| 缩写词 | 第1-10页 |
| 摘要 | 第10-12页 |
| Abstract | 第12-14页 |
| 第一章 前言 | 第14-30页 |
| 1.木本果树成花途径研究进展 | 第14-19页 |
| ·木本果树成花的环境调控 | 第15-16页 |
| ·水分 | 第15页 |
| ·温度 | 第15-16页 |
| ·光照 | 第16页 |
| ·营养生长与生殖生长 | 第16页 |
| ·植物生长调节剂对成花的调控 | 第16页 |
| ·开花过程中的基因调控 | 第16-19页 |
| ·LFY 基因 | 第17页 |
| ·TFL 基因 | 第17-18页 |
| ·FLC 基因 | 第18页 |
| ·SVP 基因 | 第18-19页 |
| 2 启动子 | 第19-27页 |
| ·启动子的结构与特征 | 第19-21页 |
| ·植物启动子的类型极其应用研究 | 第21-24页 |
| ·组成型启动子 | 第21-22页 |
| ·组织或器官特异性启动子 | 第22页 |
| ·诱导型启动子(inducible promoter) | 第22-23页 |
| ·双向启动子 | 第23-24页 |
| ·可变启动子 | 第24页 |
| ·启动子的克隆方法 | 第24-26页 |
| ·探针质粒载体筛选法 | 第24-25页 |
| ·利用 PCR 技术克隆启动子 | 第25-26页 |
| ·常规 PCR 技术 | 第25页 |
| ·反向 PCR 技术 | 第25页 |
| ·Panhandle-PCR 技术 | 第25页 |
| ·T-linker PCR 技术 | 第25页 |
| ·TAIL-PCR 技术 | 第25-26页 |
| ·启动子的功能鉴定 | 第26-27页 |
| ·转化分析 | 第26页 |
| ·瞬时表达分析 | 第26-27页 |
| 3 转录组测序 | 第27-30页 |
| ·高通量测序技术 | 第27页 |
| ·转录组测序技术 | 第27-28页 |
| ·转录组测序技术的特点 | 第28页 |
| ·转录组测序后数据的处理 | 第28-30页 |
| 第二章 四季蜜龙眼 LFY 同源基因(LLFY)启动子克隆 | 第30-40页 |
| 1.试验材料 | 第30-31页 |
| ·植物材料 | 第30页 |
| ·试剂 | 第30页 |
| ·感受态和克隆载体 | 第30页 |
| ·试剂盒、酶以及 Marker | 第30-31页 |
| ·试剂盒 | 第30页 |
| ·酶 | 第30-31页 |
| ·Marker | 第31页 |
| ·引物合成及克隆产物测序 | 第31页 |
| ·仪器设备 | 第31页 |
| 2.试验方法 | 第31-35页 |
| ·四季蜜基因组 DNA 的提取与测定 | 第31-32页 |
| ·DNA 的提取方法 | 第31页 |
| ·DNA 的检测 | 第31-32页 |
| ·引物的设计与合成 | 第32页 |
| ·四季蜜 LLFY 基因启动子的克隆 | 第32-34页 |
| ·目的片段的回收 | 第34-35页 |
| ·目的片段与载体的连接 | 第35页 |
| ·连接产物的转化与筛选 | 第35页 |
| ·测序与序列分析 | 第35页 |
| 3 结果与分析 | 第35-38页 |
| ·四季蜜龙眼基因组 DNA 提取 | 第35-36页 |
| ·四季蜜 LLFY 基因启动子的克隆 | 第36页 |
| ·四季蜜 LLFY 基因启动子序列分析 | 第36-38页 |
| ·四季蜜和立冬本 LLFY 基因启动子序列比较 | 第38页 |
| 4.讨论 | 第38-40页 |
| 第三章 龙眼转录组测序及分析 | 第40-61页 |
| 1 试验材料 | 第40页 |
| ·植物材料 | 第40页 |
| ·试剂 | 第40页 |
| ·酶、Marker 及 Buffer | 第40页 |
| 2 试验方法 | 第40-44页 |
| ·总 RNA 的提取及纯化 | 第40-41页 |
| ·提取方法 | 第40-41页 |
| ·RNA 的检测 | 第41页 |
| ·RNA 的纯化 | 第41页 |
| ·四季蜜和立冬本嫁接新梢转录组测序 | 第41-42页 |
| ·四季蜜和立冬本嫁接新梢转录组数据组装及基因功能注释 | 第42-44页 |
| ·转录组数据组装 | 第42页 |
| ·Unigenes 序列的生物信息分析 | 第42-43页 |
| ·Unigenes 的差异表达 | 第43页 |
| ·差异表达基因(DEGs)的 GO 功能分类分析 | 第43-44页 |
| ·DEG pathway 分析 | 第44页 |
| ·差异开花基因的筛选 | 第44页 |
| 3 结果与分析 | 第44-58页 |
| ·Illumina 测序和 reads 组装 | 第44-48页 |
| ·转录组生物信息学分析 | 第48-58页 |
| ·四季蜜和立冬本嫁接新梢转录组 All-unigene 的 cds 的 blast 分析 | 第48-52页 |
| ·All-unigene 的 COG 功能分类分析 | 第52-54页 |
| ·与开花相关的差异表达基因的分析 | 第54-55页 |
| ·与开花相关的差异表达基因的 GO 功能分类分析 | 第55-56页 |
| ·与开花相关的差异表达基因的 KEGG 功能分类分析 | 第56-57页 |
| ·开花相关基因 TFL1、FLC、SVP 的分析 | 第57-58页 |
| 4.讨论 | 第58-61页 |
| 第四章 龙眼成花相关基因 TFL1、FLC 和 SVP cDNA 和基因组序列的克隆 | 第61-85页 |
| 1.试验材料 | 第61-62页 |
| ·植物材料 | 第61页 |
| ·感受态和克隆载体 | 第61页 |
| ·试剂 | 第61页 |
| ·试剂盒、酶以及 Marker | 第61-62页 |
| ·试剂盒 | 第61页 |
| ·酶 | 第61-62页 |
| ·Marker | 第62页 |
| ·引物合成及克隆产物测序 | 第62页 |
| ·仪器设备 | 第62页 |
| 2.试验方法 | 第62-65页 |
| ·四季蜜和立冬本龙眼 RNA 的提取与测定 | 第62-63页 |
| ·RNA 的提取方法 | 第62页 |
| ·RNA 的检测 | 第62-63页 |
| ·cDNA 的合成 | 第63页 |
| ·引物的设计与合成 | 第63-64页 |
| ·目的片段的 PCR 扩增 | 第64页 |
| ·目的片段的回收 | 第64-65页 |
| ·目的片段与载体的连接 | 第65页 |
| ·连接产物的转化与筛选 | 第65页 |
| ·测序与序列分析 | 第65页 |
| 3 结果与分析 | 第65-82页 |
| ·四季蜜和立冬本龙眼 RNA 提取 | 第65-66页 |
| ·SVP 基因的克隆 | 第66-72页 |
| ·SVP-645 基因 cDNA 的克隆 | 第66-70页 |
| ·SVP-2719 基因 cDNA 的克隆 | 第70-71页 |
| ·SVP-2719 氨基酸序列分析及结构域预测 | 第71-72页 |
| ·FLC 基因的 cDNA 克隆 | 第72-75页 |
| ·FLC 结构域预测及氨基酸序列分析 | 第73-74页 |
| ·FLC 基因的生物信息分析 | 第74-75页 |
| ·蛋白质理化性质的预测和分析 | 第74页 |
| ·FLC 蛋白质跨膜区结构的预测 | 第74-75页 |
| ·FLC 蛋白二级结构预测 | 第75页 |
| ·TFL1-6027 基因的克隆 | 第75-79页 |
| ·TFL1-6027 基因的 DNA 克隆 | 第76页 |
| ·TFL1-6027 基因的 cDNA 克隆 | 第76-77页 |
| ·TFL1-6027 的氨基酸序列分析及结构域预测 | 第77-79页 |
| ·TFL1-6475 基因的克隆 | 第79-82页 |
| ·TFL1-6475 基因 DNA 的克隆 | 第79页 |
| ·TFL1-6475 基因 cDNA 的克隆 | 第79-80页 |
| ·TFL1-6475 的氨基酸序列分析及结构域预测 | 第80-82页 |
| 4.讨论 | 第82-85页 |
| 参考文献 | 第85-94页 |
| 附录 | 第94-109页 |
| 致谢 | 第109页 |