第29-30页 |
| 3 细胞质效应子的研究 | 第30-32页 |
| 4 效应子抑制寄主防卫反应的研究 | 第32-33页 |
| 5 影响植物代谢过程的研究 | 第33-35页 |
| 6 影响植物代谢过程的研究 | 第35-37页 |
| 下篇 研究内容 | 第37-90页 |
| 第一章 大豆疫霉CRN家族的进化分析 | 第38-58页 |
| 1 材料与方法 | 第40-42页 |
| ·序列来源与分析 | 第40页 |
| ·进化过程中的基因得失分析 | 第40页 |
| ·基因复制分析 | 第40-41页 |
| ·基因重组分析 | 第41页 |
| ·选择压力分析 | 第41页 |
| ·功能分析 | 第41-42页 |
| 2 结果与分析 | 第42-54页 |
| ·CRN家族在疫霉种之后特异性进化 | 第42-45页 |
| ·CRN家族在疫霉间相对保守 | 第45-47页 |
| ·大豆疫霉CRN家族的特征分析 | 第47页 |
| ·CRN家族的复制分析 | 第47-50页 |
| ·CRN家族的重组分析 | 第50-52页 |
| ·CRN家族的毒性功能分析 | 第52-54页 |
| 3 讨论 | 第54-58页 |
| 第二章 大豆疫霉内含子的特征与可变剪接分析 | 第58-72页 |
| 1 材料与方法 | 第60-62页 |
| ·序列来源与处理 | 第60页 |
| ·内含子的预测 | 第60-61页 |
| ·内含子的特征分析 | 第61页 |
| ·可变剪接的预测与验证 | 第61-62页 |
| 2 结果与分析 | 第62-69页 |
| ·内含子的预测 | 第62-63页 |
| ·内含子的特征分析 | 第63-66页 |
| ·内含子与外显子交界处的重复序列分析 | 第66-67页 |
| ·可变剪接的预测与验证 | 第67-69页 |
| 3 讨论 | 第69-72页 |
| 第三章 基于贵阳腐霉全基因组测序的比较基因组分析 | 第72-90页 |
| 1 材料与方法 | 第74-75页 |
| ·测序菌株 | 第74页 |
| ·基因组测序和拼接 | 第74页 |
| ·基因组注释 | 第74-75页 |
| ·基因家族的预测 | 第75页 |
| 2 结果与分析 | 第75-88页 |
| ·基因组测序概况 | 第75-76页 |
| ·基因组特征分析 | 第76-79页 |
| ·蛋白激酶家族的分析 | 第79-80页 |
| ·昆虫表皮降解酶的分析 | 第80-83页 |
| ·代谢相关基因的分析 | 第83页 |
| ·分泌蛋白的分析 | 第83-84页 |
| ·致病相关基因的分析 | 第84-85页 |
| ·效应子的分析 | 第85-88页 |
| 3 讨论 | 第88-90页 |
| 附录 | 第90-110页 |
| 本论文结论和创新点 | 第110-112页 |
| 全文参考文献 | 第112-124页 |
| 攻读博士学位期间发表的学术论文 | 第124-126页 |
| 致谢 | 第126-127页 |
