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小鼠巨噬细胞与肿瘤相关巨噬细胞的比较蛋白质组学研究

致谢第1-7页
摘要第7-9页
ABSTRACT第9-11页
专业词汇中英文对照表第11-20页
第一章 绪论第20-32页
   ·肿瘤微环境的研究现状第20-22页
     ·肿瘤微环境的组成第20-21页
     ·肿瘤微环境的特征第21-22页
   ·肿瘤相关巨噬细胞(Tumor Associated Macrophages,TAMs)第22-25页
     ·TAMs的来源第22-23页
     ·TAMs的功能研究第23-25页
       ·TAMs与免疫抑制作用第24页
       ·TAMs与血管生成过程第24页
       ·TAMs与肿瘤生长、转移作用第24-25页
   ·肿瘤微环境中exosome的研究现状第25-30页
     ·Exosome的形成过程及形态特征第25-26页
     ·Exosome的组成特点第26-28页
     ·肿瘤微环境中exosome的功能研究第28-30页
     ·巨噬细胞来源exosome的研究现状第30页
   ·结语第30-32页
第二章 小鼠巨噬细胞和肿瘤相关巨噬细胞的全细胞定量蛋白质组学研究第32-60页
   ·引言第32页
   ·材料与方法第32-43页
     ·实验材料第33-36页
       ·细胞系第33页
       ·Real-time PCR引物第33-34页
       ·主要试剂第34页
         ·抗体第34页
         ·其他第34页
       ·主要仪器第34-35页
       ·计算机分析软件第35-36页
     ·实验方法第36-43页
       ·TAMs细胞模型的建立第36页
       ·细胞总RNA的提取第36页
       ·Reverse transcription第36-37页
       ·实时定量PCR第37-38页
       ·蛋白质的提取第38页
       ·蛋白质的浓度测定第38页
       ·SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)第38页
       ·Western Blot第38-39页
       ·细胞免疫荧光和激光共聚焦第39页
       ·细胞核的提取第39-40页
       ·蛋白质的溶液内酶解消化第40页
       ·银染检测消化效率第40页
       ·iTRAQ标记第40-41页
       ·高pH值反相(RP)-高效液相色谱(HPLC)分离混合肽段第41页
       ·UtraFlex MALDI-TOF/TOF质谱检测第41-42页
       ·LC-MS/MS分析第42页
       ·质谱数据搜库匹配及筛选第42-43页
       ·数据统计分析第43页
   ·实验结果第43-59页
     ·CT26培养基诱导TAMs细胞模型第43-45页
       ·CT26培养基诱导TAMs形态变化第43-44页
       ·CT26培养基诱导TAMs中炎症细胞因子表达水平变化第44-45页
     ·Ana-1和TAMs细胞全蛋白消化效率检测第45-46页
     ·Ana-1和TAMs的细胞全蛋白谱的定性结果分析第46-47页
     ·Ana-1和TAMs的细胞全蛋白谱的定量结果分析第47-48页
     ·Ana-1和TAMs胞内差异蛋白质的功能分析第48-56页
     ·TAMs中GR通路的活化第56-59页
   ·小结第59-60页
第三章 小鼠巨噬细胞和肿瘤相关巨噬细胞的exosome及exosome-free的定量蛋白质组学研究第60-90页
   ·引言第60页
   ·材料与方法第60-64页
     ·实验材料第60-61页
       ·主要试剂第60-61页
         ·抗体(部分同第二章)第61页
         ·其他试剂(部分同第二章)第61页
         ·主要仪器(部分同第二章)第61页
     ·实验方法(部分同第二章)第61-64页
       ·Exosome的提取第61-62页
       ·Exosome直径的检测(透射电镜法)第62页
       ·Exosome直径及分布检测(Nanoparticle Tracking Analysis)第62页
       ·Exosome-free蛋白的制备第62页
       ·蛋白质的提取第62-63页
       ·iTRAQ标记第63页
       ·高pH值反相(RP)-高效液相色谱(HPLC)分离混合肽段、UtraFlexMALDI-TOF/TOF质谱检测、LC-MS/MS分析、质谱数据搜索、数据统计分析第63页
       ·20S蛋白酶体的检测第63-64页
       ·2100 Bioanalyzer检测RNA组成第64页
   ·实验结果第64-89页
     ·Ana-1和TAMs的exosome提取及鉴定第64-66页
     ·Ana-1和TAMs细胞分泌exosome及exosome-free消化效率检测第66-67页
     ·MADLI-TOF/TOF对标记效率的检测以及应用RP-HPLC对肽段预分离第67-69页
     ·Ana-1和TAMs的exosome及exosome-free蛋白谱的定性结果分析第69-72页
     ·Ana-1和TAMs的exosome及exosome-free蛋白质组定量结果分析第72-79页
     ·Ana-1及TAMs来源的exosome差异蛋白的功能分析第79-81页
     ·Ana-1及TAMs来源的exosome差异蛋白的验证第81-82页
     ·Ana-1及TAMs来源的exosome差异蛋白的功能验证第82-84页
       ·Ana-1和TAMs-exosome中RNA组成及丰度的检测第82-83页
       ·Ana-1和TAMs的exosome中20S蛋白酶体活性的检测第83-84页
     ·Ana-1和TAMs的exosome-free差异蛋白的功能分析第84-85页
     ·Ana-1及TAMs来源的exosome、exosome-free及全细胞组分差异蛋白的关联分析第85-89页
   ·小结第89-90页
第四章 小鼠巨噬细胞和肿瘤相关巨噬细胞的exosome及exosome-free的定性整合分析第90-102页
   ·引言第90页
   ·实验材料与方法(部分同第三章)第90-91页
     ·计算机软件(同第三章)第90页
     ·实验方法(同第三章)第90-91页
       ·质谱数据搜库匹配及筛选第90-91页
       ·iBAQ intensity归一化方法第91页
   ·实验结果第91-101页
     ·小鼠巨噬细胞系分泌的exosome及exosome-free分泌蛋白偏好性分析第91-97页
       ·基于iBAQ intensity对小鼠巨噬细胞分泌的exosome及exosome-free蛋白的分类第91-94页
       ·Exosome及exosome-free分泌蛋白偏好性及其功能分析第94-96页
       ·Exosome及exosome-free组分差异蛋白的相对丰度分析第96-97页
     ·小鼠巨噬细胞exosome蛋白组成的细胞特异性分析第97-101页
       ·Exosome核心组成蛋白的相对丰度及功能分析第97-100页
       ·不同细胞来源exosome的功能特性分析第100-101页
   ·小结第101-102页
第五章 讨论第102-106页
   ·TAMs功能表型与GR信号通路激活的关系第102-103页
   ·TAMs exosome的强酶解活性的讨论第103页
   ·TAMs功能在其分泌的exosome中的体现第103-104页
   ·小鼠巨噬细胞来源exosome的特殊RNA组成的讨论第104页
   ·巨噬细胞的不同分泌形式特性的揭示第104-106页
基本结论第106-108页
参考文献第108-114页
作者简介及在学期间发表的学术论文与研究成果第114页

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