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四季蜜龙眼LFY基因启动子克隆及嫁接新梢转录组测序与分析

缩写词第1-10页
摘要第10-12页
Abstract第12-14页
第一章 前言第14-30页
 1.木本果树成花途径研究进展第14-19页
   ·木本果树成花的环境调控第15-16页
     ·水分第15页
     ·温度第15-16页
     ·光照第16页
   ·营养生长与生殖生长第16页
   ·植物生长调节剂对成花的调控第16页
   ·开花过程中的基因调控第16-19页
     ·LFY 基因第17页
     ·TFL 基因第17-18页
     ·FLC 基因第18页
     ·SVP 基因第18-19页
 2 启动子第19-27页
   ·启动子的结构与特征第19-21页
   ·植物启动子的类型极其应用研究第21-24页
     ·组成型启动子第21-22页
     ·组织或器官特异性启动子第22页
     ·诱导型启动子(inducible promoter)第22-23页
     ·双向启动子第23-24页
     ·可变启动子第24页
   ·启动子的克隆方法第24-26页
     ·探针质粒载体筛选法第24-25页
     ·利用 PCR 技术克隆启动子第25-26页
       ·常规 PCR 技术第25页
       ·反向 PCR 技术第25页
       ·Panhandle-PCR 技术第25页
       ·T-linker PCR 技术第25页
       ·TAIL-PCR 技术第25-26页
   ·启动子的功能鉴定第26-27页
     ·转化分析第26页
     ·瞬时表达分析第26-27页
 3 转录组测序第27-30页
   ·高通量测序技术第27页
   ·转录组测序技术第27-28页
   ·转录组测序技术的特点第28页
   ·转录组测序后数据的处理第28-30页
第二章 四季蜜龙眼 LFY 同源基因(LLFY)启动子克隆第30-40页
 1.试验材料第30-31页
   ·植物材料第30页
   ·试剂第30页
   ·感受态和克隆载体第30页
   ·试剂盒、酶以及 Marker第30-31页
     ·试剂盒第30页
     ·酶第30-31页
     ·Marker第31页
   ·引物合成及克隆产物测序第31页
   ·仪器设备第31页
 2.试验方法第31-35页
   ·四季蜜基因组 DNA 的提取与测定第31-32页
     ·DNA 的提取方法第31页
     ·DNA 的检测第31-32页
   ·引物的设计与合成第32页
   ·四季蜜 LLFY 基因启动子的克隆第32-34页
   ·目的片段的回收第34-35页
   ·目的片段与载体的连接第35页
   ·连接产物的转化与筛选第35页
   ·测序与序列分析第35页
 3 结果与分析第35-38页
   ·四季蜜龙眼基因组 DNA 提取第35-36页
   ·四季蜜 LLFY 基因启动子的克隆第36页
   ·四季蜜 LLFY 基因启动子序列分析第36-38页
   ·四季蜜和立冬本 LLFY 基因启动子序列比较第38页
 4.讨论第38-40页
第三章 龙眼转录组测序及分析第40-61页
 1 试验材料第40页
   ·植物材料第40页
   ·试剂第40页
   ·酶、Marker 及 Buffer第40页
 2 试验方法第40-44页
   ·总 RNA 的提取及纯化第40-41页
     ·提取方法第40-41页
     ·RNA 的检测第41页
     ·RNA 的纯化第41页
   ·四季蜜和立冬本嫁接新梢转录组测序第41-42页
   ·四季蜜和立冬本嫁接新梢转录组数据组装及基因功能注释第42-44页
     ·转录组数据组装第42页
     ·Unigenes 序列的生物信息分析第42-43页
     ·Unigenes 的差异表达第43页
     ·差异表达基因(DEGs)的 GO 功能分类分析第43-44页
     ·DEG pathway 分析第44页
     ·差异开花基因的筛选第44页
 3 结果与分析第44-58页
   ·Illumina 测序和 reads 组装第44-48页
   ·转录组生物信息学分析第48-58页
     ·四季蜜和立冬本嫁接新梢转录组 All-unigene 的 cds 的 blast 分析第48-52页
     ·All-unigene 的 COG 功能分类分析第52-54页
     ·与开花相关的差异表达基因的分析第54-55页
     ·与开花相关的差异表达基因的 GO 功能分类分析第55-56页
     ·与开花相关的差异表达基因的 KEGG 功能分类分析第56-57页
     ·开花相关基因 TFL1、FLC、SVP 的分析第57-58页
 4.讨论第58-61页
第四章 龙眼成花相关基因 TFL1、FLC 和 SVP cDNA 和基因组序列的克隆第61-85页
 1.试验材料第61-62页
   ·植物材料第61页
   ·感受态和克隆载体第61页
   ·试剂第61页
   ·试剂盒、酶以及 Marker第61-62页
     ·试剂盒第61页
     ·酶第61-62页
     ·Marker第62页
   ·引物合成及克隆产物测序第62页
   ·仪器设备第62页
 2.试验方法第62-65页
   ·四季蜜和立冬本龙眼 RNA 的提取与测定第62-63页
     ·RNA 的提取方法第62页
     ·RNA 的检测第62-63页
   ·cDNA 的合成第63页
   ·引物的设计与合成第63-64页
   ·目的片段的 PCR 扩增第64页
   ·目的片段的回收第64-65页
   ·目的片段与载体的连接第65页
   ·连接产物的转化与筛选第65页
   ·测序与序列分析第65页
 3 结果与分析第65-82页
   ·四季蜜和立冬本龙眼 RNA 提取第65-66页
   ·SVP 基因的克隆第66-72页
     ·SVP-645 基因 cDNA 的克隆第66-70页
     ·SVP-2719 基因 cDNA 的克隆第70-71页
     ·SVP-2719 氨基酸序列分析及结构域预测第71-72页
   ·FLC 基因的 cDNA 克隆第72-75页
     ·FLC 结构域预测及氨基酸序列分析第73-74页
     ·FLC 基因的生物信息分析第74-75页
       ·蛋白质理化性质的预测和分析第74页
       ·FLC 蛋白质跨膜区结构的预测第74-75页
       ·FLC 蛋白二级结构预测第75页
   ·TFL1-6027 基因的克隆第75-79页
     ·TFL1-6027 基因的 DNA 克隆第76页
     ·TFL1-6027 基因的 cDNA 克隆第76-77页
     ·TFL1-6027 的氨基酸序列分析及结构域预测第77-79页
   ·TFL1-6475 基因的克隆第79-82页
     ·TFL1-6475 基因 DNA 的克隆第79页
     ·TFL1-6475 基因 cDNA 的克隆第79-80页
     ·TFL1-6475 的氨基酸序列分析及结构域预测第80-82页
 4.讨论第82-85页
参考文献第85-94页
附录第94-109页
致谢第109页

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