| 中文摘要 | 第1-9页 |
| 综述 | 第9-14页 |
| 第一章 www．estarray．org——生物信息的网络化实践 | 第14-28页 |
| 1． 生物信息网络化数据库现状 | 第14-17页 |
| 1．1 有关国内外生物信息学数据库 | 第14-15页 |
| 1．2 水稻相关数据库 | 第15页 |
| 1．3 目前网站构建主流技术简述 | 第15-17页 |
| 2． 材料和方法 | 第17-21页 |
| 2．1 数据来源 | 第17页 |
| 2．1 软件环境 | 第17页 |
| 2．3 服务器硬件环境 | 第17页 |
| 2．4 其他网络设备 | 第17页 |
| 2．5 局域网内部环境配置 | 第17-19页 |
| 2．6 网站建设 | 第19-21页 |
| 3． 结果和分析 | 第21-28页 |
| 3．1 首页的功能 | 第21-22页 |
| 3．2 Rice ESTs栏目功能 | 第22-24页 |
| 3．3． EST Search | 第24-26页 |
| 3．4． 网站的安全性及维护 | 第26-28页 |
| 第二章 九个植物抗病反应相关基因的RNA表型微阵列分析 | 第28-58页 |
| 1． 材料与方法 | 第28-32页 |
| 1．1 水稻材料 | 第28-29页 |
| 1．2 酶及主要试剂 | 第29页 |
| 1．3 主要试剂配方 | 第29页 |
| 1．4 总RNA的抽提 | 第29页 |
| 1．5 探针的同位素标记 | 第29-30页 |
| 1．5．1 探针选取 | 第29-30页 |
| 1．5．2 探针回收和标记 | 第30页 |
| 1．5．2．1 候选基因PCR扩增与回收 | 第30页 |
| 1．5．2．2 探针标记 | 第30页 |
| 1．6 RNA阵列杂交膜制备 | 第30-31页 |
| 1．7 RNA阵列杂交和数据分析 | 第31-32页 |
| 1．7．1 RNA微阵列杂交 | 第31页 |
| 1．7．2 RNA微阵列杂交结果分析 | 第31-32页 |
| 1．7．2．1 RNA微阵列杂交数据提取 | 第31页 |
| 1．7．2．2 各基因的RNA微阵列表型分析 | 第31页 |
| 1．7．2．3 九个基因RNA微阵列聚类分析 | 第31-32页 |
| 2． 结果与讨论 | 第32-58页 |
| 2．1 RNA阵列数据的可靠性和重现性分析 | 第32-33页 |
| 2．2 单基因RNA阵列杂交结果分析 | 第33-55页 |
| 2．2．1 泛素 | 第33-36页 |
| 2．2．1．1 稻瘟病菌诱导相关表型 | 第33-34页 |
| 2．2．1．2 营养胁迫相关表型 | 第34-35页 |
| 2．2．1．3 激素处理相关表型 | 第35-36页 |
| 2．2．2 S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶 | 第36-38页 |
| 2．2．2．1 稻瘟病菌诱导表型 | 第36-37页 |
| 2．2．2．2 营养胁迫相关表型 | 第37-38页 |
| 2．2．2．3 激素处理相关表型 | 第38页 |
| 2．2．3 磷脂酶C | 第38-41页 |
| 2．2．3．1 稻瘟病菌诱导相关表型 | 第38-39页 |
| 2．2．3．2 营养胁迫相关表型 | 第39-40页 |
| 2．2．3．3 激素处理相关表型 | 第40-41页 |
| 2．2．4 苯丙氨酸解氨酶 | 第41-43页 |
| 2．2．4．1 稻瘟病菌诱导相关表型 | 第41-42页 |
| 2．2．4．2 营养胁迫相关表型 | 第42-43页 |
| 2．2．4．3 激素处理相关表型 | 第43页 |
| 2．2．5 丝裂原活化蛋白激酶 | 第43-46页 |
| 2．2．5．1 稻瘟病菌诱导相关表型 | 第44页 |
| 2．2．5．2 营养胁迫相关表型 | 第44-45页 |
| 2．2．5．3 激素处理相关表型 | 第45-46页 |
| 2．2．6 超氧化物歧化酶 | 第46-48页 |
| 2．2．6．1 稻瘟病菌诱导相关表型 | 第46-47页 |
| 2．2．6．2 营养胁迫相关表型 | 第47-48页 |
| 2．2．6．3 激素处理相关表型 | 第48页 |
| 2．2．7 富含甘氨酸的蛋白 | 第48-51页 |
| 2．2．7．1 稻瘟病菌诱导相关表型 | 第48-49页 |
| 2．2．7．2 营养胁迫相关表型 | 第49-50页 |
| 2．2．7．3 激素处理相关表型 | 第50-51页 |
| 2．2．8 pib | 第51-52页 |
| 2．2．8．1 稻瘟病菌诱导相关表型 | 第51页 |
| 2．2．8．2 营养胁迫相关表型 | 第51-52页 |
| 2．2．8．3 激素处理相关表型 | 第52页 |
| 2．2．9 β-1,3葡聚糖酶 | 第52-55页 |
| 2．2．9．1 稻瘟病菌诱导相关表型 | 第52-53页 |
| 2．2．9．2 营养胁迫相关表型 | 第53-54页 |
| 2．2．9．3 激素处理相关表型 | 第54-55页 |
| 2．3 不同表型的系统聚类分析 | 第55-58页 |
| 参考文献 | 第58-62页 |
| 英文摘要 | 第62-66页 |
| 致谢 | 第66页 |