| 中文摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| 第一章 动物线粒体基因组概述及兔属动物系统演化研究现状 | 第10-22页 |
| ·动物线粒体基因组的概况 | 第10-14页 |
| ·动物线粒体基因组的大小 | 第10-11页 |
| ·动物线粒体基因组结构组成 | 第11-12页 |
| ·线粒体基因组蛋白质编码基因密码子的使用特点 | 第12页 |
| ·线粒体基因组tRNA基因 | 第12-13页 |
| ·线粒体基因组rRNA基因 | 第13页 |
| ·线粒体基因组非编码区 | 第13-14页 |
| ·线粒体基因组DNA在分子系统发育学上的发展 | 第14-15页 |
| ·常见的几种构建分子系统发育树的方法 | 第15-19页 |
| ·距离法 | 第15-18页 |
| ·计算遗传距离的模型 | 第15-16页 |
| ·基于距离法构建系统进化树的方法 | 第16-17页 |
| ·距离法的优点 | 第17-18页 |
| ·最大简约法(maximum parsimonious,MP) | 第18页 |
| ·最大似然法(maximum likehood,ML) | 第18-19页 |
| ·贝叶斯法(Bayesian Inference,BI) | 第19页 |
| ·动物线粒体基因组全序列测定研究方法 | 第19-20页 |
| ·兔属动物现状 | 第20页 |
| ·本研究的意义 | 第20-22页 |
| 第二章 材料与方法 | 第22-29页 |
| ·材料 | 第22-29页 |
| ·样本的采集 | 第22页 |
| ·主要仪器 | 第22页 |
| ·主要试剂及溶液配制 | 第22-24页 |
| ·总DNA的提取 | 第24-25页 |
| ·引物设计和PCR扩增 | 第25-26页 |
| ·PCR产物回收纯化、克隆和测序 | 第26-27页 |
| ·测序结果的拼接 | 第27-28页 |
| ·海南兔线粒体基因组结构分析 | 第28页 |
| ·系统发育分析 | 第28-29页 |
| 第三章 实验结果 | 第29-39页 |
| ·海南兔线粒体基因组序列统计结果 | 第29-30页 |
| ·本研究cyt b基因间序列分歧度 | 第30页 |
| ·海南兔线粒体基因组的蛋白编码基因 | 第30-32页 |
| ·海南兔线粒体基因组重链及基因碱基分析 | 第32-33页 |
| ·海南兔线粒体基因组密码子使用情况 | 第33-35页 |
| ·海南兔线粒体基因组的rRNA和tRNA | 第35页 |
| ·海南兔线粒体基因组中的非编码区 | 第35-38页 |
| ·海南兔线粒体基因组与已公布的兔属线粒体基因组间的对比 | 第38-39页 |
| 第四章 兔属系统演化分析结果 | 第39-42页 |
| ·系统发育树 | 第39-42页 |
| 第五章 讨论 | 第42-46页 |
| ·动物线粒体基因组 | 第42页 |
| ·基因编码区 | 第42-43页 |
| ·兔属的分子系统演化和渐渗杂交 | 第43-46页 |
| 附录 | 第46-54页 |
| 参考文献 | 第54-60页 |
| 附件 | 第60-62页 |
| 致谢 | 第62-63页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第63页 |
